在福柯的研究方法论上，还有一对重要的概念，那就是空间和时间。传统的线性发展思维方式总要褒扬时间，贬低空间。福柯指出：“空间被看作是死亡的、固定的、非辩证的、不动的。相反，时间代表了富足、丰饶、生命和辩证。对于那些把历史与旧式的进化、生存的连续性、有机发展、意识的进步或者说存在的规划混为一谈的人，对空间术语的使用似乎具有一种反历史的味道。如果我们用空间的术语来谈论历史，这就意味着我们对时间充满敌意。”“注释1”
在社会学的各种流派中，结构功能派重视空间，而冲突论者重视时间。前者似乎代表了一种保守的观点，而后者则代表进步。这就是空间被人忽视了这么长的时间的原因。福柯指出：“从康德以来，哲学家们思考的是时间。黑格尔，柏格森，海德格尔。与此相应，空间遭到贬值，因为它站在阐释、分析、概念、死亡、固定以及惰性的一边。我记得十年前参加过对空间政治问题的讨论，人家告诉我，空间是一种反动的东西，时间才与生命和进步有关。”“注释2”“也许马克思主义，至少是《资本论》和其他具有普遍意义的经济文本并不倾向于进行空间化的分析，因为它赋予时间的因素以特权的地位。”“注释3”
福柯在时间和空间这两个概念中迷恋空间，为此他常常遭到人们的指责，被斥责为冷血的结构功能论者。他对这种指责甚不以为然。他说：“人们常指责我迷恋于这些空间的概念，我确实对它们很迷恋。但是，我认为通过这些概念我确实找到了我所追寻的东西：权力与知识之间的关系。一旦知识能够用地区、领域、移植、移位、换位这样的术语来描述，我们就能够把握知识作为权力的一种形式和播撒权力的效应的过程。”“注释4”
早有人将福柯归入结构功能学派，在重视空间甚于重视时间这一点上，这种评价也许没有大错。但是，我们应看到，福柯一生的研究事业是一种极具个性的事业，他所创造和使用的研究方法也是极具个人特色的。这正是福柯作为一位大师而不是普通的研究工匠的卓尔不群之处。他独创的研究方法决不是结构功能论所能涵盖的，他的研究所涉及的领域、他对事物的分析以及他的研究结果具有极大的革命性和颠覆性，他的著作甚至被参加学生运动的人们奉为圣经。如果福柯还能被称为“保守派”、福柯的理论被视为保守理论的话，恐怕全世界再也找不出一位激进派，再也找不到一种激进的理论了。
“注释1”福柯，第206页。
“注释2”同上书，第153页。
“注释3”同上书，第211页。
“注释4”福柯，第205页。