自然界的无穷奥秘使他心醉神迷。他由此渐渐悟到一个道理。他把世上各种各样生物，依据复杂程度排成一个长串，就可以观察到：随着动物身体构造的复杂，运动方式的增多，生物的智慧也相应增进。同时，分工渐趋专门，神经系统出现了大脑显著了，生物的心灵渐渐能控制环境了。这种从最低级的有机体进步到最高级的有机体，亚里士多德不只作了描述和探讨，还用科学方法作了分类。他把生物分成植物、动物和人，把动物分成有血和无血的两种，继而又细分为属和种。他认为，胎生是最完美的动物，人又是其中最完美的。因为人是具有理性的，这是人不同于其他动物的地方。
有些人讥笑亚里士多德把精力放在观察研究这些大大小小的生物身上，不做思想哲学研究，甚为可惜。因为当时人们把后者看得最为神圣。
亚里士多德回答说：“我讲一个小故事给你们听。有一些陌生人去拜访希克利特斯，看到他正靠着厨房的火炉取暖，他们停住了。希克利特斯说：‘不要怕，请进，这里也有神明。’我们对每一种动物的研究也应持同一态度，没有必要感到羞愧。因为在每一样东西背后，都有其天性及美。很明显，自然界中的一切没有一样是偶然发生的，都是有目的的，为了某种目的造成美的事物。”
亚里士多德的“天生万物必有用”这句话后来又成为传世名言。但他对生物的有些考察和经验可能带着一些主观的臆测，甚至是荒诞不经的，因而经常被人引为趣谈。有一次，他对人们讲述他对欧洲野牛的观察，他说，人们为了吃肉去猎杀野牛，“野牛的自卫是以踢脚或将排泄物排泄至大约8米远的范围来防卫自己。而这些排泄物是如此炙汤，以至能将猎犬的毛都烫掉。”
他的话弓；起人们的哄笑，亚里士多德自己却仍是那么认真和自信。
亚里士多德在自然科学研究上的成就，在当时是无人能与之相比的。他观察、收集有关天文学、气象学、化学、物理学、心理学的种种资料，成为这些学科的创始人和奠基者。他的最重要成就还是在动物学与生物学方面，影响所及，直到二千年后才为新的理论取代。
亚里士多德的父亲曾经做过马其顿国王的医生，国王得知亚里士多德博学多才，就请他来当王子亚历山大的老师。国王想让王子将来也成为高雅的哲学家。
第一次师生见面就很意外。
亚里士多德带着仆人急急忙忙向马其顿王宫赶路，在一个拐弯的地方，突然冲出了一匹白色的高头大马，一个穿白袍的十三四岁的男孩子骑在上面。马见到人扬起前蹄突然停住了，后面仆人的马队也跟了过来。
那个孩子用马鞭一指亚里士多德，说：
“你这个人见到我为什么不让路？”
亚里士多德从容地回答：
“是你的马突然跑过来，怎么反倒说我不让路呢？”
那个孩子生气了，指着亚里士多德说：
“好大的胆子，敢和我顶嘴，来人哪！把他给我抓起来！”
孩子的仆人立刻冲上来，这时，亚里士多德用手一挡，说：
“慢！我是奉马其顿国王的命令来给王子当老师的，谁敢绑我！”
白马上的孩子听了哈哈大笑，说：
“你原来就是亚里士多德啊！我就是亚历山大，来，上我的马，我送你去王宫吧！”
亚里士多德知道这就是他要教的学生后，真是哭笑不得。
亚历山大的性格就像一头未驯服的幼狮，他根本不爱听亚里士多德讲的什么哲学、数学、文学等等知识，他只想骑马、打猎、去征战。亚里士多德拿出最大的耐心来教他，但成效不大。
亚里士多德教学不成，却得到意外的收获。原来，亚历山大也喜欢动物，他安排了数千人为亚里士多德服务，有打猎的，有捕鱼的，有放羊的，有养蜂的，有养鸟的等等。这就为亚里士多德的动物研究提供了极大的帮助。
公元前335年，亚里士多德返回了雅典。他效法柏拉图，也开办了一个学园——吕克昂学园。
吕克昂学园和柏拉图的阿卡德米学园基本相同，只是阿卡德米学园是封闭式的学校，而吕克昂学园是一个开放的教学园地。
亚里士多德把学生分为两部分，一部分上高级班，一部分上普通班。亚里土多德每天上午教高级班，教授哲学、物理学和辩证法等等；下午，他教普通班修辞学，政治学等等课程。
亚里土多德这时已经50岁了，但他的讲演仍然很生动、精彩。他不习惯于坐下来讲课，总是在课堂的廊柱间走来走去。
一次上哲学课，讲到“主体”这个概念，亚里士多德看了看课堂上的一切，桌子、椅子、墙壁……这些都被他举例子举遍了，他一挥手，对学生们说：
“走，我们到校园里去。”
于是，他的学生跟随着他到了校园的林阴路上，他指着一棵树说：
“这棵梧桐树的叶子就是梧桐叶子这个概念的主体。”
“它是绿色的，但是这个绿色离了这叶子就不存在了，可是，叶子离了绿色还是存在的，比如到了冬天叶子变黄了。”
亚里士多德又指了指周围的一些树，说：
“这些松树、槐树、杨树的叶子也是绿的，我们是先看到这一个个的绿叶子的颜色，才把这些颜色统统归结为绿色，这些叶子都是实实在在的本体。我讲的明白了吗？好，现在你们再找一些例子讲讲。”
学生们立刻到树林中，花丛中找到了他们所要的东西——各种颜色的花，他们通过分类弄懂了亚里士多德提出的问题。
亚里士多德高兴地说：
“看来到外面上课收获更大，以后我们常来吧！”
以后，他经常率领他的子弟在林阴道上边散步边上课。所以，他的学派得名“逍遥学派”。
亚里士多德是一个科学研究专家，他把大量的时间投入到了开创性的、第一手的研究中去。但是，他不可能任何研究都自己进行，他也要借助别人的观察和成果。这里面就有一个收集材料的问题。
像前面所说的，亚历山大曾命令数千人为亚里士多德服务，那么他的研究必然有猎人、渔夫、牧人、养蜂人等等提供的材料。
亚里士多德是怎样使用这些材料呢？请看下面的故事。
一次，亚里士多德需要研究鱼类的繁殖，他去问渔夫：
“你看到鱼的交尾吗？”
渔夫回答说：
“没有看到。”
“那么小鱼是怎么产生的呢？”亚里士多德继续问。
“雌鱼生下的鱼子变成的。”
“那么，雄鱼有什么用呢？”
渔夫答不上来了。
亚里士多德经过仔细观察发现，鱼类是交尾的，只是进行得十分快，渔夫没有发现。而且，渔夫不是为了研究鱼类才捕鱼的。
亚里士多德在使用别人提供的材料时，从来都十分谨慎。同时他也训练了一些专职人员，以免发生错误。
亚里士多德还经常参考文字材料，比如，他在进行生物学研究时，就常常引用被他称为“伟大的医生”的希波克拉特斯的研究成果。
亚里士多德还特别重视对材料的积累和整理。他曾说过：
“一个人应当从书本中多做摘录，并按各个题目。分别编类。”
根据这个思想，他收集了158个国家的宪法，整理了雅典每年的悲剧和喜剧的演出记录。后来，他写成了《雅典政体》一书，把雅典民主政体发展的历史说得明明白白。
亚里士多德广博的学问，是他勤奋地收集前人和别人留下的材料，深入地研究，并有所发现才得来的。
亚里士多德在雅典主持吕克昂学园12年，也是他在学术上最有成就的时期。他的大部分重要研究和著作都是在这里完成的。
吕克昂学园有充分的经费，也有丰富的学术资料来源。亚里士多德过去就有大量的资料积累，后来又得到亚历山大大帝的支持。亚历山大东征期间，从更广泛的地区有意识组织大批人力搜集政治、历史、生物、地理等资料，源源不断。地送到雅典吕克昂学园，这对亚里士多德和吕克昂学园所有师生的研究工作具有十分重要的作用。
亚里士多德在吕克昂学园创建了一个相当规模的动物园。这在人类文化史上还是第一个。
他爱好收集、积累书籍资料，在柏拉图学园学习研究时，就已开始从事这方面的工作。他的寓所里总是堆满了各种书籍，他自己则被后人看成历史上第一位图书收藏家。现在，他为学园创建了一所藏书很丰富的图书馆。亚历山大死后，他的部将托勒密在埃及称王，也建立了一所很大的图书馆——亚历山大图书馆，就是依照亚里士多德的模式建立的。
他还为吕克昂学园建立了一个博物馆。
这些文化设施的创建都是亚里士多德对人类文化所作的创造性贡献。
亚里士多德在吕克昂学园就像在科学知识的海洋中游泳，是那样从容自由。他的话多是研究成果，都是带有创始性的。
世界上第一个将哲学当作一门独立的学科，和其它科学区别开来，并且给予很高地位的，是亚里士多德。
政治学的创始人，也是亚里士多德。他对国家起源的阐释，“人天生是政治动物”这样的经典性定义，对于后世都具有极大的影响。在广泛考察了希腊各城邦的政治法律制度及其历史沿革之后，亚里士多德提出了自己的政治理论：主张小国寡民，由贤能的君主来统治，同时又要制定相应的法律，以保证权力不至于过分集中。
逻辑学中著名的“亚里士多德三段论”，被人们推崇为“形式逻辑的核心”。
第一个用科学的观点和方法来阐释美学概念、研究文艺问题的人，是亚里士多德。他在《诗学》中提出文艺的“模仿说”（认为艺术是模仿或表现人类的生命活动或现实世界的），有关悲剧的经典性解释以及古典戏剧中的“三一律”（事件、地点、时间的统一性）等等，对后来的文艺理论和创作都有极为深刻的影响。
他在天体物理学、心理学、生理学、伦理学、修辞学等方面都有创造性的发现和贡献。
亚里士多德是一位科学的巨人。他是在运动不息的世界中不断有所发现和创造的一代宗师。他的知识成果是一个庞大的丰富的科学体系。不但整个古代文明在他的俯视之下，而且对于未来文明的发展也有着巨大推动作用。当时的希腊人已经开始认识到亚里士多德的杰出贡献。
公元前330年，亚里士多德应邀为希腊戴尔菲城撰写名人录。该城每隔四年都要在阿波罗神庙前举行一次运动会，优胜者的事迹将被记载下来。该城为感谢亚里士多德等的工作还特地立碑于神庙内。碑刻称：“他们在此碑中记载着那些菲底安比赛的胜利者以及开始这些竞赛的人们。因此，让亚里士多德及卡利斯山尼斯享受赞美并接受冠冕吧！”
但是，当人们谈到亚里士多德的贡献时，亚里士多德总是说：
“我们身为个体生命，所知有限，但我们每一个人多少都会谈及自然的一些性质，而且从各种可以接触到的成果中，多少可以得到一些知识上的长进。但是，我们不但要对前人的贡献怀着感激之情，即使是对那些观念错误或肤浅的人，我们也要予以感谢。因为他们同样有其贡献，因为他们为我们提供了许多经验与事实。”
黑格尔在《哲学史讲演录》中说：“如果真有所谓人类导师的话，就应该认为亚里士多德是这样一个人。”这一评价很高，也恰当。也有人称亚里士多德为“学问之父”，其含义是指他奠定了逻辑学和生物学基础，是古希腊哲学集大成者，是许多学科奠基人之一。科学发展史告诉人们，一个人能发现某一规律，发明某一技术，已是不可多得的人才；能奠定某学科的基础，可谓大科学家；某一时期、时代某方面的集大成者，更是历史上极少见的人物。亚里士多德独创逻辑学和生物学，集古希腊哲学之大成，其历史地位是同时代人及无数后人所不及的。