“海红旗-16”是中国海军第一种采用垂直发射井发射的中近程舰空导弹，其快速反应能力远高于当前采用旋转发射架的俄制“无风-1”型导弹，无论对付掠海来袭还是高空高速来袭的目标都得心应手。目前在亚丁湾执行护航任务的中国海军“舟山”号护卫舰就配备了32单元的“海红旗-16”垂直发射舰空导弹，红旗16最早用于054A型护卫舰，作战目标为战术飞机、反舰导弹、战术空射型导弹、直升机和无人机。有主要担负舰队防空系统中的近程防御任务，可以在中低空范围内对抗大规模现代武器的空中袭击和导弹攻击。
红旗16有效射程100米-19公里，有效射高10-6000米，单发命中概率0.7～0.98，反应时间5～8秒，弹长2.9米，弹径0.232米，弹重165公斤，战斗部重17公斤、最大飞行速度850米/秒。红旗-16是解放军装备序列中第二种在设计之初就考虑了陆海通用的防空导弹（第一种是红旗-61）。据称其弹体的设计参考了俄制SA-N-12.
导弹采用主动单脉冲雷达制导；由于它使用火阵雷达能同时制导多枚导弹对付不同目标。红旗-16海军型采用垂直发射。该发射系统的外观近似于美国的MK41垂直发射系统，发射形式为“热发射”，即导弹先点火而后冲破发射系统舱盖攻击目标。使用该系统使红旗-16导弹的反应时间和可拦截范围大大增加。红旗16对于中国海军舰队防空网的近程防空能力将得到很大提高，特别是在对付掠海飞行的反舰导弹的抗饱和攻击方面填补中国海军在这方面的差距。