亚马孙河是世界大河之中水量最大、流域面积最广的河流。
亚马孙河流域内，大部分地区年降水量达1500～2000毫米。亚马孙河的水源终年供应充沛，洪水期流量极大。河口年平均流量达12万立方米/秒，每年泄入大西洋的水量有3800立方千米，相当于刚果河的三倍多，约占世界全部河流水量的1/9.在远离河口300多千米的大西洋上，还可以看到亚马孙河的河水。
亚马孙河的河面相当宽广。在一般情况下，上游宽为700米，中游宽约5000米，下游宽约22000米，河口处更宽达80000米。由于亚马孙平原地势低平、河口又呈喇叭状，大西洋的海潮可溯河流入内陆900～1300千米。大潮时，常形成5米高的巨浪，呼啸而上，气势磅礴。
亚马孙河水系具有非常优越的航运条件。它不仅河宽水深，落差很小，而且主要河段上没有急流险滩，并可与各大支流下游直接通航，形成一个庞大的水道系统。3000吨海轮沿干流上溯，可达秘鲁的伊基托斯，7000吨海轮可达马瑙斯。整个水系可供通航的河道总长达2.5万千米。