大高玄殿，皇家道观。坐落于北京故宫筒子河北岸，景山以西，北海以东，是中国仅存的明清两朝御用道观。现存主要建筑自垣墙所开辟的3座琉璃门，护以石栏，因此大高玄殿又俗称“三座门”。
大高玄殿建于嘉靖二十一年（1542年），是明世宗嘉靖皇帝朱厚骢的斋醮（道教法事）之所。
历史上，嘉靖被称为“道士皇帝”。他醉心于炼丹服药，祈求长生，数十年不上朝。为推崇道教，1542年的农历四月，嘉靖建造了大高玄殿，殿前立下马石。神殿建成后，百官斋戒、行香、禁刑屠10日。
就在这一年的10月，皇宫大内发生了“壬寅宫变”。正是这场宫变，让嘉靖彻底沉溺于求仙的幻梦中。嘉靖相信用早晨的露水炼丹能长生，命宫女每天早上采集露水。采露工作非常辛苦，十几个不堪忍受的宫女密谋用黄绫布勒死嘉靖，却因太过紧张，绫布打成了死结，嘉靖大难不死。事后，宫女们被凌迟处死，嘉靖也对冷森的宫城心怀怯意，从此住进了西苑的万寿宫，再不敢回到大内中。
“炉香缥缈高玄殿，宫烛荧煌太乙坛。”嘉靖的宠臣夏言的诗句，描绘了嘉靖与宠臣们在大高玄殿日夜斋醮的情景。在西苑的众多道宫中，大高玄殿地位最尊贵。惟有它供奉着玉皇大帝和三清像（玉清、上清、太清三位道教天尊），嘉靖“有祷必至”。大高玄殿东北的象一宫供奉的“象一君”，就是嘉靖身着道服的金身像，足见其对道术的痴迷。
连大高玄殿院中的松树都曾受到封赏。据《骨董琐记》记载，殿内有“桧一松四，并金时植。嘉靖中，封松指挥使”。
非要将自己所生的皇三子立为太子，叫嘉靖专门到大高玄殿“行香设密誓，御书誓词，缄玉盒中，存贵妃所”。后来，嘉靖还是听了皇后的话，立皇长子为太子，避免了一场争储内乱。但自此之后，他再也没有进入过大高玄殿。
嘉靖去世后不到一月，他修建的多数道宫均被毁弃，只有大高玄殿和光明二殿保留下来。
清代因避康熙皇帝玄烨的名讳而改为大高元殿，后又更名为大高殿。清代同样相信道教的雍正皇帝，于雍正八年（1730年）重修了大高玄殿，乾隆十一年（1746年）、嘉庆二十三年（1818年）再次重修。以后的皇帝不大信奉道教，因此香火日渐衰落。
2010年6月，自1949年起长期被某军事单位占用的大高玄殿移交北京故宫博物院管理。