但克林顿也没有非常高兴，因为突然加入竞选的罗斯·佩罗，在民意测验中领先了克林顿和布什，佩罗也因此开创了一个先例，那就是独立候选人也可以领先两大政党的候选人。
克林顿还有一些自身的问题，例如在越南战争期间逃避兵役，吸食大麻的问题和女性的绯闻以及几起有问题的商业交易。克林顿的这些问题，虽然没有阻止克林顿当选总统，却在保守派人士中间引起了反克林顿浪潮。
但最终把克林顿推上总统之位的还是他对经济问题的重视，因为当时美国经济陷入低谷，克林顿的竞选总部曾经张贴出一句非常著名的标语：“笨蛋，问题是经济！”
克林顿对经济问题的重视，使他赢得了广大穷人、中产阶级的支持，最后，他以370票对168票击败布什，赢得了大选。
1993年1月20日，克林顿在华盛顿宣誓就职。上任伊始，克林顿就和副总统戈尔合著了《人民第一》的施政纲领，开始了“重建美国，实现美国梦”的8年总统历程。
克林顿的总统任期内，最为后人津津乐道的就是他的经济成就。拜互联网科技成熟之赐，一个崭新的科技产业在1996年开始发展起来，并于1998年进入白热状态。互联网革命创造了一个带有巨大产值的新产业，连带创造了高薪的工作机会，带动了经济的运转。
除了有互联网科技兴起的这个大背景之外，克林顿也采取了一些经济刺激计划。上任伊始，他就挥舞起了贸易大棒，企图通过高额关税来限制进口，克林顿此举还差点引起了一场世界范围内的贸易大战。
同时，克林顿总统还在1993年2月提出了一揽子经济计划和短期经济刺激计划；实施美元贬值和日元升值的办法，抑制日本经济复苏，促进美国增加出口。
通过克林顿总统的不懈努力，在克林顿入主白宫的8年内，美国国内生产总值的增长非常强劲，年均涨幅高达3.5%，高于吉米·卡特和里根两人在任时的水平。而且在克林顿的任期内，美国就业形势一片大好，新增加的就业机会远远多于其他一些总统。
克林顿凭着自己手下一个最小规模的政府机构，在削减财政赤字方面非常出色，他也使美国政府自杜鲁门总统以来，首次真正地出现了财政盈余的局面。
直到今天，许多美国民众乃至总统，还常常怀念克林顿时期的美国经济形势。现任总统奥巴马在一次演讲中说：“当克林顿执政的时候，家庭平均收入上涨到了7500美元，提供了2200万就业岗位，我们应该熟悉这段历史……我们需要像90年代一样，提供上百万新的就业机会，我们要做到90年代的保证大家的收入上升而不是下降。我们应该像90年代一个叫比尔·克林顿的人做的一样，将大家的利益摆在第一位。”
除了在经济领域做出了一些成绩之外，克林顿总统在医疗保健制度、奢侈税、教育、让同性恋在军队中公开化等方面，也都曾经做过一些改革尝试。不过这些尝试的效果都不是非常明显。
例如奢侈税的开征原意是要向富人征税，结果却事与愿违，导致皮草、游艇等高价商品销售下跌，伤害了中产阶级销售员的收入。
再例如在军队公开同性恋的改革中，克林顿的总统令受到军方的强烈反对，推行不易，最后只好以“不问不说”的折中方案草草收尾。