战胜了十二只年轻力壮的猴子失去了一根手指后，机灵终于得到了轻盈。两猴配对不久，轻盈就揣上了猴崽子，机灵很是高兴，整天帮轻盈干这干那，又给她梳毛搔痒，照顾得无微不至。想到自己很快就要当猴爸爸了，机灵梦里都要笑醒过来。
可是待到猴崽子一降生，机灵和轻盈都傻了眼——他们生出的不是一只猴子，而是一个小怪物。
那怪物浑身光溜溜的没有毛，面目手脚也跟爹妈长得大不一样，真是丑死了。依着机灵，就要把那小怪物偷偷弄出去扔掉，可是就在他把怪物装进纸箱要出屋的那一刻，轻盈却猛扑过去抱住了孩子——孩子再丑也是娘身上掉下的肉啊！
尽管夫妻俩严格保密，但他们家生了小怪物的消息还是不胫而走，不但吸引了许多猴来家里看新鲜，还招来大批猴记者。小怪物的丑陋形象很快出现在电视报纸上，于是地球猴都知道了这件事，有人害怕这真是什么妖怪。一些猴类学家赶到机灵家，对小怪物进行一番研究后宣布，那孩子并不是什么怪物，而是一个人！可是两只猴子为什么能生出人来呢？科学家解释说，这是一种非常罕见的返祖现象！
知道孩子不是妖怪，轻盈越发不肯放弃孩子了，并给他取名叫丑丑。俗话说娘不嫌儿丑，这话一点没错，丑丑虽然丑陋无比，可轻盈还是把他当成了心肝宝贝，不觉丑丑也就长到了五六岁。这天轻盈出去到街上采购，回来突然不见了丑丑。因为怕丑丑受歧视，又怕丑丑吓坏了幼猴，所以平时轻盈轻易不肯让孩子出门半步，丑丑也一向很听话，可是今天轻盈却怎么也找不到丑丑了。
正当轻盈为找不到丑丑而心急如焚的时候，千里之外的一个城市里却出现了这样一条宣传海报：大家都知道，猴子是由人进化而来的……现在世界上空前绝后绝无仅有的一个人来到了你身边，你想错过这次独一无二的机会吗？
原来丑丑的爸爸机灵背着轻盈，把这个让他讨厌和蒙羞的孩子卖给了一个商猴。商猴带着丑丑到各大城市进行巡展。丑丑被装在一个特制的笼子里，想看他的猴都要花高价钱买票观看，想摸摸他要买双份票，就是这样，来看丑丑的猴仍是络绎不绝，有不少猴子为了一睹老祖先的丑样子，都是半夜起来排队的，那个商猴靠着丑丑很快挤身大富豪行列。
不过由于终日奔波，更加上惊恐羞辱，六岁的丑丑在不到一年的时间里已经瘦成了皮包骨，身染多种怪病，商猴怕他烂在手里，便低价出手把丑丑卖给了一个马戏团。马戏团经过一段时间的调养医治，丑丑竟然奇迹般地恢复了，而且长高长胖了不少。于是马戏团对丑丑进行严酷的训练。丑丑不知挨了多少鞭子，受了多少打骂，总算学会了像猴子一样爬树翻跟头，还有抓耳挠腮做鬼脸。于是马戏团又开始带着丑丑做巡回演出。
这一来，丑丑受的苦比在那只商猴手里受的苦和罪还多了许多。不到二年，丑丑就给累垮了，有次表演人上竿时摔下来落得腿断胳膊折。马戏团不愿白养他，便把丑丑送给了猴国动物园，马戏团团长因此成为猴国动物园终身名誉园长。
得到了丑丑，猴国动物园如获至宝，园中不惜一切代价保住了丑丑的命，还治好了他的伤，然后为丑丑建造了一个高级园笼，从此之后丑丑不用再卖力地表演了，也不会挨打受骂，他只要让游猴们尽情观赏就行了。按说丑丑应该感到幸福多了，但是无论园中对他多好，他始终还是赚钱的工具，无论生活多么轻松，他始终供是猴类观赏的珍惜动物。丑丑多想能和那些小猴们一样在笼子外面自由地打闹嬉戏乱叫乱唱啊！丑丑多想变成一只猴子啊！
在来观赏的猴子们中，丑丑发现有一个母猴每月总要来看望自己一次，每次都会给自己带来许多好吃的，然后就常常痴痴地望着他。丑丑吱吱呀呀用猴语和她说话她也不应，以后丑丑也就不理不睬随她去了。突然有一晚，园长带着那只母猴来到了丑丑的笼子里——原来那只母猴给园中捐了很多钱，她唯一的要求就是想和丑丑单独呆半天。动物园无论如何不肯让母猴把丑丑这只最珍稀的动物带离动物园，最后只同意让她到笼子里和丑丑呆上几个小时。
那母猴进了笼子，依然不和丑丑说话，只是痴痴地望着他还情不自禁地要拥抱他，可是丑丑却躲开了。那母猴骂了声“臭人”，就转过去跟笼外的管理猴说她要出去，说她再也不想见到那个人了。管理猴打开锁，母猴走到门口，拿出只香烟自己叼上一根，又给了管理猴一只。谁知那管理猴抽了几口就迷昏过去了。母猴赶紧把他拖进笼子里，然后从包里掏出一件衣服叫丑丑换上。丑丑不知怎么回事，那母猴急切地说：“快换上，我带你逃走！”丑丑换上了那件衣服后，就变成了一只猴子——原来这是母猴比着丑丑的身体缝制的伪装，乍一看上去，丑丑就跟真猴子一般。
母猴带着丑丑逃到了一片丛林中，丛林中停有一架小型飞船。
来到了飞船下面，母猴对丑丑说：“丑丑，我的孩子，我是你的亲娘啊！”
“啊——亲娘？！”丑丑仔细看着，想着，幼年的情景终于在脑海中模模糊糊浮现出来，于是他叫了声娘，扑进母猴怀里放声大哭起来，他边哭边说：“娘，娘，你是一只猴，我爹是只猴，可我为什么是个人啊！你们不该生下我啊，不该……”
“孩子，你受苦了，都怪娘，怪娘啊……”那只叫轻盈的母猴紧紧抱着丑丑伤痛欲绝。
正哭着飞船中走下一位年老雄猴。他催促丑丑赶快上船，否则怕要被抓回去。丑丑问娘要送自己到哪里去，轻盈告诉他，她已把他托付给孙悟空教授了，孙教授要到遥远M求星去，那上面曾有猴类老祖先人类建造的一个基地，也就是说那里也许还有人类。丑丑叫娘跟自己一起走，轻盈摇摇头说：“不，娘是一只猴子，只能和猴子在一起，而你是一个人，你生错了地方，地球不是你的家，娘每天为你祈祷，祝福孩子能找到你的同类……”正说着，却听不远处已有猴子追了过来，轻盈一狠心硬是把丑丑推上了飞船。
飞船以超光速的状态无声地行驶在茫茫宇宙间，在寂寞的旅途中，丑丑了解到，孙悟空教授是一位一流的生物学家，可是因为不愿同要求他对猴类基因进行改造的当权者合作，结果他们以“考察”为名将孙悟空驱逐出地球。孙教授告诉丑丑，他们到达M星球最短也许要三百年的时间。
“啊，那我们不是都不能活着到达了目的地了吗？”丑丑很是丧气。孙教授笑道：“因为我们几乎是同时间同步赛跑，所以我们并不会老去！”丑丑这才放了心，他期盼着M星球真能有人类存在。
经过漫长的旅行，孙悟空和丑丑终于到达了M星球。可是令丑丑万分失望的是，这里的基地还在，但是却找不到一个人，甚至一只猴也看不到。所幸人类建造的基地还在完好无损地工作着，于是孙悟空和丑丑便在基地里安顿下来。孙悟空整天像人一样不是思考问题就是搞研究，而丑丑则像一只猴子般整天到处乱窜。
有一天，丑丑在基地的一个隐秘角落发现了一本书。丑丑也识得几个猴文，但那书上的文字他却是一个也认不得。丑丑把书拿给孙教授，让他给自己讲讲这本书都写了什么。孙悟空接过书看看说：“这不是猴文，而是人类的文字！”丑丑很是激动，可又半信半疑，猴教授告诉他，猴文是抻胳膊蹬腿无规无矩，而这些字方方正正，肯定是人类的。
孙教授不愧是科学猴，没有几天，他就掌握了人类文字的特点，并很快破译了那本书。书中主要是记述了人类变成猴类的起因。原来当初人类为使自己头脑变得更发达，外貌变得更漂亮，身体变得更强壮，于是就研制成功一种可以改变基因药物，叫全部青壮年男女吃下去，结果导致基因变异，生下的孩子都成了猴子……丑丑听完后，黯然无语。孙教授则叹了口气说：“什么事都有自己的规律，人为的改变有时就会铸成大错！”
丑丑和孙悟空相依为命，过了不知多久，孙悟空终于病倒了。孙教授知道自己的生命不会支撑多久了，便把丑丑叫到跟前说：“我早就知道基地出现了故障，很快就不适合生命居住了，所以我计划近期带你回地球，现在看来，我怕是不能回去了……”丑丑哭了，在M星球的这些年，他非常想念地球，地球猴虽然伤害了他，可那里毕竟是他的家啊！多少次丑丑遥望夜空，想象着那颗蓝色星球的迷人风姿；多少次在梦里，丑丑又回到了地球……可是现在当真要回去了，他却又害怕了——他实在不想回到那受尽屈辱玩弄的过去。
孙悟空看出丑丑的心思，他把一些药要给了丑丑，他说这是他最近研制成功的，吃了这种药，丑丑就可以由一个人变成一只猴子。
“这是真的吗孙教授？”丑丑欣喜若狂。
孙悟空点点头说：“这是我专为你研制的！”
丑丑马上开始服用，服用不久，他的身体就出现了变化，不但长出了毛，而且猴子的特征越来越明显。可是还没等丑丑完全变成一只猴子，孙悟空就进入昏迷状态，丑丑一天也呆不下去了，于是他把孙教授搬上飞船，按着孙教授传授的驾驶技术向地球驶去。
经过漫长的行程，飞船终于在地球上降落了。
但是当已完全是副猴子模样的丑丑走出船舱后他却大吃一惊——纷纷围拢上来的竟然全都是人类，却看不到一只猴子——猴子们已经重踏祖先覆辙，胡乱改变基因，结果又一次引起基因突变，于是地球上的猴子渐渐消亡了，人类重新掌握了地球！
如果是在逃离地球之前发生这件事，对丑丑来说无疑是天大的好事，可是现在面对这个事实丑丑却欲哭无泪——在以前那个猴子世界里，他是唯一的一个人，如今人类占领了地球，他又成了唯一的一只猴子……
丑丑很清楚等待他的将是什么样的命运，他望着向他涌来的人群，突然无比悲哀地大笑起来……