倭寇的入侵永乐至宣德年间的倭寇与洪武年间相比略有收敛。
现将其主要入侵的情况按地域分别叙述如下：
（一）辽东、山东倭患
永乐四年（1406），倭寇袭破宁海卫，杀掠甚惨，宁海卫指挥赵铭以失机被刑。与此同时，倭寇又犯成山卫，劫掠白峰头、罗山寨。犯大嵩卫，在草岛嘴一带劫掠。寇鳌山卫，焚掠半山寨、阴岛、张家庄，进犯于家庄寨，百户王黼、李茂战死。倭寇入桃花闸寨，郡城、沙门岛一带被其抄掠殆尽，百户周盘战死。此时，总督海运的平江伯陈瑄正率舟师自天津卫返回京师南京，“会倭寇沙门岛。瑄追击至金州白山岛，焚其舟殆尽”。
永乐九年（1411），倭寇犯辽东，杀掠边民。
十七年（1419）六月，倭寇侵犯辽东金州卫东之望海埚。
永乐年间倭寇入侵辽东、山东地区的次数不多，但规模较大，每次入侵的人数较多。这一特点大体与洪武二十二年后的情况相似。永乐十四年（1416），在靖海卫杨村岛停泊的倭船一次就达32艘。十七年（1419），金山卫发现倭船90余艘。望海埚之役，仅斩杀倭寇就达千余人。
宣德年间（1426～1435），辽东、山东地区，基本没有倭患发生。
（二）南直隶倭患
永乐二年（1404），倭寇入犯苏松沿海。
七年（1409）正月，倭寇进犯东海千户所，并盘据在鹰游山，时进时退。
十三年（1415），倭寇劫掠内洋沿海府镇。
十四年（1416）五月，金山（州）卫（驻今辽宁大连金县金州镇）上奏说：“有倭船三十余艘，倭寇约三千余，在海往来。”朝廷令辽东总兵官都督刘江，及各都司沿海卫所，随时加强警惕，相机捕捉倭寇。
十六年（1418）五月，金山卫奏，有倭船百余艘，七干余人，在沿海一带攻城劫掠，突入卫所。指挥侯瑞率兵与倭展开巷战，大败之，追焚其舟。朝廷海道捕倭都指挥谷祥、张翥，以兵策应。又令各卫所固守城池，勿轻出战，若有机可乘，亦不可失，务出万全。同时令福建、山东、广东、辽东各都司，及总兵官都督刘江，督沿海各卫，严兵防守。
（三）浙江倭患
永乐二年（1404），对马、台岐等岛的倭寇劫掠穿山所，百户马兴战死。同时，大谢、桃渚、赤坎、胡守巷诸处，也遭到倭寇的焚掠。
九年（1411），倭寇掠台州、松门、温州、沙园、嘉兴、乍浦。
十一年（1413）正月，倭贼三千余人，寇掠昌国卫爵溪千户所，攻城。守城军民奋起抵抗，矢石如雨，贼伤甚众，遂退去。至楚门千户所，备倭指挥佥事周荣，率兵追击，倭贼被杀及溺死者无以数计，浙江都司将所缴获的器械送至京师报功。
十五年（1417）六月，倭寇犯浙江金乡卫海域，奉命出使西洋诸番的宦官张谦等败之。
二十年（1422），倭寇在浙东温州一带寇掠，被朱亮祖击败。《浙江通志》记述说：“复寇浙东，为朱亮祖破之于温州，徐忠破之于桃渚，斩馘献俘，稍知敛戢云。”
二十二年（1424），倭犯象山，杀县僚宋真、教谕蔡海。
洪熙元年（1425）五月二十日，倭寇自蚶岙、亭屿二港入攻桃诸千户所城，官军御之，众寡不敌，城陷。千户徐忠、李海率兵力战，擒贼3人，斩首10级，贼被伤乃走。
忠、海皆被伤。贼出洋，又被明军生擒3人，斩首7级。
明军还用飞石碎贼1舟，舟中贼尽溺死。遇夜风雨，贼溃去。
（四）福建倭患
永乐年间，福建倭患较少，仅见一例。据《福建通志》记载：永乐八年（1410）九月，倭寇犯福州。《明太宗实录》中没有这次倭患的记载，但有福建监察御史李素在十一月劾福建都指挥使童俊不谨边防，致使倭寇进犯福州等地的记载。《明太宗实录》记述说：“巡按福建监察御史李素，劾启福建都指挥童俊不谨边防，遣幼弱指挥彭震，巡海防倭，军无纪律。倭寇攻破大金；定海二千户所、福州罗源等县，杀伤军民，劫掠人口及军器、粮储。俊不遣兵救援。贼遂乘势攻围平海卫城池，指挥王儁督战，百户缪真等战死。自辰至戌，贼始退散。彭震亦不救援。
定海千户所领兵百户金旺等，及福州右卫千户王朝用等，遇贼先遁，致贼杀伤官军。及俊亲领兵赴敌，又逗遛不进，纵贼出境。俊受任方隅，玩寇偷安，委用非人，失律丧师。震及朝用等厥罪惟均，宜正典刑，以警偷懦。皇太子曰：‘国家置守将，所以御侮安民，而乃纵贼如此，罪不可容。’命法司鞫之。”宣德四年（1429），倭寇自福建镇海卫（在今福建龙海东南）古雷巡检司登岸“攻围城池，劫伤人民”。
宣德五年（1430），倭寇又在福建漳州府龙溪县登岸，杀人掠财。
（五）广东倭患
永乐七年（1409）十月，倭寇陷廉州，民皆逃匿。广州府学教授王翰，临危不惧，整衣端坐于明伦堂。倭寇至，王翰骂声不绝，不为所屈，被倭寇杀害。
八年（1410）十二月，“倭贼寇廉州”。
九年（1411）正月，倭贼攻陷昌化。
十九年（1421）正月，广东巡海副总兵指挥李珪，在潮州靖海遇到倭贼，展开激战，杀败倭贼，生擒15人，斩首5级，将所缴获的器械悉数送往北京。
宣德元年（1426），通倭奸民刘秀引导倭寇入潮州，威胁各村，以高于市价数倍的价格强迫贸易，名曰“放苏”。如果乡民不同意，则肆意剽掠。刘秀引倭寇至饶平上底乡，遭到耆民陈彝的拒绝，“倭即操戈相向，乡民皆避于莲花、鲤鱼二山寨”。陈彝说：“此贼得志，吾乡危矣。”遂统众乡民下山，殊死决战，将倭寇头目击杀，倭寇遂遁去。
五年（1430），倭寇在广东海阳县碧洲村登岸，劫掠居民。都司、布政司都认为，潮州卫巡捕指挥同知郑复等与黄冈巡检不能有效防御倭寇，应依法治罪。宣德皇帝让有关部门姑记其罪，如再有过失，严惩不贷。
八年（1433），倭寇犯儋州昌化，指挥高升率兵抵御。
可以明显地看出两点：第一，倭寇入侵洪武年间有所收敛。从永乐元年（1403）至宣德十年（1435）
的33年中，倭寇共入侵34次，比洪武时31年的44次平均每三年就减少1次。之所以出现这种情况主要原因有三：一是日本政局发生了变化，南北朝分裂局面结束，削弱了倭寇产生的社会基础；二是明朝和日本建立了正常的朝贡贸易关系，日本实行对倭寇的取缔政策；三是明朝海防力量增强，给入侵的倭寇以沉重的打击。这些我们将在第五节里详谈。日人藤家礼之助说：“这种前期的倭寇之所以到了十五世纪一度趋向结束，可以举出以下原因：（一）为了顺利进行日明交流，足利幕府应明的请求，在一定程度上对倭寇进行了取缔。（二）再加上大陆和半岛海岸的防卫森严。（三）在辽东半岛的望海埚，倭寇的船队受到了明水军的毁灭性的打击（1419年）；同年，倭寇主要基地之一的对马，又受到了朝鲜的大批远征军的反袭击（应永的外寇）等。”诚如是言。
第二，倭寇的入侵以浙江最为严重。这如我们前述，主要是因为倭寇航海入侵浙江最为方便。
三、正统至正德年间倭寇的入侵正统至正德年间，倭寇的侵扰较洪武至宣德年间大为减少。倭寇在中国沿海一带的劫掠活动有所收敛。现将主要入侵情况按地区分列于后：
（一）辽东、山东、南直隶地区的倭患正统五年（1440），倭寇在登州登岸，劫掠居民。
正统八年（1443）六月，倭寇进犯南直隶平湖县，百户徐荣战死。倭寇大掠而去。
（二）浙江倭祸
正统四年（1439）五月初一日，倭贼在浙江沿海登岸，进犯桃渚千户所。千户穆晟，防守不力，损失惨重。
同月，“倭船四十余艘，夜人大嵩港，袭破所城。转寇昌国，城亦陷。时备倭等官，以失机被刑者三十六人。
惟爵谿所官兵擒获一贼首，名毕善庆，诛之”。
正统十四年（1449）四月，浙江温州府平阳县，遭到来自福建的倭寇的流劫，蒲门千户所遭到围攻，守备指挥吕真等率官军将敌击退。
景泰六年（1455），倭寇进犯健跳，官军据城抵御，倭寇不得入。
景泰年间，倭人入贡还国，所过之地，强索民财，甚至持刀杀人，强取豪夺。
成化二年（1466），倭寇假称入贡，攻破大嵩诸处。
官兵因潮落沙浅，夜围其舟。倭寇将灯挂在樯上，并不移动。待潮涨时把灯悬挂在篱上，篱皆插入沙中，以此来疑惑官军，并乘潮遁去。官军见灯不动，以为倭寇未退，结果坐失歼敌良机。
成化十五年（1479），倭寇两次进犯乍浦。
（三）福建倭患
正统三年（1438），福建发生倭患，福建都司指挥佥事邓安未能及时赴援，巡按御史请治邓安之罪，英宗准其所请。
景泰四年（1453）二月，倭寇在清湾巡检司登岸，杀伤巡检叶旺，并攻进城内，劫掠财货。当时，备倭都指挥佥事杨海、王玉都回家未在岗位，无法指挥官军抵御，致使清湾巡检司遭受了重大损失。
（四）广东倭患
景泰三年（1452），海盗勾结倭寇劫掠海丰、新会，镇守广东左监丞阮能、左副总兵董兴，令都指挥佥事杜信前往追剿，杜信在交战中被杀。
天顺二年（1458）二月，海寇进犯宁川守御千户所。
副总兵都督同知翁信、总督备倭都指挥张通等，未能严督各卫所守哨，致使倭贼劫掠宁州守御千户所，杀人掠财。
巡按广东监察御史吕益奏闻，令翁信等戴罪剿贼。
天顺二年三月，海盗勾结倭寇400余人，犯香山守御千户所，烧毁备边大船。
成化二年（1466），倭寇进犯琼州澄迈海岸，备倭百户项钦战死。
弘治四年（1491），东路指挥崔毕等巡海，擒获倭寇坤喇、谢提等男女百余人。
弘治六年（1493），倭寇劫掠陵水南岗，杀人放火，副使翟俊被究问，指挥千百户石英等降级有差。
弘治十二年（1499），倭寇在儋州登岸，指挥周远擒获吴球等18人，并缴获船只、器械一宗。
正德二年（1507），海盗朱秉英勾结倭寇，劫掠大埔县乡村，烧毁神泉市。
正德年间，广东雷州倭患尤甚，倭寇和海盗经常入港劫掠。而备倭者怯弱，致使倭寇气焰更加嚣张。雷州卫指挥同知张熹，对此痛心疾首。他舍去战舰，坐民船引诱倭寇，倭寇果然来抢劫，张熹与之决战，获胜，夺回两只小船。张熹恃勇复追倭寇，至牛村港，遭到夹击，矢绝，力战而死。
正德八年（1513），倭寇在琼州近海劫掠，副使詹玺遣指挥徐爵督千百户杜俨等，“追至澄迈东水，遇风舟覆，百户王隆溺死”。
正德十二年（1517），“倭掠澄迈临高，指挥徐爵督军追至白浦洋，大战，贼败，溺死无算”。
广东沿海除倭患外，自正德八年（1513）始，还遭到佛郎机人的骚扰。嘉靖四十年刊本《广东通志》记载说：
“佛郎机夷人，不知何许种落，至是假入贡为名，举大铳如雷抵澳，郡城震骇。后谋据东南头，甚至掠买小儿炙食之，其淫毒古所未有也。”两广总督陈金，担心佛郎机人与倭寇勾结，对其保持警惕。直到嘉靖元年（1522）的西草湾之战后，佛郎机人才被逐出广东。
所列不够完全，但从此表基本可以看出倭寇正统到正德年间入侵的总括情况。
第一，我们可以看到从正统元年（1436）到正德十六年（1521）的86年间倭寇共。入侵22次，平均近4年才有1次，表明倭寇是比较收敛的。其原因一是中日维系着朝贡的贸易关系，一是明廷建立了防范较为严密的海防。
第二，从上所列表还可以看出，正统至正德年间倭寇侵犯最严重的地区是广东，几乎占到入侵总数的一半。
之所以如此，其重要原因是广东有海盗的勾引。从我们上列倭寇入侵情况就可看出这点。广东环海岛屿与港澳为海盗提供了便利条件。《粤大记》记述广东海盗时说：
“海寇为吾粤患，自古记之矣。考之《汉书》，安帝永初三年秋七月，海贼张伯路等寇略沿边九郡，遣侍御史庞雄讨破之，此用兵靖海寇之始。自后时常出没，唐天宝中，有吴令光之乱，宋绍兴中，有黎盛之乱，旋为官军破灭，莫究其颠末。已入我皇明，申饬海防綦详且密，而海波沸扬，鲸鲵啸聚，旋讨旋发，未有晏然享数十年之安者。”。
洪武初年，海贼李夫人、钟万户、徐仙姑，多次在海晏、下川、大儋、文特等地劫掠，广阳指挥杨景于洪武六年（1373）率军讨平。与此同时，在徐闻县也有海盗船出没行劫。之后，洪武十四年（1381），海阳县三饶贼首饶隆作乱；二十年（1387），海盗周三作乱，寇程乡县；永乐七年（1409）四月，“海贼阮瑶寇劫长塾、林虚二巡司，焚廨舍，毁寨栅而去”等。
广东沿海海盗的形成有其历史的原因。沿海粤人自古以来，擅长造船与航海，在江海中从事经济活动，且“粤人之俗，好相攻击”。秦统一后，南攻百越，许多人遁入海中，长年驾船生活在江海上，后来，他们适应了水上生活，以船为家，世世相传，被称为“蜑家”。宋人周去非在《岭外代答》中叙述蜑民的生活说：“以舟为室，视水如陆，浮生江海者，蜑也……蛋之浮生，似若浩荡，莫能驯者。然亦各有统属，各有界分，各有役于官，以是知无逃乎天地之间。”历代统治者都对其歧视和凌辱，视其为非人，故意将“蜑”改为“蛋”。清人邱炜萲在《菽园赘谭》中说：“蛋字，字书所无，俗以呼禽鸟、介族之卵，音读如但。粤人又以呼渔户，男为蛋家佬，女为蛋家婆，是以称卵者称人也。何其字哉？抑知南海本有蛋户之称，一作蜑，坛上声。昔人尝谓南海蜑户，以舟楫为家，采海物为生，即指此。不知何时误蜑为蛋，且以蛋为卵，遂使渔人横被恶名耳。”明朝建立后，广东海域仍有大批蛋户。
这些蛋户的存在，为海盗提供了良好的生存环境。
洪武二十四年（1391）五月，指挥同知花茂上言：“广州地方，若东、香山等县，逋逃蛋户附居海岛，遇官军则称捕鱼，遇番贼则同为寇，不时出没，劫掠人民，殊难管辖，请徙其人为兵，庶革前患。”广东海盗与倭寇在劫掠财货上是一致的，因此二者易于结合。滨海顽民与倭寇合流，这正是广东倭患严重的一个重要因素。