红星二场的种子工作经历了三个发展时期：1953～1961年是以粮代种时期，生产的粮食经过清粮机去掉破碎粒和杂质后留作种用。1962～1982年是“自繁、自育、自留、自用”时期，建立留种田，建立三级留种制度，通过穗选、片选，按规定种植留种。通过单株选择在一级留种田中繁育，提供二级留种田用种，在二级留种田内进行去杂去劣，供三级留种田用种，三级留种田供生产用种。对种子田实行“六满足、四固定”（在人力、物力、机力、水肥、农药、优先满足；固定人员管理、定种子田、定措施、定任务）。红星二场种子田生产情况。
1982～2001年，是“种子生产专业化、品种布局区域化、种子加工机械化、种子质量标准化、全场统一供种”时期。
1983年，红星二场在农科所建立良种繁育基地，划拨试验地140亩，经费2.3万元，配备科技人员2人，试验工人15人，承担全场包括杂交育种在内的引种、品比、良繁、复壮和试验，示范各类农艺新措施、新技术的任务，重点工作是春小麦的良种繁育。红星二场长期坚持三圃制，每年种植株行圃0.5亩，株系圃0.5亩，原原种圃3亩，原种田69亩，年提供优质种子2.3万～2.6万公斤。红星二场三连为种子连，固定种子田1500亩，年生产一级良种和二级良种各30万公斤。
1984～1990年7年间，红星二场向全疆各地提供春小麦新春2号良种350万公斤，直接经济效益15万元，并荣获自治区春小麦良种推广奖。
1985年，红星二场建立种子检验制度，种子质量检验室配备有两台恒温箱和各种检验器具，对农场各类种子进行质量鉴定。收获前深入田间做好纯度鉴定。不符合质量标准的种子田，取消作种子资格。对种子田实行“五净”（种子田净、收获机净、场园净、仓库净、麻袋净）、“六单”（单播、单收、单运、单打、单晒、单藏）、“三不”（种子不经田间鉴定合格不留种、种子不经去杂不上场、种子不经精选不入仓）。农场配备2台选种机供种子入库存前精选，质检员逐袋检查合格方可入库存。每年红星二场检验的种子都在37万公斤，占全场用种的95%，达到种子质量标准化。红星二场种子工作由生产科设专人管理。凡是生产自繁、引进、调出的各种原种、良种，由生产科统一管理。做到统一计划、统一留种、统一引调、统一贮藏、统一供种，实现了大田用种区域化、良种化。
1998年，红星二场实现了种子加工机械化，建立了棉种加工厂，棉种加工采用过量式稀硫酸脱绒工艺，产品质量高于国家标准。发芽率＞80%，良种纯度＞95%。1998～2001年共生产棉种2644.8吨，其中对外加工1091吨。