由于各种复杂的原因，牛顿在50岁的时候，决定告别科学，寻求另一条发展之路。牛顿当时仍然很穷。他的前半生的确相当荣耀，但科学成就没有带给他多少财富。在当议员的时候，他耳闻目睹了伦敦那令人眼花缭乱的生活，牛顿感到自己是那么寒酸，他很自卑。此后，他开始更多地考虑到自己的地位和经济问题。
他把自己的真实想法告诉了朋友们。好心的朋友们积极地行动起来。找一个适合牛顿身份的职位还真不容易。热心的朋友仍竭尽全力，为他四处打探，几个月下来，仍没有任何好消息。
牛顿为此很沮丧，终日闷闷不乐，而且经常无来由地发脾气，弄得周围的人莫名其妙。
直到1696年，机会来了，牛顿的生活发生了翻天覆地的变化，他由一位躲在书斋里的学者摇身一变，成为了官场上的风云人物。
蒙塔古是牛顿曾教过的学生，他毕业后选择了从政，一路走得顺风如意，17世纪90年代末，他对英国的政务有着重要的影响。他与牛顿的私人交情很深。
英国自从伊丽莎白女王时代采用金银本位制以来，银币一直是用品质粗劣的合金制成的，所以，经常有人伪造钱币，致使货币价值一落千丈，物价因而疯狂上涨，人民生活困苦不堪，英国在国外的信用也丧失殆尽。
在这种情形下，国会提案：通过铸造新银币来替代旧银币。
这样，货币改造问题就成了英国当时的首要问题之一。蒙塔古为了表现自己的才干，大胆任用牛顿担负这个重要的任务。
牛顿在了解了铸造银币的过程之后，便着手研究新的铸造方法。他过去一度热心于炼金术，也就是将各种金属放在容器里混合、加热、提炼，试图从中提炼出金子来。虽然炼金的结果没有炼出真正的金子，但那段经历却给牛顿铸币工作提供了难得的经验。
即使这样，对他来说，铸币新方法的研究仍是相当艰难的事，毕竟，在过去大约30年当中，他大多数时间一直在讲堂和研究室度过。陌生的政府工作着实让他有点不适应，但是，牛顿严谨、踏实的个性使他无论做什么事，只要接触了，就一定要坚持到底，而且一定要做得出色。
没多久，他便想出了一个新的铸币方法：他把旧银币放进大熔炉里，等它熔化后再倒进预先铸好的银币模子里，这样一来，银币的形状、大小和重量就统一了。
新的银币由于铸造方法复杂，所以极不易再被伪造，英国的经济自此逐渐复苏了。但是，反对党却不希望看到对他们不利的事情发生。于是，他们挖空心思，绞尽脑汁，想尽一切办法想迫使牛顿离开造币局。同时，他们还用金钱、美色来诱引牛顿，但可惜，牛顿对此都无动于衷。
经过了大约3年的时间，由于牛顿坚持不懈的努力、不辞辛劳的工作，货币改造工作终于胜利完成，这比国会原来预期的时间要提前许多，牛顿也因为功绩卓越，由监督升为造币局局长。
升任局长的牛顿，仍住在作为督办时的老房子里，那所房子位于伦敦的嘉明街。
官位更高了，应酬自然也更多了，生性不喜欢喧闹的牛顿，不得不把善于交际的外甥女嘉德琳接来同住，顺便可以帮助他应付一些场面。
嘉德琳是牛顿同母异父的妹妹哈娜的女儿，她才17岁，却已经出落得亭亭玉立。聪明伶俐、善于交际又讨人喜欢的外甥女很得牛顿的宠爱。有了嘉德琳的照应，牛顿就可以放心做自己想做的事了。
虽然嘉德琳招待客人一律在家里，但这却丝毫不影响牛顿做他的事。当嘉德琳与客人们把酒畅谈时，牛顿却躲在书斋里埋头于他的研究。
牛顿在造币局局长的位子一直坐到1725年。
牛顿是自造币局成立以来最出色的、最有能力的局长，他总是认真地对待自己的工作。虽然人们为科学界从此失去一个重量级人物而叹息，但牛顿却以实际行动驳斥了“数学家缺乏实际头脑”的愚蠢说法。
升任造币局局长后，牛顿已经没有精力继续从事在剑桥大学的研究和教学工作，他决定不再干下去了。可是，这个讲座由谁来接替他主持下去呢？当年，牛顿的老师巴罗教授主动将位子让给牛顿，可谓慧眼识到了英才，现在，牛顿也想退位了，他必须要找一个信得过又有真才干的人。他首先就想到了自己的一个忠实的追随者，此人名叫惠斯顿。
1701年12月10日，牛顿正式辞去卢卡斯教授一职，由惠斯顿接替。
虽然退出了剑桥大学，但牛顿并没有退出整个学术界。他还有许多事要做。
1703年，牛顿的老对手，也是好友胡克去世，这促使牛顿当选为英国皇家学会的主席。
英国皇家学会可以称得上是英国科学的心脏。在当时复杂的政治状况下，牛顿深知，要干好这个会长绝不是件容易的事。根据在造币局成功的经验，他把精力重点放在管理上。
在学会里，他仍旧保持着一惯的风格：谨慎、沉默。尽管他从不滔滔不绝，口若悬河，但是他却总是带着威严端坐在会议桌的中间，那样子就像是家长坐在一群孩子中间。他倡导学会的精神是务实，多做少说。
在牛顿的英明领导下，整个学会生机勃勃，科学开展得相当兴旺。牛顿在学会获得了空前的威望，他稳稳坐牢了英国科学界的第一把交椅。
牛顿在坐上皇家学会会长的位子开始，就再没有离开过，他年年续任，一直到他去世为止，大约长达25年之久，他成为英国皇家学会历史上任期最长的会长，同时，他也是人们公认的最负责任、最优秀的会长。