茯苓的菌核是其贮藏器官和休眠器官，菌核外皮薄而粗糙色深。菌核的形状不一，有球形、椭圆形、卵形、扁圆形和长圆形等等。菌核的重量悬殊很大，大核有数千克重，小核只0.5千克左右。菌核的表面有皱纹，呈黄褐色、棕褐色或黑褐色。菌核的内部呈白色或粉红色。含有多种糖和酸，贮藏着丰富的营养物质。整个菌核由无色菌丝、少量棕色菌丝、分生孢子、聚糖粘胶物质所组成。菌核长在地下的松根上，其中抱松根生长的茯苓中药称为茯神，其镇静安神的药效大于茯苓。现代药学家对茯苓的药物分析和药理试验，已证实茯苓除治疗以上诸病症外，还有较高的抗癌活性。茯苓中的原茯苓多糖，它的一级结构B（1～3）葡萄糠为主链，B（1～6）为支链，分子量为34万，水溶性低，无抗癌活性；
需经化学处理后为茯苓聚糖。或羧甲基茯苓多糖，它的高级结构发生了变化，水中溶解度增加，并具有较高的抗癌活性。给小鼠服用羧基甲茯苓多糖，促进了抗癌淋巴因子——白细胞调节素的增加。除了茯苓夹饼，我国古今民间和宫廷还常制作多种名点茯苓糕供食用。