1999年11月25日起，山东省、交通部、国务院相继发出文件，召开会议，要求各地认真吸取“11·24”特大海难事故教训，切实抓好安全生产。
1999年11月26日，交通部责成山东省烟大汽车轮渡有限公司停业整顿。交通部部长黄镇东就加强对客滚船安全管理提出了要求。
10月29日，黄镇东在烟台召集有关方面负责人，就“盛鲁”事故对烟大轮渡公司加强运输安全管理提出了6条具体要求，要求烟大轮渡公司在三个环节上吸取教训，一是客滚船的危险品运输要加大检查力度；二是要加强船员救生的培训；三是确保消防灭火设施具备完好的技术状况。黄镇东指出，距现场会后相隔不到一个月，烟大轮渡公司再次发生海难事故，说明这个企业抓安全生产是不得力的，“盛鲁”号的教训并没有充分吸取。这次责成烟大轮渡公司停业整顿，不再开航，什么时候他们抓安全管理的具体措施到位了，什么时候才能开业。
在交通部召开的加强安全生产紧急电话会议上，黄镇东说，不能保障百姓安全的企业必须退出运输市场。他要求交通系统认真落实党中央、国务院领导同志的指示精神，切实处理好“11·24”海难事故，认真做好善后工作。
黄镇东说，当前进入冬季，除了海运，公路客货车事故也比较多，施工安全事故也经常发生，要举一反三，以对党和人民高度负责的态度，认真总结事故教训。当前，在市场经济条件下，企业在安全生产管理方面存在薄弱环节，单纯盈利思想较重，处理不好安全与生产的关系，不是把旅客和货物的安全放在第一位，这是导致“11·24”事故的直接原因，也暴露了有关方面管理不严格、漏洞较多的问题。他强调说，今后要立个规矩，企业不管老百姓的死活，交通主管部门就不给企业活路，没有安全保障的企业必须退出运输市场。
山东省委副书记、常务副省长宋法棠带领整顿工作组来到烟大轮渡公司，要求大家认真落实党中央、国务院的指示精神，深刻反省，全面整顿。