假的！
人与细菌有着不解之缘，不仅我们周围环境中有细菌，在我们的身体内同样有细菌在蛰居、繁殖。一般而言，人体除了器官内部以及血管和淋巴系统，其余部位如皮肤、呼吸道、胃肠道和生殖泌尿道等对外“开放系统”，都有细菌存在。那些在一般情况下不会引起疾病的细菌，叫做“正常菌群”。
有的人主张“正常菌群”对人体是过大于功的，因为正常菌群与致病菌没有本质区别。它名义上是“正常”的，但实际上却在对人体进行着隐藏地慢性侵蚀。比如，50%的人都有蛀牙，而引起蛀牙的重要因素却是口腔中的正常菌群变异链球菌、乳酸杆菌和蛋白溶解菌。这些细菌成群结队在不清洁的牙缝中繁殖，与糖、酶等物质积聚形成黄褐色的坚硬牙菌斑，牢固地粘着牙齿表面。变异链球菌对牙体硬组织有特殊亲和力，它与乳酸杆菌一起酵解糖原产酸，腐蚀牙体硬组织；蛋白溶解菌则产生溶解蛋白的酶，破坏牙齿有机质。光泽洁白的牙齿在它们的共同作用一下，逐渐崩解，出现了蛀牙。以此说明，人体正常菌群是人类的顽凶，是人体健康的潜在威胁。
而那些力主功大于过的人则认为，正常菌群对人体虽然有一定程度的有害作用，但它们的益处要比害处大。例如，肠道菌群不断由粪便污染带到皮肤表面，皮肤却很少受感染。原来，皮肤上的正常菌群能抑制这些致病菌生长，妇女阴道中的正常菌群乳酸杆菌则通过发酵糖原产酸，使阴道液维持酸性，间接地阻止酵母菌等致病微生物繁殖。一旦乳酸杆菌受到抑制，致病菌就会大量增殖，引起阴道炎症。人类利用正常菌群抵抗病原微生物的这种特性，有意识地让非致病菌有选择地在人体上繁殖，从而有效地防止致病菌的侵扰。又比如，随胆汁排至肠道的肠道菌群水解还原结合胆红素，使它成为无色的胆素。后者随尿或粪便排出后，在空气中氧化成黄色的胆素，使二便颜色加深。正常人每天需排除大约400～650毫升气体，其中约40%是二氧化碳，还有少量的甲烷和氢气，这些气体都来自胃肠道正常菌群的发酵。显然，人体的代谢离不开正常菌群。此外，正常菌群还为人体提供多种维生素，特别是维生素K，几乎全部来源于肠道菌群的合成。新生儿由于缺乏肠道菌群，体内维生素K含量很少，影响肝内凝血酶元的合成，所以很容易发生出血现象。人工喂养婴儿的患病率高于母乳喂养婴儿，部分由于前者肠道中缺乏双歧杆菌。因为双歧杆菌菌体内含有多种维生素，能促进人体的生长发育。有趣的是，新几内亚人的食物中缺少蛋白质，他们肠道中的某些恒定菌群却能把他们主食甜薯中充足的氮素固定下来，为人体合成氨基酸提供原料。更重要的是，正常菌群能提高机体免疫力。已有实验证明，在无菌条件下喂养的哺乳动物，许多器官的功能明显衰退，机体的防御系统如淋巴系统、网状内皮系统和抗体形成系统都发育不良。因此，某些很难使一般动物致病的细菌，如引起霍乱和细菌性痢疾的细菌能很容易感染无菌动物。
目前，“正常菌群是条件致病菌”的观点已被人们广泛接受。微生物学家认为，正常菌群与人体始终保持着平衡状态，菌群之间也相互制约，维持相对的平衡。如果长期服用广谱抗菌素、皮质激素，过多应用同位素或长期患有消耗性疾病，这些平衡就会受到破坏，无害的正常菌群就可能转变为有害的致病菌。当机体抵抗力下降时，口腔里的正常菌群梭状杆菌和螺旋体协同作用，引起奋森氏咽峡炎。长期使用抗菌素的婴幼儿，肠道内的白色含球菌或葡萄球菌优势繁殖，会导致肠炎。正常菌群还会东奔西窜，以邻为壑，成为致病菌。拔牙或扁桃体摘除时，呼吸道最常见的寄居菌绿色链球菌大量进入血液，定居在异常的心瓣膜上，就会引起亚急性心内膜炎。近年来耐药性大肠杆菌引起吸人性肺炎显著增加，也与大肠杆菌转移到呼吸道取得优势有关。由此可见，正常菌群对人体的作用既受到外部因素的影响，也受到菌群之间的影响。它们不是被动地居住于人体内部，而是从多方面影响人类的生存。
目前，认为“正常菌群”功大于过的主张占据了上风，市面上如雨后春笋般出现了一大批标注含有“益菌因子”的饮料和食品，并受到了人们的追捧。