在广阔的天庭，上帝正在召见群臣，仙官侍立左右。三仙长出位，以宇宙的浩瀚，变化的无穷景象，颂扬上帝造化万物的丰功伟绩。
恶魔靡非斯特和往常一样来到这里，口中无一句称颂的话，反而大发一通议论，说什么世界是一片苦海，而且永远不会变；人只能终身受苦，像虫鱼一样，任何追求都不可能有什么成就。
上帝问起大炼丹家浮士德的情况。靡非斯特说他正处在绝望之中。因为他欲望无究，他既想上天揽明月，又想下地享尽人世欢娱，到头来，什么也不能使他满足。
上帝坚信浮士德这样的人类的代表，在追求中难免有的失误，但在理性和智慧的引导下，最终会找到有为的道路。
靡非斯特不同意上帝的看法，他自信能将浮士德引向邪路，让他堕落，并为这事他提出敢同上帝打赌。
上帝也想找个负面的东西鞭策人的精神，于是上帝一口答应了靡非斯托的要求，把浮士德交给他。
赌博开始。
靡非斯特兴冲冲地从天宫下到凡尘，一心想到要把浮士德引向堕落。在一个中世纪的书斋里，室内阴暗、沉闷，年过50开外的浮士德坐卧不宁，烦闷已极。他想到自己大半辈子埋头在故纸堆中，与世隔绝，研究了世间的一切学问，到头来却一事无成，既不能救世济民，又不见半点聪明。他渴望投身宇宙，承担起世上的一切苦乐。但是，他几次努力都丝毫无功，失望已极之时，他想到以死来解脱一切。在激动的心绪中，他倒出一杯毒酒，将它举到唇边，准备作最后一次痛饮……突然，教堂响起复活节的钟声。这钟声猛地唤起浮士德对童年生活的记忆，对人生的向往，因而断了自杀的念头。
春天来了，快乐的人群涌向效外。浮士德也混杂在人群中。人们尽情领略着春天的美景。浮士德特别兴奋，郊野的一切都使他无限欢欣。农民们向浮士德敬酒，酬谢他在瘟疫中搭救他们。浮士德面对群众对自己的热忱褒奖，十分渐愧。他反省自己，何曾医好过病人？炼的那种金丹只不过是骗人的把戏。
夕阳西下，良辰将尽。浮士德恨自己没有腾飞长空的翅膀，飞去把太阳追赶。他感觉有两种意念在内心中搏斗不息：
一个要执拗地守着尘世，沉溺在迷离的爱欲之中；另一个要猛烈地离开凡尘，向一个崇高的境界飞驰。
恶魔靡非斯特发现浮士德的思想正处在矛盾之中，立刻将自己变为一个书生，走来与浮士德相识。他告诉浮士德：他是“否定的否定”“否定的精神”，“恶”就是他的本质；他要与自然的权威抗衡，要毁灭一切，包括人类。浮士德向他诉说尘世生活束缚的痛苦，他宁愿死也不愿过这种安贫守分，无所作为的生活。但是，死也要死得痛快，或者战死沙场，血染荣冠，或者狂舞之后倒进姑娘的怀抱。
靡非斯特乘机劝他去从事欢乐的事业，从孤僻的生活走向广阔活泼的天地。并提出给他签订这样的契约：靡非斯特今生愿意做浮士德的仆人，听他的吩咐，为他解愁除闷，寻欢作乐，获得一切需要；但当浮士德在表示满足的一瞬间，奴役便解除，浮士德的灵魂就属恶魔所有，来生便做恶魔的仆人。浮士德根本不相信“来生”，更不相信自己有知足的一天，便毫不犹豫地同意了这场赌博，立下了契约。
于是靡非斯特便把黑色的外套变成一朵浮云，载着浮士德和自己，开始了四海的云游。首先，他们来到莱比锡的一家地下酒店，靡非斯特要让浮士德看看这充满“快乐”的世俗生活。酒店里，一群大学生正在饮酒作乐，玩些无聊的把戏，唱些无聊的歌曲。靡非斯特是胡闹的专家，他加入大学生的阵营，给大家唱了一首滑稽的跳蚤歌。唱完，众人拍手叫好。接着，靡非斯特又耍了一个花招，在桌子边上钻出洞来，每个洞里都流出了各自想喝的美酒，乐得这群大学生狂笑不已。年过半百的浮士德对这些低级荒唐的把戏和享乐并不感兴趣，急着要离开。
靡非斯特就带着浮士德来到魔法女巫之厨，意欲用爱情生活来引诱他。恶魔先让他对着一个大的魔镜，镜子里立刻现出一个美女，引得浮士德向往、发狂。不一会儿，靡非斯特又催着浮士德喝下魔法女巫的药汤。浮士德顿时青春年少，浑身爱情激荡。
青春焕发的浮士德在街上溜达。少女格莉琴由教堂回家，从他身边走过。她美丽的容貌立刻吸引了他的注意。他抢步上前，提出要挽着手儿送她回家。他的要求遭到拒绝，端庄的格莉琴拂袖而去。
浮士德神魂颠倒，急切地要靡非斯特去把格莉琴捉来。如不从命，就和魔鬼一刀两断。靡非斯特连忙一口应承。这样，在靡非斯特的帮助下，浮士德很快获得了纯洁的平民少女格莉琴的爱情。为了能在家中享受爱情的欢乐，格莉琴接爱了浮士德的计谋：用安眠药使用母亲沉睡。谁知用得过多，母亲竟一睡不醒，离开了人世。格莉琴无意中杀死了自己的母亲，悲痛欲绝。她只有以悲痛和忏悔的心情祈求圣母把她从死亡和耻辱中拯救出来。可是，丑闻已经传遍市镇，原先的“花中之王”如今处处被人鄙视。
格莉琴的哥哥——军人华仑亭，一天晚上回家，正好碰上浮士德再次前来与格莉琴幽会，华仑亭一腔怒火正无处发泄，立刻向浮士德挑战。浮士德在靡非斯特的唆使和帮助下，拔剑杀了华仑亭。
哥哥继母亲也遭到噩运，格莉琴再次被恐怖压迫着，终于昏倒在地。这时，浮士德却逃出法网，无忧无虑，与靡非斯特一道赶赴下流淫荡的瓦普几司的晚会去了。
晚会结束后，靡非斯特告诉浮士德，格莉琴已身陷囹圄。这消息唤醒了浮士德怜悯的心，他狂怒地斥骂靡非斯特背信弃义，连狗都不如，接着坚决要求去救格莉琴，即使冒着生命的危险也要去。
他们飞马连夜赶到监狱，格莉琴已经神经错乱，把浮士德来看她当作是刽子手来提她到刑场。浮士德看到这般情景，内心悲痛万分，急切的催格莉琴出狱。但她不愿意走，她深知自己药死母亲，又害死了哥哥，是有罪的。天快亮了，死亡就要来临。任凭浮士德怎样劝逼，格莉琴都不出狱。靡非斯特冲来，不顾一切把悲痛欲绝的浮士德拖走了……在阿卑斯山麓，侧卧在百花烂漫的草地上的浮士德，疲备不堪，昏昏欲睡，无数精灵围绕着他唱歌跳舞，给他身上撒着迷魂川的水。浮士德一觉醒来，浑身轻松舒畅，没有一点罪孽感，他感到自己又有了一种坚毅的决心，要向新的生活高峰飞跃。
靡非斯特把他引入一个金銮宝殿，皇帝正想举行化装舞会，寻欢作乐。但国库空虚，财政发生严重困难。愤怒的群众正抗拒官兵横征暴敛。浮士德积极为国王献计献策，建议发行纸币，使王朝暂时渡过了财政危机。这时，皇帝又异想天开去见古希腊美人海伦和美男子帕里斯。浮士德借靡非斯特的魔法，招来了这对美男女。
海伦出现了，男人们个个神魂颠倒，浮士德更是销魂忘形。海伦俯下身去吻帕里斯，引起浮士德极大的醋意，便冲上前将魔术的钥匙触到帕里斯身上，引起一场爆炸，海伦化为烟雾消散，他自己昏倒在地。
靡非斯托只好把浮士德扛回了书斋。浮士德的学生瓦格纳已成为博学大师，正在进行“人造人”的实验，几百种元素在蒸馏、升腾、姚、逐渐增长，一个透明的小人儿终于创成功。小人儿发现浮士德迷恋着海伦，自愿带他去找海伦，小人在瓶中发光照亮道路，飞往希腊神话的发源地———古希腊。
希腊联军刚刚取得特洛伊的伟大胜利，抢回了美女海伦，海伦的丈夫却意欲杀死变节的妇人以祭奠神灵。靡非斯托变做丑陋的女管家，将海伦救出，送到浮士德正在执政的国家去避难。海伦和浮士德一见钟情，结成夫妻。浮士德将海伦奉若女王，向她学习奇特优美的韵律、格调。他们很快生了一个儿子欧福良。这是个早熟的天才，热情澎湃，酷爱高跃和飞翔，不久从空中坠落摔死在父母的身边。海伦悲痛万分，抱吻浮士德后消逝了。她留下一件白色衣裳，幻化为一朵云彩，托着浮士德腾空飞去。
浮士德降落在山顶上，俯视着无际的大海，几经幻灭，浮士德决心从个人小世界里走出，成就一番切切实实的大事业。一个庞大的计划又涌上心头：移山填海，造福人类。这时，国内发生内战，他下山帮助了国王，得到一片赐封的海滩，便立刻动手在这里建造一个平等自由的乐园。但有一对老夫妇不肯搬迁，靡非斯特便派人捣毁了老夫妇的家门，放火烧了他们的小屋、教堂和森林，两个老人被吓死。这事引起了浮士德的忧愁。
这时，忧愁妖女乘机对他吹了一口阴气，使他双目失明。恶魔召来死灵，为浮士德挖掘墓穴，浮士德听到锄头的声音，以为这是响应他的号召前来移山填海的民众，顿时，他觉得大海变良田、人民安居乐业的新生活就要到来了。他满怀喜悦，情不自禁地喊出：“你真美呀，请停一停！！”随声倒地死去。
浮士德终于满足了。魔鬼生怕他的灵魂逃走，口中念起咒语来。但这时天上的光明圣母却派来一群天使，魔鬼被天使们的美貌迷住，忘离守护的职责。天使们趁机抢走浮士德的灵魂，飞上天去。高空中，她们高唱着“凡是自强不息者，到头我辈均能救”，飞回天堂。天堂顿时欢声四起，众天使为战胜魔鬼、获得浮士德的灵魂而高奏凯歌。