“大舜”号轮打捞现场正处于当地渔民养殖区内，打捞过程中难免出现沉船污油外溢问题，污染周边环境，影响当地渔民的渔业生产，损害群众的利益。在防治污染的问题上，一直坚持保护人民群众利益的原则，宁肯在防污上多花点钱，多采取一些措施，也不因污染给老百姓造成损失。打捞施工期间，烟台海事局派出专人跟班作业，现场监督。环保部门在沉船周围设立了14个监测点，先后23次对海水进行取样化验。从5月18日沉船第一次扳正，到顺利起浮拖航到锚地，在沉船周围都设置了三道防线：第一道由打捞施工单位负责，在现场设置围油栏，组织防污专业队用消油剂、吸油棉等及时清除污油。第二道由烟台海事局负责，出动工作船，携带防污材料，在打捞现场外围协助打捞施工单位做好防污工作。第三道由市环保部门负责，组织环保工作人员、武警战士等在牟平区云溪村沿岸待命，一旦发现油污及时进行处理，确保万无一失。在“大舜”号轮起浮后的车货清理和减载过程中，继续加强了防污措施。由于准备充分，布防严密，没有发生污染问题。
“大舜”号轮时钟指向11：37，是为船体入水的第一时间。