中医认为，对于秋季腹泻的患儿在不影响孩子营养的情况下，应让消化道充分休息。一般可禁食8—12小时，禁食时应补充适量的淡盐水；而后在医生指导下逐渐恢复饮食。秋季腹泻抗生素治疗大多无效，可以选择中药治疗。一般分为以下几种：①寒泻：因为小儿过食生冷饮食，或感受风寒着凉引起，表现为患儿发热、腹痛腹胀、大便清稀、肠鸣。用药可以选服藿香正气胶囊，每次2粒，一日2次。并可外用“小儿敷脐止泻散”贴脐，一日换1次；②热泻：多因患儿肠胃积热，外受暑湿而引起，表现为腹泻急促而量多，大便稀黏、酸臭，小便黄。可选用葛根芩连微丸，每次1克，每日服3次；③水泻：因小儿贪食生冷食物，引起水泻不止，每天大便次数多，肠鸣腹胀，大便如稀水或不成形，泄后肠鸣腹胀减轻。患儿病情很容易加重而发生脱水。一般应到医院请医生诊治，及时补液，防止出现意外；④伤食泻：主要由于小儿过食或添加辅食不当引起腹胀腹痛，大便前哭闹，大便酸臭，或见奶瓣或不消化食物，口臭气促，食欲不振，夜卧不安。可服至宝锭每次1丸，每日2次；
⑤脾虚泻：多因患儿素体脾虚或久病久泄引起身体虚弱，面色发黄，疲倦无力，大便松散不成形或次数多。可用启脾丸每次1丸，一日2次。