干燥综合征目前没有特效疗法，主要是对症治疗。常用1%匹鲁卡品液滴于舌下，每次1滴，每天3次，也可以2%甲基纤维素溶液或甘油涂在口内黏膜上，增加润滑，减轻不适感。眼部治疗可用0.5%镁甲基纤维素配合氯霉素眼药水滴眼。
干燥综合征的全身用药可以使用泼尼松或环磷酰胺等免疫抑制剂，这对部分病人有效。泼尼松每次10毫克，每天3次，一周为1个疗程，一周以后逐渐减量。环磷酰胺口服每次50毫克，每天1～3次，4～6周为1个疗程；也可以静脉注射，每次100～200毫克，每天或隔天1次；也可以用大剂量间歇疗法，每次800～1000毫克，每周1次，4～6周为1个疗程。必须注意的是，免疫抑制剂都必须在医生的指导下使用。使用强的松可能引起身体发胖，骨质疏松，引发股骨头坏死以及身体的抵抗力下降等不良反应。环磷酰胺则有骨髓抑制，白细胞减少，恶心呕吐以及肝脏损害等副作用，使用时应当定期检查血象以及肝肾功能，如果发现白细胞低于正常值，应当停药观察。此外，泼尼松或环磷酰胺都对性功能有一定的影响，长时间、大剂量使用泼尼松等皮质激素会加重性功能的障碍程度。也可选用免疫增强剂如转移因子、胸腺肽等。