梁台建后,邓元起为益州刺史,上表推荐庾黔娄为府长史、巴西梓潼二郡太守。邓元起平定成都后,城中珍宝堆积如山,邓元起一一分给下属,只有庾黔娄一个人丝毫不要。邓元起讨厌他一个人异样,厉声说:“长史为何偏偏这样!”庾黔娄看那样子不好违命,就请求给他几箱子书。不久,被任命为蜀郡太守,在职清廉俭朴,百姓受其益,邓元起死于蜀,部属都离散而去,庾黔娄亲自料理丧事,扶持灵柩归葬邓元起家乡。