有一天，一个神秘人坐着一辆能够穿墙而过的马车来到了天河小学，将一个古怪的盒子交到了校长手中，这一神秘事件却被六（6）班的学生叶卓谦看到了。
自此以后，叶卓谦常常听到诡异的哭声，他又从突然出现在自己寝室里的小精灵拉多、宠物精灵波比和小魔鬼约克那里知晓了一个惊天大阴谋：邪恶的魔法师灵格绑架了魔法世界的王子洪方域，同时，他使用法术变幻出了一个假冒的小王子，密谋夺取撒马郡魔法王国的皇权。
在这危急关头，老师和同学们眼睛中平凡无比的叶卓谦（魔法世界预言诗中的超级魔法少年），与精灵们一起进入加密魔法空间，解救出了魔法王子。尔后，大家一同大战魔界六大妖兽，得到了打开魔幻门的钥匙。
在善良的雷迪校长的帮助下，众人穿越魔幻门，悄悄潜入由灵格担任院长的若哈德魔法学院，在经历了重重艰难险阻后，众人最终打败了邪恶的灵格，让洪方域王子顺利地加冕成为国王！