鼠类对杏鲍菇生产危害较大，主要危害培养料和菌丝。鼠类虽然不直接以菌丝和子实体为食，但由于其独特的生活习性，常咬破塑料袋，破坏菌丝生长，还可引起杂菌污染，使栽培受到严重危害。
防治鼠类可采取以下措施：
（1）培养室墙壁、地面、窗户要封闭严密，使鼠无处藏身。若有鼠洞，要及时用水泥填补。
（2）尽量不用鼠类爱吃的谷类做菌种。
（3）灭鼠前严格控制食物，清除果皮渣壳等，断绝鼠粮，迫使老鼠饥饿就食诱饵。
（4）在菇房、培养室放置灭鼠药剂、灭鼠器。可在菇场周围布下电猫驱鼠器，当鼠类触电身亡，电猫会及时发出“吱吱”或“嘟嘟”的报警声，及时取掉死鼠，继续捕杀效果好。