肥胖对男、女性功能均有影响。男性肥胖者雄激素减少，雌激素增多，雌雄激素的比例失调，致性功能减退、出现阳痿，或者出现性欲减退以及出现勃起、性交、射精等环节障碍。
肥胖对女性卵巢功能有显著影响。可显著影响妇女的月经周期及生育。女性肥胖者更年期提前出现，闭经提前来到。女性肥胖者体内雌激素水平偏高，可以抑制垂体分泌卵泡素和黄体生成素，从而引起月经周期紊乱。肥胖女性中闭经占16.4%，月经稀少占28.7%，月经量过多占5.5%，肥胖女性存在着不同程度地性功能障碍。其发生性功能障碍的主要原因是雌性腺激素分泌减少。肥胖女性的性欲普遍低下，与其体内雌激素水平低下有密切关系。另外，肥胖女性还可并发卵泡发育异常及排卵功能障碍等。据报道大约有50%的肥胖女性出现无月经，月经不规则，月经过少及不孕等。