不同动物的生物饲料可选择不同种类的秸秆。食草性动物（如牛、羊、马、驴等）可利用玉米秸、稻秸、麦秸等低营养、高纤维和木质素的秸秆；单胃动物、禽类和鱼类（如猪、兔、鸭、鹅、鱼等）可选择营养相对较高、粗纤维和木质素相对较低的材料，如花生秧、花生壳、稻糠、麦糠等为原料进行制作。不论哪种秸秆都应先去掉根部和泥土，除去霉烂变质部分，尽量保持秸秆的新鲜和清香。
（1）牛生物饲料的制作。① 用铡草机将秸秆切成3～5厘米的短段，或用揉搓机揉搓成细丝状，称取75千克放到干净的水泥地面上；② 取0.5千克转化剂加到75千克清水中（冬季最好用30℃清水）充分溶解；③ 将转化剂水溶液喷洒在已备好的经铡切或揉搓过的秸秆中，搅匀后装入塑料袋或其他容器中，边装边压实，最后将口扎紧或用塑料布密封放置阴凉处；④ 厌氧发酵1～3天（冬季3～7天）后，就制成了营养丰富、易消化吸收的秸秆生物饲料。饲料呈黄色，具有浓郁的酒香和苹果酸香味。切忌在太阳光下暴晒，因为太阳光的紫外线具有杀菌作用，影响有益菌和酶的作用。
（2）羊生物饲料的制作。将秸秆粉碎成4～6毫米的粗粉状或用揉搓机制成蓬松小块，按照上述的牛生物饲料的制作方法处理即可。
（3）猪、鸭生物饲料的制作方法。最好取用花生秧、豆秧、稻糠、玉米秸、花生壳等为原料，粉碎成30～40目的细粉末状，制作方法与牛羊生物饲料制作方法相同。
（4）兔生物饲料的作用方法。其以造粒为主，无造粒条件的，兔生物饲料粉状也可以。