香菇料袋接种方法主要有以下几种：
（1）双袋接种法。即用装袋机装完袋后，外面再套一层薄袋。接种以后不需要贴胶带，直接套上薄袋，操作简便，省工。内袋规格为15厘米×（50～55）厘米，外袋规格为17厘米×（50～55）厘米。内袋装料后经灭菌冷却采用打孔接种法，接种时消毒要严格，打孔不宜过深，一般为1～5厘米，将菌种块接入孔内，并留一部分菌种在袋外，防止接种孔有空隙出现污染，外面不贴胶布，而是将备好的薄袋套在接过种的袋子上，重新扎好袋口移入培养室发菌。
（2）打孔贴胶布接种法。通常经过灭菌冷却的料袋，用干布擦净袋面，细形袋在对应面打穴5～6个孔；粗形袋，每袋正面打5穴，背面打5穴，梅花形排列，4个角4穴，中央1穴。打孔器打孔，直径1.5～2厘米，穴深2厘米。用接种器整块取种，迅速接入穴内，打一面接一面种，穴要点满菌种，要压实，略高出袋面1～2毫米，菌种块将穴盖严，不留缝隙。点种后马上贴胶布封严穴口，不留缝穴。
（3）枝条种接种法。灭菌冷却后的料袋，接种前擦净袋面，用长枝条菌种，每袋接一行，4～5穴。用短枝条菌种，每袋接2～3行，每行3～5穴。接种时用酒精棉球呈直线擦过去，将菌种瓶瓶底打掉，用消过毒的接种钳子夹着枝条种的齐头端，让尖头端直插入袋内。齐头端留在外面3～5毫米，不得插歪。接种后可以不封口，用略宽于料袋的薄袋套上，并扎好套袋的两端袋口。也可以用胶布或胶纸密封。
（4）袋端接种法。将灭菌冷却后短料袋两端解开，将碎块菌种撒入料袋两端料面上，稍加压实，再把料袋两端用扎绳扎好，发菌。这种方法适用于短袋。