从预防角度看，去除牙菌斑是口腔卫生的重点。因为牙菌斑是龋病和牙周疾病两者的共同因素之一，如果清除了牙菌斑，也就解决了龋病和牙周疾病的预防问题，同时也使牙结石失去了赖以形成的基础。
检查刷牙效果的标准，就是看牙菌斑是否已经完全清除干净。在牙面附着的牙菌斑较薄，颜色与牙齿相似，肉眼一般不易看见牙菌斑，常用牙菌斑显示剂进行染色，表示牙菌斑存在的部位和数量。这样既可用来作为评价个人口腔卫生的客观数量，还可用来指导个人进行重点清洁。
菌斑染色剂分片剂和溶液两种。若使用片剂，先将药片放入口内，嚼碎并与唾液充分混匀，用舌头涂布于牙面，然后用清水漱口，即可显示出有色的牙菌斑；若用2％藻红液染色，先用棉球将藻红液涂在牙面上，或者直接滴少量藻红液于口腔内，或稀释含漱染色，也可取得同样的效果。
一般情况下，染色后，自己可用镜子对照口腔检查，凡是有染色的牙面，就说明这些染色牙齿还没有刷干净，需重新再刷。当自己通过镜子看不清后牙的颊侧时，可请别人帮助检查，指出自己还有哪些部位没有刷干净。这样，经过多次反复检查，自己也可总结经验，摸出规律，哪些部位经常不易干净，就可指导自己今后加强某些部位的刷牙。
最近还有一种新型溶液显示剂，经涂擦漱口后，能辨别出是刚形成的初期牙菌斑，还是成熟的牙菌斑，前者显红色，后者则显蓝色。