我国的克隆羊“阳阳”
由于动物体细胞克隆可以复制出的数量巨大的优良个体，因此动物克隆技术可以首先应用于畜牧业育种上。
通常在动物育种中所采用的方法主要是杂交育种，即把两个具有不同优良性状的雌雄个体进行交配，然后在后代中去选择人们所需要的个体。要获得一个优良品种，往往需要几年甚至几十年的时间，而且必须不断地进行育种。如果采用动物个体克隆技术，就可以大量复制出人类所需要的优良个体，还可以大大缩短育种时间和节省大量的人力、物力。克隆技术的完善为转基因动物的繁殖开辟了一条通道，应用克隆技术可以将转基因绵羊大量繁殖，从而可在降低成本的同时大幅度提高产量，可见克隆技术在这方面的应用前途无量。
体细胞克隆牛“康康”和“双双”
利用个体克隆技术，可以建立起稳定的动物模型，这将有利于揭示基因结构和功能间的关系，揭示生命的本质。动物克隆技术还有可能用于延缓珍稀濒危动物的灭绝。研究结果表明有的动物的器官与人的器官十分类似，科研人员正在设法用动物的器官来进行人的器官移植，利用动物克隆技术获得足够量的动物器官用于人类器官移植。由于大多数哺乳动物类的胚胎发育过程非常相似，应用治疗性克隆技术，还会促进畜牧业、动物业、制药业等方面的蓬勃发展。
目前，组织器官制造领域是全球高科技竞争最激烈的领域之一，各种再生或实验室培养的骨头、软骨、血管、皮肤以及胚胎神经组织都正在人体上试验。肝脏、胰腺、心脏、耳朵以及手指也正在实验室中成形，个体克隆技术用于生物医学方面，将会产生巨大的经济效益。