肾阴肾阳为身之根本，少阴病情多沉重，其寒化证主要取决于阳气的存亡，阳回则生，阳亡则死；热化证的预后，取决于阴液的存亡。
（6）厥阴病的辨治：厥阴主风木，下连少阴肾水，上承心包相火，同时与脾胃有木土相克的关系，故厥阴病较为复杂，可出现寒热错杂、寒证、热证等不同证候。厥阴病提纲证“消渴，气上撞心，心中疼热，饥而不欲食，食则吐蛔，下之，利不止”，即为上热下寒、寒热错杂之代表证候，治以清上温下，寒热并用。其中上热下寒、蛔虫内扰的蛔厥证，治宜清上温下，安蛔止痛，方用乌梅丸；胃热脾寒、上下格拒的吐利证，治宜清上温下，调和脾胃，方用干姜黄芩黄连汤；肺热脾寒、阳气内郁的唾脓血证，治宜发越阳郁，清肺温脾，方用麻黄升麻汤。厥阴受邪，阴阳失调，邪从寒化，也可形成厥阴寒证。其中血虚寒凝的手足厥寒、脉细欲绝等症，治宜养血通脉，温经散寒，方用当归四逆汤；兼内有久寒者，方用当归四逆加吴茱萸生姜汤；肝寒犯胃，浊阴上逆的干呕吐涎沫、头痛等症，治宜暖肝散寒，和胃降浊，方用吴茱萸汤。厥阴受邪，阴阳失调，邪从热化，还可形成厥阴热证，症见下利便脓血，肛门灼热，里急后重，发热口渴，舌红苔黄等，病属肝经湿热，下迫大肠所致，治宜清热燥湿，凉肝止利，方用白头翁汤。
病至厥阴，正邪相争，阴阳消长，阴盛则厥，阳盛则热，阴阳相争，互有胜负，则手足厥冷与发热可以交替出现。厥多于热为病进，热多于厥为病退，厥热相等则病愈。若发热不罢，则是阳复太过，亦为病进，可见到热伤上焦的喉痹、热伤下焦的便脓血等。
厥阴病常见厥、利、呕、哕等症。厥者，手足逆冷是也，其机制是阴阳气不相顺接，有寒热错杂、蛔扰致厥的乌梅丸证，血虚寒凝致厥的当归四逆汤，热盛阳郁致厥的白虎汤证，胸中痰食致厥的瓜蒂散证，胃中停水致厥的茯苓甘草汤证。下利有厥阴病肝热下迫大肠的白头翁汤证，热结旁流下利的小承气汤证，阳虚阴盛下利的通脉四逆汤证等。呕哕有厥阴病肝寒犯胃的吴茱萸汤证，阳虚阴盛呕吐的四逆汤证，邪传少阳呕吐的小柴胡汤证等。
2.其他辨证
（1）八纲辨证：《伤寒论》中既建立了六经辨证论治的理论体系，又确立了八纲辨证。在发病学上提出“病有发热恶寒者，发于阳也；无热恶寒者，发于阴也”；在证候学上，以三阳证为阳证，以三阴证为阴证，由此，阴阳辨证的大纲确立；三阳证中，太阳属表、阳明属里、少阳属半表半里（表里之间），而三阴均属于里，由此，表证、里证的辨证概念得到了确立；表证既有太阳伤寒、太阳中风，又有太阳温病，兼变证中既有麻黄杏仁甘草石膏汤证、抵挡汤证等热证，又有桂枝甘草汤证、干姜附子汤证等寒证，同时还很有针对性地指出“病人身大热，反欲得近衣者，热在皮肤，寒在骨髓也；身大寒，反不欲近衣者，寒在皮肤，热在骨髓也”，由此，寒证、热证的辨证概念得到了确立；三阳证以实证为主，兼有虚证（如太阳病中伤寒为表实证，中风为表虚证），三阴证以虚证为主，兼有实证（如太阴病本证属于虚寒，但也常于虚寒中夹有实热，桂枝加大黄汤证便是明证），由此，虚证、实证的辨证概念得到了确立。阴阳辨证主要是辨病之性质，《伤寒论》的六病分类，有三阴三阳之别，就是辨别证候的阴阳属性。由于三阳病正邪交争较为激烈，多表现为亢奋的状态，临床上以热证、实证为主；三阴病正气不足，抗病力弱，多表现为虚衰状态，临床上以寒证、虚证为主。表里辨证主要是辨病位之浅深，因此，表与里的概念是相对而言的。就六病而言，三阳为表，三阴为里；就三阳而言，太阳为表，阳明为里，少阳者为半表半里；就太阳与少阳而言，太阳为表，少阳为里；就少阳与阳明而言，少阳为表，阳明为里。寒热辨证主要是辨证候之属性，六病皆有寒热之辨，太阳病既有中风、伤寒，亦有温病；阳明既有热证，亦有寒证。虚实辨证主要是辨正邪之盛衰。“邪气盛则实，精气夺则虚”，虚证属于正气不足，实证属于邪气亢盛。虚与实的认识也是相对的，就六病而言，三阳病多属实证，三阴病多属虚证，但三阳病中也有虚证，三阴病中也有实证。由此可见，八纲属于思维辨证，是通过分析、分类、归纳等方法，把四诊中所收集的纷繁的体征、脉症进行去伪存真、去粗取精、由表及里、由此及彼地分析，将证候概括为“阴、阳、表、里、寒、热、虚、实”8个类型，是一种抽象的概念。后世医家在《伤寒论》的基础上，经过临床诊疗实践，不断总结，逐步发展和完善，使之成为各种疾病辨证的总纲。《伤寒论》中虽未明确提出八纲辨证的名词术语，但在其六经病证辨证中却处处都有“阴、阳、表、里、寒、热、虚、实”的内容，它是六经辨证体系的重要组成部分，因此，二者之间有着密不可分的关系。
（2）脏腑辨证：六病的发生、发展与传变，不能脱离脏腑、经络而孤立存在，而是以脏腑经络的病理变化为基础的。如伤寒表实证，其病机就是风寒束表，肺气失宣，故治以麻黄汤发汗解表，宣肺平喘。若是邪热壅肺，宣降失司，而见喘逆的病证，则治以清热宣肺，降气平喘，方用麻黄杏仁甘草石膏汤。若寒饮伏肺，见有咳喘，痰稀色白，舌苔白滑，脉弦紧者，则方用小青龙汤，温肺化饮。若是“其人叉手自冒心，心下悸，欲得按者”，其病机则是心阳不足，心失所养，治宜温通心阳，方用桂枝甘草汤。若是“火逆下之，因烧针烦躁者”，其病机则是心阳虚弱，心神不敛，治宜温通心阳，潜镇安神，方用桂枝甘草龙骨牡蛎汤。若见脉率不齐，心动悸、脉结代者，其病机是心之阴阳气血不足，治宜通阳复脉，滋阴养血，方用炙甘草汤。若见“伤寒若吐、若下后，心下逆满，气上冲胸，起则头眩，脉沉紧”者，则是脾阳虚弱，水饮内停，治疗需温脾阳、化水饮，方用茯苓桂枝白术甘草溻。若是脾气虚弱，运化失健，气机阻滞，而见腹胀满者，治宜温运健脾，消滞除满，方用厚朴生姜半夏甘草人参汤。若是心中悸而烦，腹中急痛，喜温喜按者，其病机是中焦虚寒，气血不足，治宜温中补虚，调和气血，方用小建中汤。若见昼日烦躁不得眠，夜而安静，脉沉微，身无大热者，则是肾阳暴虚，阴寒内盛，治宜温肾祛寒，急救回阳，方用干姜附子汤。若见烦躁，肢厥，脉微细者，其病机是少阴心肾阳虚，阴液不继，治宜回阳益阴，方用茯苓四逆汤。肝郁气滞阳郁，见有四逆，或腹痛、泄利下重、咳嗽、心下悸、小便不利者，治宜通阳导滞，方用四逆散。肝邪乘犯脾胃者，见有呕吐、腹痛、下利者，治用乌梅丸，清上温下、辛开苦降。肝经湿热下迫大肠，大肠传导失司，见有下利便脓血，血色鲜艳，急后重，肛门灼热，渴欲饮水，舌红苔黄者，治宜清热燥湿，凉肝止利，方用白头翁汤。肝血不足，复受寒凝，见有手足厥寒，脉细欲绝，头晕心悸，爪甲少华，唇色淡白，舌有紫气紫斑，或伴妇人月经衍期，经来腹痛，经色黑而有血块者，治宜养血通脉，温经散寒，方用当归四逆汤。在营血不足，寒凝经脉的基础上，兼有沉寒痼疾，与肝、胃有关，病机是血虚寒凝，兼有肝胃陈寒，治宜养血温经，暖肝温胃，方用当归四逆加吴茱萸生姜汤。阳气内郁，肺热脾寒，见有寸脉沉迟，手足厥逆，咽部不利，唾脓血，泄利不止，下部脉不至者，治宜发越阳郁，清肺温脾，方用麻黄升麻汤。胃热脾寒格拒，见有呕吐，食人则作，口渴口臭，脘中饥嘈，下利便溏，食少乏力，腹胀腹痛，喜暖喜按，舌边尖红，舌苔黄白者，治宜清胃降逆，温脾散寒，调和脾胃，方用干姜黄芩黄连人参汤。阳明大肠实证，据邪热微甚，津伤轻重及燥屎停留位置等不同，或以攻下（承气汤证）、或以润下（麻子仁丸证）、或以导下（蜜煎或大猪胆汁、土瓜根等）。若胃中阳虚、浊阴上逆而食谷欲呕者，当温中散寒、降逆止呕，方用吴茱萸汤。少阳胆热，见有往来寒热，胸胁苦满，嘿嘿不欲饮食，心烦喜呕等，是少阳枢机不利，进而影响脾胃功能，治宜和解少阳，用小柴胡汤。若少阳病不解，传人阳明，出现呕不止，心下急，郁郁微烦，或发热，汗出不解，心中痞硬，呕吐而下利者，是少阳病兼阳明里实，治宜和解少阳，通下里实，用大柴胡汤。妇女感受外邪，适逢月经来潮，病邪乘虚内陷血室（胞宫）者，治宜刺期门，或用小柴胡汤。
（3）气血津液辨证：气血津液是人体生理活动的基本物质，其耗损不足或分布异常均可导致相应的疾病发生，《伤寒论》重视气血津液病机的辨证施治。麻黄杏仁甘草石膏汤、白虎汤、白虎加入参汤等方药都是用于治疗气分热盛证。治疗气病的，尚有脾虚气滞的厚朴生姜半夏甘草人参汤证治、气郁不疏的四逆散证治。气虚下陷则用温灸的方法，如“少阴病，下利，脉微涩，汗出而呕，必数更衣，反少者，当温其上，灸之”。在气虚的用药上示人慎用寒凉，提出“太阴为病，脉弱，其人续自便利，设当行大黄、芍药者，宜减之，以其人胃气弱，易动故也”；“凡用栀子汤，病人旧微溏者，不可与服之”。在血有血虚、血瘀、血热等不同病机的证治，如“脉浮紧者，法当身疼痛，宜以汗解之，假令尺中迟者，不可发汗……以营气不足，血少故也”；“伤寒有热，少腹满，应小便不利，今反利者，为有血也”；“阳明病，口燥，但欲漱水，不欲咽者，此必衄”等。邪热与血结于下焦，治宜攻逐瘀血，随蓄血的轻重缓急，分别选用桃核承气汤、抵当汤和抵当丸。症见少腹拘急不舒，小便自利，其人如狂，或发热，午后或夜间为甚，舌红苔黄或有瘀斑，脉沉涩的，治宜泻下瘀热，方用桃核承气汤。少腹硬满，其人如狂或发狂，小便自利，或见发黄，脉沉涩或沉结，舌质紫或有瘀斑的，病势急迫，治宜破瘀泻热，方用抵当汤。少腹满，小便自利，或有发热，舌紫暗，脉沉涩或沉结的，病势较缓，治宜泻热逐瘀，峻药缓图，方用抵挡丸。在津液病机上指出“大下之后，复发汗，小便不利者，亡津液故也”。津液亏损则机体失于濡润，如“大下之后，复发汗，医更重发汗……以亡津液，胃中干燥，故令大便硬”。在津液亏损的治疗上，首重饮食调理，提出“太阳病，发汗后，大汗出，胃中干，烦燥不得眠，欲得饮水者，少少与饮之，令胃气和则愈”。若阳明热盛，见有大烦渴不解，舌上干燥而烦，欲饮水数升者，表明津气损伤严重，治宜清邪热，益气津，方用白虎加入参汤。热病目中不了了，睛不和者，是燥热亢盛，阴津欲竭，病情严重，迟则不救，宜釜底抽薪，急投大承气汤，泻热实以救阴液。阳明病发热汗多者，是里热蒸腾，迫津外泄，阳热呈亢极之势，阴津有枯竭之虞，亦应抓住时机，急下存阴，投以大承气汤。若伤寒发汗不解，津液已经外夺，又迅速出现腹满疼痛，则燥热结滞之势迅疾，也需要当机立断，用大承气汤急下阳明燥实，以护阴液。“少阴病，得之二三日，口燥咽干者，急下之，宜大承气汤”，是素体阴虚之人，感受温热病邪后，伤阴燥化迅速，燥热灼津，真阴将竭，故当急下，治用大承气汤峻泻燥实，以救将竭之真阴。“少阴病，自利清水，色纯青，心下必痛，口干燥者，可下之，宜大承气汤”，是热病燥屎内结，迫液旁流，泻下之物为黑色臭秽粪水，病机属于热结旁流，火炽津枯，治宜大承气汤，泻其燥热，则旁流可止，阴液可复。“少阴病，六七日，腹胀不大便者，急下之，宜大承气汤”，是热病燥屎内结，浊气壅滞，阳明腑实已成，少阴真阴已亏，有土实水竭之虞，治当急下，用大承气汤，去其燥结，以救肾水。