海岛经济效益开发不够
在我国，海岛地区的基础设施差、交通不便利、生态环境脆弱等原因导致海岛地区经济基础薄弱，规模较小，发展速度慢，国民经济发展明显落后于临近大陆地区。且大部分海岛开发程度不高，资源未能得到有效利用，经济效益低。
另外，海岛的产业布局也不甚合理。海岛产业的形成和分布受资源和技术影响较大。对于单个海岛来说，由于特有的资源、经济和环境条件，决定了其在区域经济分工中的角色各不相同。在长期历史发展过程中，我国绝大多数中小海岛经济主要以渔业为主，辅以少数的种植业。在现有商品经济条件下，有些海岛地区为了发展经济，单纯追求短期效益，在没有进行科学论证的情况下，盲目开发利用海岛资源，产生了一系列生态环境和经济问题。例如，在自然环境优美适于发展旅游业的海岛从事填海、围垦以及挖沙等活动造成生态环境的恶化，阻碍了海岛地区经济的健康发展。
海岛生态环境亟须改善
海岛淡水资源紧张，周围海域污染严重。由于特定的地理环境，大部分海岛都以大气降水为淡水主要来源，水资源贫乏。工业废水和生活污水的排放，化肥和农药的使用，以及淤泥、淡水养殖、海水倒灌等因素导致水质恶化，加剧了海岛淡水资源的紧张。
海岛的生物资源也面临严重威胁。海岛生态系统具有丰富的生物多样性，但是由于人类对海岛生物资源掠夺式的开发利用等原因，海岛生物资源正面临着比以往任何时期都严重的威胁。
在海岛旅游开发利用的过程中，一些围、填海工程改变了海岛周围海域的自然环境。涉及开发利用的海岛，为了便于登岛或其他用途通常修建一些围、填海项目，可能改变原有海流体系和水动力条件，造成当地生态环境的不良变化，更有甚者造成海岛灭失。
走生态旅游之路
为了使海岛旅游能够可持续发展，为了能够使更多的人享受到海岛的自然风光，海岛旅游必须走生态旅游的道路。生态旅游是基于自然的、可持续的旅游，强调的是一种行为和思维方式，即保护性的旅游。海岛生态旅游以保护海岛自然环境和生物多样性、维持资源利用的可持续发展为目标，以旅游促进生态保护，以生态保护促进旅游。这样不会破坏自然，使人们在旅游过程中，充分感受到海岛自然风光的美丽，同时还会使海岛从保护自然资源中得到经济收益。
海岛生态旅游开发原则
海岛生态旅游的开发遵循一定的科学原则显得尤为重要。从国内外海岛生态旅游发展的理论和实践来看，制定其生态旅游规划，实施生态旅游开发时，主要应遵循以下原则：
1.永续利用原则。“永续利用”是时代的产物，它是一种使人类在开发旅游资源时不但顾及当代人的经济需要，而且还顾及不对后代人进一步需要构成威胁和危害的发展策略。尽管它不意味着为后代和将来提供一切，造就一切，但它却通过对经济效益、社会效益、生态效益三者的协调，使当代人用最小的代价获取最大的旅游资源利用，造福子孙后代。
2.保护性开发原则。要使海岛生态旅游资源可持续利用，就必须加强对旅游资源的保护。针对其生态旅游资源的开发而言，开发和保护的关系应体现总的原则是：开发应服从保护，在保护的前提下进行开发。资源得到妥善保护，开发才能得到收益；开发取得收益，反过来可促进保护工作。但是，一旦开发与保护出现矛盾，保护对开发有绝对否决权。
3.特色性原则。海岛生态旅游资源贵在稀有，其质量在很大程度上取决于它与众不同的独特程度，即特色。有特色，才有吸引力；有特色，才有竞争力，特色是旅游资源的灵魂。
4.协调性原则。海岛生态旅游资源开发必须与整个生态区的环境相协调，既有利于突出各旅游资源的特色，又可以构成集聚旅游资源的整体美，使游客观后感到舒适、自然。
5.经济效益、社会效益和环境效益相统一的原则。市场经济就是追求效益最大化，海岛生态旅游作为旅游的一种形式，也追求效益最大化，但这个效益不仅是指经济效益，还包括社会效益和生态效益，三者必须高度地协调统一。而当三者出现矛盾时，以生态效益和社会效益高于一切为指导原则，即经济效益必须从属于上述两种效益。实际上，当生态效益和社会效益达到最大化、最优化时，其经济效益肯定也是相当可观的。
海岛生态旅游中的具体环保内容
由于海岛的面积有限，水资源贫匮、历史文化单一，所以它们的环境系统十分脆弱，自我恢复能力很低，其生态环境的破坏往往是无法逆转的，而进行治理成本会非常高。因此，在开展海岛旅游过程中，要特别注意对以下具体对象进行保护：
1.对环境容量的把握。海岛生态旅游开发应充分考虑到当地的环境承载力，以此为标准来控制游客量，避免对资源的过度利用和对生物资源的破坏。
2.对土壤、地貌和风光的保护。旅游开发要以保护海岛为第一要务，不得随意改造海岛地形、建造地基深的高楼，不得破坏海岛原有风光，应充分利用岛上原有的景观和风光风貌设计生态旅游的项目和设施。
3.对岛上环境卫生的保护。旅游会带来一定的垃圾危害，因此要多设置垃圾箱，还要制定规章，防止游客乱扔垃圾。
4.对岛上生物的保护。海岛由于特殊的位置和适宜的环境，适合许多生物生长，形成了独特的海岛生物圈。因此，发展旅游的同时要注重对海岛生物的保护。
5.对海岛文化风情的保护。岛上人们在长期的生活劳动中，形成了自己独特的风俗习惯、居室建筑、婚俗传统、音乐体育、待客礼仪等等。这些文化因素具有浓郁的地方风味，对外来的游客形成强大的吸引力。但是旅游开发势必会在一定程度上冲击海岛文化，因此环境保护还包括对海岛文化环境的保护。
海岛生态旅游中应注意的其他问题
海岛旅游在我国起步较晚，各种相关法律和管理制度还不够完善，因此，这方面要多借鉴国外的成熟经验。具体地，在开展海岛生态旅游的过程中，还应该注意以下几方面的问题：
1.编制生态旅游资源开发规划。海岛生态旅游资源的开发必须规划，应对海岛的生态旅游资源进行详细的调查研究，建立从可行性论证—开发规划—监督管理的科学可行的开发程序，坚决反对“一哄而上”的无规划的开发。应建立政府直接领导下的海岛生态旅游资源开发协调小组，编制具有指导意义的高起点、高标准、高水平的海岛生态旅游发展规划，以指导和协调其生态旅游资源开发工作，制止海岛生态旅游资源开发中的不良行为。
2.制定法规，加强科学管理。海岛生态旅游会不会对其生态环境产生负面影响，是弊大还是利大，这并不取决于是否开发旅游，而是取决于是否在这一过程中实现了科学的管理。要保护海岛生态环境，就要加强科学管理，而科学管理的基础在于完善的法制。因此，开发海岛生态旅游必须有切实可行的法规作保障，并加强对其生态旅游区的科学管理，做到“以法兴游、以法治游”，杜绝一切破坏海岛生态环境资源的现象。
3.完善服务设施，提高服务水平。海岛生态旅游作为一种旅游产品，旅游接待设施和服务都是不可忽视的开发内容。必须创造出可供游客逗留的环境，这既包括硬件设施，也包括软件方面的服务和管理，两者缺一不可。必须全方位地开发食、住、行、游、购、娱六大要素互相配合的项目，进行综合性的开发。
4.加强海岛生态旅游的研究和人才培养。海岛生态旅游需要高素质的专业管理人才和服务人才。应利用旅游院校、培训班、专题讲座、学术会议等各种形式及请进人才、派出学习等办法，培养一大批海岛生态旅游方面的专业人才，加强对其生态旅游理论和规划方面的研究，为海岛生态旅游可持续发展提供人才保障。