麦克阿瑟指着对面的桌子，让日本代表上来在投降书上签字。重光葵一瘸一拐地走到桌子旁坐下，慌乱地摘下礼帽和手套，结果把手杖也掉在地上。他右手颤抖地拿着笔，迟迟疑疑地好像不知道在哪里签字。
就任盟军最高统帅
日本宣布投降的那一天，杜鲁门总统给麦克阿瑟发来电报：
“根据美国、中华民国、联合王国和苏维埃社会主义共和国政府之间的协定，你被指派为同盟国的最高联合司令。你的任务是要求并接受日本天皇、日本政府以及日本帝国统帅部的正式官方代表们签署的投降文件。”
担任盟军最高统帅，负责安排和主持日本投降仪式，并对日本实行占领，这是自战争爆发以来麦克阿瑟一直在期望、争取和谋求的职务，尽管这一职务来得太晚，已经没有什么军事意义，但毕竟了却了他的一个心愿。因此，在接到任命后，他立即致电杜鲁门：
“我对您如此慷慨地给予我的信任深为感谢……战争的结局难以形容地撼动了整个东半球。我将尽一切可能充分利用这一形势，遵循您为世界和平制定的具有极大建设性的路线。”
消息传到关岛，尼米兹感到愤愤不平。在他看来，海军在太平洋战争中做出了比陆军大得多的贡献，而上述任命倒让麦克阿瑟争了头功，使他成为举世瞩目的人物，给人的印象好像日本主要是被他的部队打败的。为了挽回海军和尼米兹的面子，海军部长福雷斯特尔建议如投降仪式由麦克阿瑟主持，其举行的场所则应在一艘海军军舰上；如麦克阿瑟代表盟国在投降书上签字，尼米兹则应代表美国签字。上述建议得到杜鲁门的热情支持，因为那艘被选中的军舰正是由他女儿玛格丽特以他家乡的州名命名的哈尔西的旗舰——“密苏里”号战列舰。哈尔西在得知他的旗舰将成为具有历史意义的签字场所后异常高兴。他特意向海军学院博物馆发电，请求把1853年马休·佩里的旗舰进入东京湾时悬挂的国旗借给他。该院同意了他的请求，并派专人把旗子送来。哈尔西把这面国旗高高地挂在舰首。
麦克阿瑟受命后立即采取行动，为完成受降任务做准备。他首先为部属执行这一使命定了一个总的调子：局势还不稳定，和平还未最后实现，盟军要时刻保持警惕，不得恐吓或刺激日本人，也不要有意贬低天皇，以免激怒疯狂的日本军人。为使仍占据着大片土地的数百万日军有秩序地放下武器，他要求英、法、荷等国军队在接受日本的正式投降前，不得进军他们的前殖民地。随后，他致电东京，要求日本政府迅速派一个由高级军方官员组成的代表团到马尼拉，商讨投降书内容和美军进占日本事宜；此时，铃木首相在完成和平使命后已于天皇宣布投降的当天提出辞职。天皇责成其叔父东久迩宫组织看守内阁，并派出三位皇室成员到海外驻军司令部做说服工作，敦促日军停止抵抗。
8月19日，日本政府派出以陆军副总参谋长河边虎四郎为首的16人代表团分乘两架飞机前往马尼拉。按照麦克阿瑟的命令，这两架飞机都被涂成白色并画有绿十字标记，其无线电识别信号则是“巴丹”。因此，当日机飞临九州上空遇到十几架美机时，立即发出“巴丹”信号，美机立即回答：“我们巴丹的卫士，请跟我们来。”
这两架飞机被引航到伊江岛，然后机上人员换乘一架美军飞机前往马尼拉。傍晚，日军代表团到达马尼拉尼科尔斯机场，受到麦克阿瑟的情报部长威洛比和记者们的迎接。随后他们被护送到总司令部，沿途有不少菲律宾人向他们扔杂物，并叫喊：“八格牙鲁！”
麦克阿瑟远远看见他们到来，但没有去迎接。他责成萨特兰去接待他们，而萨特兰却拒绝和他们握手。在司令部会议厅里，双方代表落座后，萨特兰以冷冰冰的语调宣读了第1号总命令，指定各地日军应向谁投降，并告之正式投降仪式将于9月初在东京湾的一艘军舰上举行。日本代表还被命令在地图上标明其所有部队、舰只、基地和军事设施的位置。随后，双方就美军乘飞机登陆日本的计划进行了讨论。按照美方提出的计划，第一批美军将于8月23日在横滨以西20英里的厚木机场着陆。日方认为厚木不安全，因为那里曾是神风特攻队的训练基地，许多神风队员就住在附近，很可能会遇到麻烦。但美方坚持原案，并责成日方在美军着陆前撤走该地区的所有部队，拆除所有飞机上的螺旋桨，并提供到横滨的交通工具及在新大饭店安排住宿。最后，在日方的要求下，美方同意把着陆时间推迟到8月26日（后又推迟到28日），以便日方有足够的时间完成上述准备。
第二天上午，谈判继续进行。萨特兰交给河边一份美方起草的将由天皇宣讲的投降诏书，河边让翻译念给他听。当翻译刚念到第一句话——“我，日本天皇裕仁，”河边的脸就沉了下来。天皇从来不用“我”，而是用只有他才能用的“朕”。美方翻译马希比尔注意到了日本代表的情绪变化。他是个日本通，深知给天皇写那样不加虚饰的词句，对日本人来说是莫大的侮辱。因此，在日本代表临行前，他对河边安慰道：“我可以肯定，最高统帅并不是有意要在日本人心目中贬低天皇，而是例行公事罢了。”
他还告诉河边不要拘泥于美方起草的文件措词，日方可以自行“按照诏书的正式格式”来写。
外务省代表冈崎对威洛比解释说：“这是至关重要的。我真的无法向阁下解释这有多重要。”
送走日本代表后，马希比尔把上述谈话报告了萨特兰和麦克阿瑟。麦克阿瑟搂着他的肩膀说：“马希比尔，你处理得非常正确。事实上，我确实无意要在他（天皇）的人民心目中贬低他。”
他非常清楚，他可以利用日本人对天皇的敬仰而更顺利地执行占领任务。他甚至问，到东京后不知天皇是否会来拜会他。“如果他来，那将是日本天皇第一次拜会别人，是不是？”
马希比尔回答说：“会的，将军，会来的。我确信他会那样做。”
麦克阿瑟决定以驻扎在冲绳的第8集团军第11空降师作为美军进占日本的先头部队，并准备随先头部队一起乘机前往厚木。他的参谋人员坚决反对他这样做，认为这近乎一场赌博，太危险。但麦克阿瑟就喜欢冒险，执意要这么做。多年来在远东任职，使他了解了东方人的性格，他知道该怎么做。
8月28日，第11空降师先遣队在查尔斯·坦奇上校率领下，乘坐45架运输机在厚木机场着陆，受到日军大本营情报部长有末精三中将的迎接。同一天，哈尔西庞大的第3舰队缓缓驶入东京湾，包括他的旗舰“密苏里”号和英国太平洋舰队司令布鲁斯·弗雷泽的旗舰“约克公爵”号。29日下午，尼米兹乘水上飞机也来到东京湾，在“南达科他”号战列舰上升起将旗。同一天，麦克阿瑟乘坐他的“巴丹”号座机从马尼拉飞往冲绳。肯尼和艾奇伯格已在那里检查工作，准备第2天实施大规模空运。
8月30日中午，艾奇伯格率第11空降师大部队开始在厚木机场着陆，很快接管了机场。与此同时，哈尔西的海军部队在横须贺登陆，进占海军基地。麦克阿瑟在艾奇伯格出发两个小时后从冲绳起飞。他心情异常激动，手里握着烟斗在机舱里走来走去，同助手惠特尼讨论着日本的未来命运。
“很简单，”他说，“我们将利用日本政府这个工具来实行占领。”
他谈到要首先摧毁日本的军事力量，然后建立一个代议制政府机构，释放政治犯，解放农民，开展自由劳工运动，鼓励自由经济，废除警察镇压制，建立一个自由而负责的新闻制度。他还谈到要分散统治权力，赋予妇女选举权。这时惠特尼插话说：“那样日本男人会不高兴的。”
麦克阿瑟说：“我不管。我要使日本军方名誉扫地。妇女不要战争。”
说着说着，麦克阿瑟睡着了。
30分钟后，即下午2时，经过5个小时的飞行，“巴丹”号已飞到美丽的富士山上空。惠特尼叫醒麦克阿瑟，让他看富士山。
“啊，富士山，真美呀！”麦克阿瑟叹道。
接着，飞机很快倾斜，开始向厚木机场盘旋而下。惠特尼向下眺望，看到无数个防空炮位，不禁屏住了呼吸。倘若有哪个疯狂的日本兵此时开起这些高射炮，在这个射程内不可能不击中目标。然而，他的担心是多余的，什么事也没有发生。2时19分，飞机平稳地降落在机场上，军乐队立即奏起迎宾曲。麦克阿瑟口衔玉米芯烟斗第一个步出机舱。他在舱门口停了数秒钟，抽了几口烟斗，环顾了一下四周，然后像演员走向舞台中央一样，昂首走下舷梯。艾奇伯格和先到的几名军官走上前来迎接他。他握着艾奇伯格的手说：“鲍勃，从墨尔本到东京的路真是漫长，看来，这条路总算走到了尽头。”
不久，肯尼乘另一架飞机也赶到了。他的参谋人员像往常一样身上带着手枪。麦克阿瑟叫他们把枪放回到飞机上，什么武器也不带。肯尼回忆说，“这是个好主意，收到了良好的心理效果。看见我们走在他们的国土上而不带武器，给日本人留下了深刻的印象。”日本人所提供的据说是他们最好的、但实际上已破旧不堪的一队汽车正等着他们。麦克阿瑟上了一辆老掉牙的不知是什么年代生产的林肯牌汽车。开道车是一辆红色消防车，它在发动时发出一阵爆炸声，使不少人惊得跳了起来。
从厚木到横滨市区只有13公里的路程，但这短短的13公里却使艾奇伯格等人坐立不安。路两旁站着3万名全副武装的日军警卫部队，他们都背朝着车队，令美国人感到奇怪。有人说，他们这样做是按警卫天皇的方式以示尊敬。还有人说，这是为了确保不致发生任何不服从天皇停战圣渝的日本人进行射击的事件。但不管是出于什么目的，惠特尼等人始终心存疑虑：“这场面是否真的是为了表示敬意和提供保护，这里面有没有某种处心积虑、神秘莫测和别有用心的动机？”他们一路上一直提心吊胆地注视着这支令人生畏的队伍，生怕出现意外。由于日本人提供的汽车速度奇慢，途中又不断抛锚，因此20英里的路程竟走了整整两个小时。在这两个小时里，艾奇伯格说他连口大气都没敢出。