（1）种蛋的运输。鹌鹑种蛋常用小纸盒装，每盒24个，用纸板隔开，运输时应将小盒装入大纸箱中，每个大纸箱最好装满，使之没有移动的空间，然后用打包带固定住。也可采用散装的方式，在纸箱内以锯末等物作缓冲材料，一层层地放置种蛋。装卸时要轻取轻放。
运输时避免碰撞和剧烈震动，防止日晒雨淋，温度应不低于0℃，不高于30℃，运输时间越短越好，用于运输的种蛋最好是近1～2天的新鲜蛋。
（2）种蛋的消毒。常用的方法有以下两种：①福尔马林（甲醛）熏蒸法：将容器放在孵化机中央，按每立方米14克的用量加入高锰酸钾，再按每立方米28毫升的量倒入福尔马林，即可产生气体。紧闭机门熏蒸两小时即可。②新洁尔灭浸泡法：用0.2%的新洁尔灭温水溶液（温度30℃）浸泡种蛋1～2分钟，捞起沥干即可入孵。