生态工程是应用生态系统中物种共生与物质循环再生原理、结构与功能协调原则，结合系统分析的最优化方法，设计的促进分层多级利用物质的生产工艺系统。生态技术是利用生态系统原理和生态设计原则，对系统从输入到转换关系与环节直到输出的全部过程进行合理设计，达到既合理利用资源，获得良好的经济与社会效益，又将生产过程对环境的破坏作用降低到较低的水平。
将生态工程与生态技术原理应用于农业生产系统就形成农业生态工程。农业生态工程就是有效地运用生态系统中各生物物种充分利用空间和资源的生物群落共生原理、多种成分相互协调和促进的功能原理，以及物质和能量多层次多途径利用和转化的原理，从而建立起能合理利用自然资源、保持生态稳定和持续高效功能的农业生态工程。
农业生态工程技术是规划设计组装农业生态工程的工艺技术。包括农业生物的立体共生技术、食物链结构的工程技术、农—林—牧—副—渔一体化，种养加相结合的配套生态工程技术等。