沼渣含有大量腐殖质，适用于农作物底肥，特别适用于作粮食作物底肥。对农作物具有壮秆、饱籽的功能。也可提高土壤保肥、蓄水能力。沼渣含有较多的固体物，沉于沼气池底，故又叫“沉渣”。沼渣一般含有机质36%～49.9%、腐殖酸10.1%～24.6%、粗蛋白5%～9%、全氨0.8%～1.5%、全磷0.4%～0.6%、全钾0.6%～1.2%。
（1）沼渣作饲料。沼渣中含有24种氨基酸、多种微量元素、B族维生素等营养成分。利用沼气发酵残留物养猪，育肥1头猪，可节省饲料50千克左右，缩短育肥期1个月。沼渣养鱼，能促进鱼池中水体浮游生物的生长、改善水质、减少溶解氧的消耗，能减少鱼病和鱼浮头死亡、提高成活率，鱼产量可比对照增产10%～25%。还可利用沼渣养鸡、兔、鳝、蚯蚓等，均能获得十分显著的经济效益。
（2）沼渣作肥料。沼渣是优质的有机肥料，粪便和农作物秸秆经过沼气发酵后，其肥效明显提高。沼肥与化肥混合施用效果最为显著。长期施用沼肥，能有效地改良土壤。实验研究表明，土壤容重、浸水土容重和抗压强度减小，孔隙度增加，结构性系数、沉降系数增大，持水小时增强。沼肥具有提高土壤有机质含量和丰富土壤氮素养分的作用，每季作物施22.5吨/平方米沼肥，则土壤有机质年均累积增量为0.15%，全氮年均增加0.0090%。沼肥中的纤维素、木质素等可以起到松土的作用，而腐殖酸则有利于土壤微生物的活动和土壤团粒结构的形成。因此，沼肥具有改良土壤、增加地力的功效。
（3）沼渣栽蘑菇。沼渣养分全面，含有有机质、腐殖质、粗蛋白质、氨基酸、氮、磷以及多种微量元素、维生素等，完全能满足蘑菇生长的一些求。沼渣是一种人工栽培蘑菇的优质培养料，利用沼渣种菇，发菇快、菇质好、杂菌少，而且成本低、节省料、操作方便，产量比传统培养料增产10%左右。