下定决心收复台湾
北伐失败后，郑成功退到厦门，重新修理船只、制造武器、整编军队，想重新组织兵力反攻回去。和郑成功作战了十几年的清军，对他的个性摸得很清楚，断定他还会再度举兵进攻的。因此打算先行下手，彻底地消灭郑成功在厦门的势力。
当年三月，清政府命安南将军达素统率大军，另派施琅、黄梧在浙江、福建、广东沿海集结军队待命。五月十日，清军从漳州和泉州两港出发攻打厦门。郑成功亲自率领将士在海上和清军作战，结果清军惨败，安南将军达素引咎自杀。
自从清政府实行迁界政策以后，郑成功从沿海各地，已经没有办法得到粮食和其他物资了，郑家军出现了严重的物资危机。北伐南京的失败，致使郑家军损失惨重，必须找个根据地休养生息。这时，郑成功想到了父亲年轻时曾经避难到过的一个地方，就是位于福建东南方领土广阔的海岛台湾。台湾在明天启四年（1624年）被荷兰殖民主义者霸占了。郑成功以前就想把它收复回来，但是一直与清朝作战，根本没有剩余的兵力与荷兰殖民主义者作战。更重要的一点是，郑成功压根对台湾的地形、环境都不了解，不能制定正确的作战方略。但目前的形势对郑成功而言，收复台湾是迫在眉睫了。
恰好这时发生了一件事，让郑成功解决了这个难题。当时占领台湾的荷兰总督揆一，派一个叫何斌的中国人来见郑成功，希望能和郑成功通商，郑成功答应了。而后郑成功委托何斌在台湾收税，结果这件事被荷兰殖民主义者知道了，逼着何斌把所有的税都交还给荷兰殖民主义者。这件事使何斌非常生气，因此他就偷偷地画了台湾的地图，图上有良田万顷以及各条河流的小道，还有许多森林树木。何斌把地图带到厦门献给郑成功，劝说郑成功攻打台湾。他说，台湾领土广阔、土地肥沃，可以生产足够的粮食，而且森林树木品种繁多，可以作为造船的材料。况且你父亲过去曾在台湾居住过，那里就相当于是你的故土，如果你能够占领台湾，就能解决郑家军的粮食问题。而且台湾四面是海，清军处于劣势无法前来攻打。你还可以从事国际贸易，自给自足，这样你的实力必然大增。郑成功听了他的建议，非常高兴，就开始认真考虑以台湾为根据地的可行性。
从另外一方面来说，郑成功的部下长年过着离乡背井、漂泊海上的生活，早就盼望着能安定下来。而当时人烟稀少的台湾急需有人去开垦。为了解决迫在眉睫的粮食问题，郑成功决定把军队带到台湾去。于是就召开会议，和部将们商议迁往台湾的事宜。
在会议上，部将们听说郑成功准备迁往台湾，许多人表示不同意，其中以吴豪反对声浪最高。因为他是郑成功的将领中唯一到过台湾的人，他对台湾的情况最为了解。他说：“台湾那儿的港口很浅，军队现在使用的这种较大的船只根本进不去。况且台湾的阳光长年直射，天气又热又潮湿，瘴气很大，我们这些长期生活在内陆的人很难适应那儿的环境，会造成水土不服。还有占领台湾的荷兰殖民主义者，他们的武器十分先进，恐怕不是我们的军队可以抵挡的。”因此，他再三劝说郑成功慎重考虑。一些将领很赞同吴豪的看法。
郑成功的手下将领中，凡是从清政府那投降来的称为“北将”，从福建来的原本是郑成功旧部的都称为“南将”。可是，这一次反对到台湾的多半是南将，而北将却是大都赞同到台湾去。
有一个叫马信的北将就十分同意去台湾。他在会议上极力反驳吴豪说，荷兰殖民主义者的枪炮也没什么值得害怕的。如果真的尽了全力还是打不过荷兰殖民主义者，就再回到金门和厦门也不为迟。
对于马信反驳吴豪的话，郑成功感到非常欣赏。事实上，后来攻取台湾的时候马信确实建立了很大的功劳。他率领郑家军的主力军队，将武器先进的荷兰军队打得溃不成军，因此军中都称他“马本督”。马信还因为这一场国际战争扬名世界，外国人都称他为“BePontok”。马信去世后，当地的百姓给他建了一座庙，就是现在台南市的“马公庙”。
看到争论不休的场面，参军陈永华出来打圆场。他说，你们都有各自的道理。吴豪是因为对将军和部下很爱护，担心那儿的环境不适合大家。马信所说，是作为军人应有的态度，凡事尽力而为，然后再作定夺。
为什么会有如此大的分歧呢？这是因为郑成功和父亲郑芝龙一样，不仅领兵作战，而且还从事商业活动。他的那些旧部都做过生意，拥有一定的财产和社会关系，他们虽然想有一个安定的环境，但是却不愿意离开自己的老本营到荒无人烟的台湾去，而从清朝降过来的那些将领，却想到台湾开拓新天地。
因此，在这次会议上，究竟去不去台湾并没有得到定论。会议过后，性格倔犟的吴豪再三劝说郑成功，郑成功对此很不高兴。后来郑成功在攻台湾时，就以吴豪抢劫老百姓的金钱、私藏粮食等借口，把他给杀了。
没过多久，这时仍在长江上游驻守的张煌言，听到郑成功的这个想法，连忙来信表示反对。他认为郑成功如果退守台湾，就会与大陆失去联系，会令天下的老百姓都感到失望。张煌言之所以力劝郑成功不要去台湾，就是担心郑成功去台湾后对光复明室就不会那么出力了。甚至于他还害怕郑成功到台湾后自立为王。不只是张煌言，许多人对郑成功去台湾都抱着怀疑的态度，郑成功对迁往台湾承受很大的压力。
郑成功却认为前往台湾是解决当前困难最好的办法。但是部将们意见不统一，让他十分为难，于是他费尽心思想了一个办法。
郑成功给了何斌一笔钱，暗自命令他回台湾到一些荒山野地中布置神迹。于是，何斌立即回到台湾操作起来，并不断散播关于神迹的谣言，那些谣言一时之间广为传播，没多久就传到大陆了。这些神迹的谣言有，在现在高雄凤山滨海的地方，有一块很大的石头。有一天石头突然自动裂开，上面墨迹斑斑，写着斗大的字：“凤山一片石，堪容百万人。五百年而后，闽人来居之。”
还有一个传说，住在安平的一位农夫，正在犁田的时候，忽然发现一块石头上面刻着“山明水秀，闽人居之”。又有人传说，在澎湖的山上也看到“闽人来，万民泰”的字迹。
最初，郑家军对这些谣言不是很相信，但是传的人愈来愈多，还愈说愈起劲，他们自然也就愈听愈心动了。郑成功这个计策果然奏效了。一段时间以后，许多部将都改变主意，纷纷表示愿意到台湾去。
郑成功带着庞大的军队和招来大量的内陆百姓开垦台湾，开创了海岛经济的模板，才有了台湾今天的繁荣富强。郑成功在确立台湾属于中国的主权上功不可没。
奋勇抗战除荷虏
郑成功下定决心要攻打台湾，因此就开始储备粮草、练兵造船、侦察敌情等准备工作。还制定了周密的作战策略，即首先收复澎湖作为进军的根据地，然后通过鹿耳门港在台江登陆作战，并切断荷兰军建造的军事基地台湾城与赤嵌城的联系，并将其一一歼灭，再收复台湾全岛。
永历十五年（1661年）二月，郑成功率领将士们在金门举行隆重的誓师仪式。在二十三日，郑成功亲自率领第一支队伍从金门出发向台湾海峡前进，次日到达澎湖列岛。郑成功知道距台湾最近的澎湖军事位置十分重要，便把这儿作为根据地，留兵驻守，他则继续率大军前进，不料，海面上一连好几天都刮着暴风，眼看不能按预定时间到达鹿耳门港，郑成功便决定强渡。
为什么必须在预定时间到达鹿耳门呢？这里要先来说说郑家军所用的船只。
郑成功的海上军事力量一直胜过清军的一个重要原因，就是郑成功拥有非常坚固和利于作战的福船。当初戚继光对付倭寇就是使用的福船。福船要比当时日本人所造的船更加坚固、高大，因此福船也是海战中最有力的武器。
明末清初最好的船只可以分为福船和广船两种。福船就是福建生产的，因为当地有制作船只所需的优质木材和良好的工艺。与体积庞大笨重、种类单一的广船相比，福船根据船的大小有好几种，其中最大的福船称做大福船，适于在海洋中航行。但是过于庞大的船只在作战时反而不方便，因此较小的福船（分为哨船和冬船两种），就是用于作战的船只。其中还有更小的称做鸟船和快船，这是用来侦察敌情、协助哨船和冬船作战，或者是突击敌方的。在军事上，福船非常符合作战的需要，而长期驻守在福建沿海的郑家军所用的船大部分都是福船。
如果福船在五年之内没有好好地保养修理，将会全部腐烂。郑成功收复台湾后却始终没有找到适合制造福船的木材。而清政府当时实行迁界政策，禁止任何木材运往台湾，郑成功只好向日本、南洋等地去寻求制造福船的才料。即使能够买到，但是运费昂贵，使得制造成本提高了好几倍，经济上的负担极为沉重。同时也缺乏精于造船的技术人员。这对郑成功来说，在后来与清政府的对抗中是极为不利的。
介绍郑家军的所用船只，是因为鹿耳门的水位非常浅，郑家军所用的福船体积较大，在一般情况下是无法通过鹿耳门港的。要想顺利进入鹿耳门，必须利用每月初一日或十六日的大潮，如错过时机，就要向后推迟半个月。因此郑成功的军队必须在预定的时间内到达。
郑成功亲自率船队冒着暴风横渡海峡，终于在四月一日到达鹿耳门港外。郑成功之前已弄清楚了从鹿耳门到赤嵌城的路线，于是他先派出一小队人进入台江内海侦察荷军情况。鹿耳门潮涨后，郑成功命令军队迅速通过。顺利通过鹿耳门后，立即兵分两路，一路登上北线尾；一路驶入台江，准备在禾寮港（今台南市禾寮港街）登陆。
荷军的战略基地台湾城、赤嵌城位于台南市。这里海岸曲折，两城之间有一个内港，叫做台江。荷兰军曾在北线尾岛（位于台江海中）北端建有热堡，后来在一次台风中倒塌后便没有再驻军。荷兰军认为郑成功的军队一定会从南航道驶入。他们决定利用所处的险峻地理位置，再用舰船封锁南航道海口，与台湾城、赤嵌城的炮台相配合，就可阻止郑军登陆。想不到郑成功的军队从鹿耳门驶入台江，这样就远在荷兰军大炮射程之外。荷兰侵略者面对浩浩荡荡的郑军船队束手无策。郑家军按照之前制定好的作战策略，迅速切断了台湾城与赤嵌城荷军的联系，准备从侧背进攻赤嵌城。在北线尾登陆的一支郑家军驻扎于鹿耳门，以牵制荷兰侵略军兵船。
台湾当地的汉族和高山族百姓见郑家军到达，不仅热烈欢呼，还大力支援，为郑家军的顺利登陆创造了条件。
荷兰殖民者首领揆一迅速展开对郑家军的攻击。凭借着荷兰军的坚船利炮分三路进攻，一路战舰向台江进攻；一路由贝德尔上尉率兵向北线尾的郑家军进攻；一路由阿尔多普上尉率兵增援赤嵌城。郑成功也调整了部署，命部将王大雄、陈蟒率兵控制鹿耳门海口，以便接应第二批到来的郑家军；令陈泽率兵防守北线尾一带，以保障主力侧后安全，并置台湾城荷军于腹背受敌的境地；另派一支军队监视台江江面，切断赤嵌城与台湾城的联系，为从海、陆两面打败荷兰侵略军做好准备。
在北线尾，陈泽率大部兵力从正面迎击，另派一部分兵力迂回到敌军侧后两面夹击。贝德尔指挥的荷兰军顿时手足无措，许多人甚至还没有开火便把枪丢掉落荒而逃了。南路增援赤嵌城的荷军，也被郑军打败。这时赤嵌城的荷兰守军力量单薄，处境十分危急。郑成功随即加紧对赤嵌城的包围，同时劝赤嵌城守军将领投降。没多久就收复了赤嵌城。
台湾城是荷兰殖民者在台湾的统治中心，城墙坚固，枪炮先进，防御设施非常完备。但是赤嵌城被郑成功占领之后，台湾城已是一座孤城，城内缺粮、缺水，荷兰军处境十分困难。郑成功几次写信给揆一，让他主动投降，揆一坚决不降。郑成功调集大炮摧毁了台湾城大部分防护墙，荷兰军于城上集中枪炮还击，并出城抢夺郑家军大炮，被郑家军弓箭手击退。但是台湾城城池坚固，一时难以攻下。郑成功一方面派遣提督马信率兵围困荷兰军，一方面把剩下的兵力派去开荒。
五月，荷兰殖民当局得到荷兰军在赤嵌城战败和台湾城被围的消息后，匆忙派兵支援，均被郑家军打败。台湾城的荷兰军被围数月，军粮得不到补给，士气低落，不愿再战。十月，揆一为了挽救即将战败的命运，企图与清军勾结夹击郑成功。揆一的使者到福建后，清军要求荷兰军先派战舰帮助他们攻打厦门，然后再解台湾之围。结果揆一派出援助清军的军队逃走了，勾结清军夹击郑军的企图完全落空了。荷兰士兵为求活命陆续向郑军投降。这时郑成功开始转守为攻。
之前，郑成功为了攻下驻守热兰遮城堡的荷兰军，增建了三座炮台。反守为攻后，郑成功首先下令猛烈攻击热兰遮城堡，随后便攻下了。于是利用热兰遮城堡居高临下的地理位置向台湾城猛烈轰击。揆一在城上督战，看到城防已被突破，走投无路，只得同意与郑成功谈判。经过会谈，揆一“愿罢兵约降，请乞归国”。
被荷兰殖民主义者占领了三十八年的台湾，终于光复了！
郑成功曾对部下说：“感谢苍天有眼，让我得到台湾这样一块地方。能够在这里开垦耕种，这就是所谓的天无绝人之路吧！现在有了台湾，我们可以先把军队投入农业生产，使自己在粮食方面能够自给自足，然后再做光复明室的打算。”
郑成功收复台湾以后，首先需要解决的就是粮食问题，于是定下了寓兵于农政策，并立即着手实施。他带着何斌、马信、萧拱辰以及几百名士兵，先后到新港、麻豆、目加溜湾等地去巡视，最后回到安平宣布了寓兵于农的政策。所谓寓兵于农，就是为农者七，为兵者三。平时无战事的时候士兵就作为农民，一旦有战事立即回到军中。当时郑成功的屯垦区大多在现在的彰化、嘉义、台南、凤山一带。在台湾浊水溪的北方，以及淡水一带很荒凉，人迹罕至。台南市周围则被当地的百姓开垦过了。
当时的郑家军总共还不到十万人。在这些人中，大部分都有军事任务，不能参加开垦荒地。由于人手不足，郑成功开始派部下大做宣传，希望沿海不能保障生活的百姓，都可以到台湾来耕种土地。在郑家军的大力号召下，吸收了十余万从大陆来的百姓，他们对发展台湾农、渔业是功不可没的。
在台湾发展的过程中，郑成功的部下也发挥了不能忽视的作用，其中就有一个名叫陈永华的人。他是之前为守同安城而战死的将领陈鼎的儿子。陈永华在父亲殉难之后，就投奔了郑家军。
陈永华聪明过人，善于运筹，明智果断，有“小诸葛”之称。郑成功也非常信任他，来到台湾后，有关军政农教措施也多采用陈永华的建议。
实行“寓兵于农”的屯田政策就是陈永华提出的，这个政策使人人各尽其能，发挥最大的人力发展农林业。教百姓种植甘蔗，生产食糖，再将食糖远销国外，发展了台湾糖业，大大增加了税收收入。
在迁界政策中，那些丧失房屋财产、流离失所的沿海居民听说移民台湾的人，生活比他们安定、富足，因此都愿意到台湾来。陈永华就给他们以优待，吸引更多的大陆居民迁到台湾。每年渡海而来的有好几万人，使开发台湾的人力大量增加。陈永华又设立学校，发展教育，并从大陆请来许多饱学之士做教师。
这样，郑成功不仅解决了粮食问题，还扩大了自己的军事实力，为以后的战争做足了准备。
壮志未酬身先死
郑成功收复台湾的这一年，也是他生命的最后一年。当年的五月他就病逝了，正值39岁的英年。郑成功的去世，虽然是因为对台湾的水土不服以及长年作战劳累生病所致，但深究的话，君亡、父死、子乱都是导致他如此年轻就去世的原因。
郑成功在南京之役中失败的原因之一，是围剿李定国军队的南下清军及时赶回来增援驻守南京的清军。在此之前，李定国的西南战场连连败退，永历帝被清军逼到缅甸。后来，明朝降将吴三桂攻入缅甸，永历帝被俘，就在这年的一月被绞死在昆明。郑成功得知永历帝的死讯后，悲愤万分，恨透了清政府。
同是这年的一月，清政府看到郑成功已经退守台湾，很难依靠武力打败他，而且他又拒不投降，留下郑芝龙已经毫无用处了，就干脆把郑芝龙及抓获的郑家人都处死了。处死郑芝龙的地方就是北京的“柴市”，也就是宋朝文天祥殉国的地方。
不久，在台湾的郑成功就得到了北京传来的消息，知道父亲被害，全家无一幸免。虽然这是意料中的事，但是身为人子，得知父亲死讯，像是万箭穿心，简直痛不欲生。郑成功沉痛地向大陆方向大声喊道：“父亲，如果您当初听我的劝告不要投降，怎会有今天的杀身之祸呢？您当初为何轻信他们，否则也不至于身死异乡，不得善终啊。”所有的郑家军都随着郑成功披麻戴孝，向郑芝龙的亡灵祭拜。
父亲被杀害后，郑成功与清政府不仅有国仇，还有家恨，因此他决定忘记悲痛，努力扩充自己的实力。郑成功是一个非常积极的人，不论遭遇到任何艰危险阻或处于任何的逆境，他总是充满了雄图壮志，绝不灰心丧志，向环境低头。
郑成功收复台湾后，打算发展海岛贸易。第一步就是与现在的菲律宾通商，因此他先派了使者到那去。郑成功希望能够取得更多东南亚边缘的岛屿后再向北向南发展，成就一个更壮大的海上势力。
当时的菲律宾称为吕宋，是西班牙在远东的一个据点，他们希望以菲律宾为根据地，来发展远东的贸易。菲律宾的华侨非常多，他们的勤奋对西班牙的商业，有着很大的帮助和影响。但是西班牙又害怕华侨势力壮大后发生叛乱，就迫害他们，当时发生了好几起集体屠杀华侨的惨剧。
郑成功童年的时候一直生活在国外，小的时候就感受过华侨的不公平待遇。后来，郑成功一直活跃在沿海地带，他深深地了解华侨在国外所受到的不平待遇，知道华侨在国外没有政府保护，独自奋斗的痛苦。因此他对在菲律宾遭受凌辱的华侨非常同情和关心，对西班牙的行为特别愤慨。他知道西班牙人在菲律宾岛并没有多强的军事力量，于是就有了攻取菲律宾的打算，并借以扩大自己的军事力量。
对于是否攻取菲律宾，在郑成功的将领中有两派意见。颜望忠、扬祥等人非常积极地希望郑成功能够攻打菲律宾；但是冯锡范却认为最好不要这么做，他认为首先是师出无名，这样会给外国人留有郑家军是侵略者的印象；其次是扰乱地方，派兵攻打菲律宾，可能对当地的华侨一点好处都没有；还有就是鞭长莫及，难以长期把守。但是郑成功还是希望能攻下菲律宾，他决定先派一位使者前去考察一下。
郑成功在厦门时，有一位意大利的传教士为他工作，这个人的中文名字叫李科罗。李科罗聪明机智，而且口才很好，他懂好几国的文字，会说好几国的语言。郑成功对他非常的礼遇，深得郑成功的信任。当时郑成功和西方人交涉事务时都询问他的意见。
郑成功派李科罗做他的特使，出使菲律宾。李科罗的任务，表面上是到菲律宾向当地的西班牙人劝他们向郑成功纳贡，而私底下则是秘密地鼓动当地的华侨，起而反抗西班牙的统治者，郑成功准备派海军来和他们配合。
不料这件事没能做好保密工作，被西班牙殖民者知道了。西班牙殖民者下令整个马尼拉（菲律宾首都）进入戒严状态。西班牙殖民者威胁当地的华侨要把他们集体屠杀，使得华侨们惊恐万状，纷纷作逃命打算。
这时有一艘从马尼拉到台湾的船，有人把情况告诉郑成功。郑成功大为震怒，他终于下定决心要攻取菲律宾。以他当时的实力，也许能够成功地把西班牙势力驱逐出去。遗憾的是，还没有出发他就病逝了。
郑成功的去世，对菲律宾岛上的西班牙人来说，是一件非常值得高兴的事，因为菲律宾能够派出作战的人，只有两百名西班牙士兵和四百名的土著，根本无法和郑家军相抗。当时在马尼拉有一位传教士，他记载了西班牙殖民者焦急的心情，他是这样描述的：
“中国是非常厉害的一个民族，他们比西班牙人更能克服困难。我曾听说，五个兵中间就有一个厨子，所以他们都吃得很好。组织非常严密，他们的长官都记得每个兵士的名字。这种勇敢善战的军队，人数又这么多，如果真的来攻打菲律宾的话，真是不堪设想。以现在菲律宾的形势来说，至少需要六千名兵士才能抵抗。可是目前的武力，恐怕连十分之一都不到。”
君父皆亡，使郑成功的病更加严重了。这时又发生了一件令郑成功无法忍受的丑闻，就是他生平最痛恨的通奸、乱伦之类的事情。
原来，郑成功的大儿子郑经给他生了一个孙子，取名为克臧。郑成功知道自己有了孙子，非常高兴。可是不久后他竟得知，孙子并不是郑经的原配夫人所生，而是郑经和郑家的乳母陈氏私通而生的。
郑成功是一个道德观念非常强的人，他曾经颁布过一道命令，凡是有人通奸的，通奸双方都要被处死。在中国的礼法中，乳母是八母之一（嫡、继、养、慈、嫁、出、庶、乳）。郑经这样做，完全是违背了伦理道德。郑成功万万没有想到，如此伤风败德的事情竟然发生在自己的家里。知道这件事后，他急怒攻心，病情更为沉重。
五月八日，病入膏肓的郑成功，穿好明朝的官府端坐在椅子上，开始念太祖遗训，念到第三章的时候，他泪如雨下，悲痛地说：“自国家飘零以来，枕戈泣血，十有七年，进退无据，罪案日增，今又屏迹遐荒，遽捐人世，忠孝两亏，死不瞑目，天乎天乎！”说完这句话，他激动地顿足抓头（另一说为抓面），近乎疯狂状态，不久就倒地身亡了。壮志未酬身先死，长使英雄泪满襟。悲剧英雄郑成功的一生有太多的遗恨。
对于这个伟大的民族英雄，最重要的功绩当然是驱除荷兰殖民者，收复台湾。他维护了国家领土和主权的完整，保障了国家安全，维护了人民利益及民族尊严。收复台湾后，他顾不上作战的疲劳，又投入到对台湾的建设中去。在发展台湾的过程中，不仅开荒种田，同时发展各种产业，大力发展教育，使台湾人民不只是生活上富足，知识修养也大大提高。
另外，郑成功费尽大半生心血是为了打败清政府，光复明朝。也许在今天看来，这点似乎阻碍了中国的统一。但是在当时那个时代，清朝的建立是外族人霸占了汉族人的家园，郑成功是为了夺回自己的家园而战，这种精神是伟大的，是值得后人永远学习的。