公元前47年，恺撒在埃及停留前后达九个月之久。或许是因为打了十年的仗，他想歇歇了。
就在这时，忽然小亚细亚传来军书，恺撒派驻在小亚细亚的将领卡维纳斯报告说，米特里达梯的儿子法尔纳塞斯与兵作乱，已夺回本都、小亚美尼亚、卡帕多西亚等地。卡维纳斯的兵力不足，屡遭败北，情势非常危急。
恺撒接获战报后，于当年六月亲自率领大军离开埃及，赶往小亚细亚去平乱。当年八月，恺撒大帝和法尔纳塞斯的军队发生激战，恺撒军以锐不可当的气势，一举将法尔纳塞斯击溃，平定了米特里达梯王的叛乱。
恺撒在小亚细亚获胜后，致信给罗马的友人，信上有这么一句名言——我至，我见，我胜。
接着，恺撒立刻返回罗马。他发现留守罗马的安东尼才干不足，没有充分的统治能力，因此，罗马城内一片混乱。
恺撒面临的首要问题，就是倾注全力以恢复罗马的秩序，并且使元老院能够正常地召开会议，其次是设法减轻无产市民的经济负担，以平抑其不满情绪。
这时候，恺撒得知一些退役老兵发生了暴动，他们所持的理由是没有获得应得的报酬。
恺撒的口才虽然不像西塞罗那样充满热情、智慧和修辞的锋利，但他独创了一种简洁、精练，而且雄壮动人的风格，他的辩才仅次于西塞罗而已。
恺撒再一次发挥了他雄辩的才能，他冷静地称呼他们为“各位市民”，并向他们解释说，他们已经退役而不再是士兵，当然就不能向政府要求军人的待遇。这些退伍老兵经他这么一说，也就无言以对，一场暴风雨就此平息。
在非洲方面也有动乱。在法萨罗平原一役中，战败逃亡的西庇阿（庞培的岳父）曾汇集了一部分残余部队远赴北非。另一败军之将加图也逃到了非洲。双方会合在一起，拥有步兵3.5万人，他们依然野心不减，还想东山再起呢！
非洲的努米底亚王名叫犹巴，他本想置身事外，不愿卷入罗马人的政治纷争中。但是西庇阿和加图大军压境，他又无力反抗。
就这样，西庇阿和加图在努米底亚盘踞下来，而且居然在非洲成立了流亡政府，也设有元老院。由元老院任命加图为最高统帅，西庇阿则从旁协助。恺撒当然不能眼看着他们在非洲势力壮大，何况西班牙也传来了叛乱消息。恺撒计划先解决了非洲问题，再去西班牙平乱。
在元老院中，恺撒把当前的情势作了一番详尽的分析，接着，宣布了自己的计划和步骤。
当时，元老院中有人提出质疑说：“远征北非和西班牙都得飘洋过海，我们哪儿来这么多的船只呢？”
恺撒微笑着回答说：“阁下的顾虑确实很对！大军渡海远征，自然非有大量船只不可。关于这件事，我早有安排，我在埃及的时候，曾命人在小亚细亚制造了大量的船舰备用，只要一个命令下去，就可以调集到我们的南方港口来。”
因为恺撒已有缜密的计划、周详的安排，因此，元老院就立刻批准了他的请求，让他率军去远征。
恺撒进攻非洲的路线是，先从意大利的南方渡海，经西西里岛，在地中海的南岸登陆。
公元前46年春，恺撒亲自率领庞大的船队，浩浩荡荡地渡海出发了。步兵、骑兵数万人，加上马匹、粮草、器械、给养等，载满了几百艘船只，它们迤逦前进，煞是壮观。当他们驶经西西里岛时，见到岛上安宁如常，于是继续扬帆开航，不久，就抵达非洲的北岸。
恺撒率军登陆后，命令船队分批回航，以便源源不断地补充给养。
当时非洲的土著部落尚未开化，个个凶暴强悍，视杀人为家常便饭。恺撒的军队往内陆推进时，必须步步为营，时时警戒，一不小心，就会遭受土人偷袭，造成无谓的损失。 这些从未到过蛮荒地带的罗马将士既恐惧又惊奇，那些罕见的飞禽猛兽，以及各种怪异的花卉果实都令他们目不暇给、心花怒放。
西庇阿和加图听说恺撒居然率领庞大舰队渡海来征讨，不免慌了手脚。西庇阿究竟经验丰富，论胆识或智慧都超过那一伙人，他不得不故作镇定地安慰他们说：“这一仗是免不了的！不把恺撒解决掉，我们就回不了罗马。如今他自己送上门来，正好趁此机会解决问题。” 有些人心里没底，于是反问他道：“我们身处蛮荒地带，万一败了怎么办？你有没有万全之策，保证我们能获得胜利！”
“关于这一点，我在几天前就已经计划好了。”西庇阿胸有成竹地说。
“那就请你说出来让我们听一听，也好使大家安心。”
“我的计划是这样的，你们大家都知道塔普苏斯这个地方非常险要，对不对？我准备把我们的主力集中在那里，储存好足够的粮食。因为塔普苏斯四面环山，只有一条羊肠小道往北方，恺撒的骑兵根本派不上用场，即使他以步兵通过，我们只需在峡谷地带设下埋伏，保证可以将他们歼灭，使他们有去无回。”
大家听了西庇阿的一番分析，极感振奋，加图尤其精神抖擞，立刻下令，派人前往塔普苏斯去构筑工事，准备据险顽抗。
恺撒派出的侦察人员得知了西庇阿的企图，飞快地向恺撒报告。恺撒不加迟疑，他要先发制人，使敌人措手不及。恺撒挑选精壮军士，配以轻装备，经由土著向导的带领，翻山越岭，并穿过茂密的丛林，很快地到达塔普苏斯谷地。一声令下，恺撒的士兵以雷霆万钧之势冲杀下来，那些构筑防御工事的敌军以为是天兵下降，只好举手投降。
在这同时，恺撒亲率大军进击西庇阿的旧巢穴，杀得敌人措手不及，只得仓促应战，无奈西庇阿的军士们全无斗志，只管逃命。
这一仗恺撒赢得非常轻松，西庇阿的几万步兵和骑兵顷刻间被杀得溃不成军，西庇阿也在战乱中阵亡。
加图率领小部队逃到了乌提卡城，他的部下希望继续抵抗恺撒，但是加图知道大势已去，他给那些企图逃命的人发放路费，同时劝自己的儿子向恺撒投降。而他自己既不准备逃命，也不愿在恺撒统治的世界中苟存，后来自杀身亡。
庞培的儿子只身逃往西班牙去投靠他的弟弟；犹巴王回到努米底亚时为部下所拒，他走投无路，用自杀结束了生命！
从此，北非的动乱宣告结束。这是公元前46年4月间的事。
恺撒任命萨卢斯特为努米底亚总督，重新划分了非洲。当年的七月，恺撒重回罗马，元老院推举恺撒为独裁官 ，任期是十年。这种情绪在罗马还是破天荒头一遭。
八月间，元老院为了表彰他的功勋，特授予他空前的殊荣——举行四个凯旋式：高卢的胜利、埃及的胜利、平定法尔纳塞斯之乱，歼灭北非庞培的余党。
恺撒的凯旋大游行，场面壮观威武。大会堂前面的广场上，聚集了好几万群众，争睹英雄的风采。
号角长鸣后，恺撒出现了。他头戴金盔，身着闪闪发光的监甲，腰佩短剑，神采奕奕地骑在骏马上，率领着他的部将们绕场一周。这时候，数万群众齐声欢呼，数里之外犹清晰可闻。在历史上，这是罗马历史上空前的盛况。
在北非战役中，庞培的长子只身逃往西班牙，因为他有个兄弟在西班牙，广植私党，势力渐渐壮大，最后竟把恺撒派驻在西班牙的副司令逐出西班牙国境。
这兄弟俩都是庞培的前妻所生，虽然从名分上说他们是恺撒的外孙，实际上并无血缘关系。他们一心只想为父报仇，也顾不得恺撒是他们名分上的长辈了。
由于这两个后生小辈在西班牙兴兵作乱，愈来愈猖狂，以致恺撒不得不在当年的冬季，亲率大军前往西班牙平乱。
大军在西班牙登陆后，立即派出侦察兵去搜索敌方的主力，侦察回来的情报说，庞培的两个儿子集结数万残党盘踞在孟达城。
恺撒当年曾经一度率兵到西班牙去平乱，因此，对西班牙境内的各种情况非常熟悉，有关山川险阻、港湾、街要，以及交通、地势等等，莫不了如指掌。
恺撒在战略上一向讲求直截了当、速战速决。
公元前45年3月，恺撒亲率大军直逼孟达城下，本想一鼓作气把孟达城攻占下来，却不料对方事先已有准备，早已预先在郊外的丘陵丛林中设下埋伏。当恺撒军正在猛烈攻城时，却被埋伏的敌军从后面掩杀过来，使得恺撒军腹背受敌。
恺撒不愧为一代名将，他一看情势不妙，立即下令所有的部队密集一处，形成一处坚固壁垒，避免力量分散而被各个击破。
作战时，将士拼命固然重要，但最重要的是主帅的统御指挥。主帅必须镇静、睿智，判断准确，并且还要有卓越而丰富的军事知识，才能临危不乱、化险为夷，以最少的牺牲换取最大的战果，进而赢得最后的胜利。恺撒的军事天才一直受到后人的推崇，就以孟达一役来看，他确实是当之无愧！
当时城内城外的敌军，本以为恺撒军必被击溃无疑，却不料对方的队形陡变，形成一个坚强的壁垒，如同钢铁的碉堡一般，不免大惊失色，昂扬的斗志萎缩了一半。恺撒见到敌方正在犹豫、旁徨，不知如何应付的窘态，怎肯放过机会？他一声令下，分兵两路去攻打腹背的敌人。恺撒本人身先士卒，反复冲杀，军士们见到主帅亲自去冲锋陷阵，因此，个个奋勇争先，以一当百地把敌方杀得落花流水，抱头鼠窜，没命地逃跑。
孟达城被攻陷时，庞培的次子当场战死。几天以后，他的哥哥在逃亡的途中被手下杀死，提了首级来向恺撒邀功。恺撒慨叹之余，命人将其厚葬。
这次战役，罗马军队虽然在中途遭受伏击，但由于恺撒当机立断，扭转颓势，转败为胜，恺撒军只折损了一千多人，却击败了敌军数万人，平了西班牙的叛乱。
从此以后，罗马进入了一个安定和平的时期。这也是罗马最力强盛的时期。
执政生涯
公元前45年10月，恺撒回到罗马。这时候，他所开拓的疆土广阔，横跨欧、亚、非三洲。东起幼发拉底河，西至西班牙；北面占有高卢，南面占有整个北部非洲。恺撒对国家的贡献不能说不大。
当一个人的功绩达到顶峰时，往往毁谤和厄运也随之而来。罗马人对于恺撒毁誉参半。有些人认为他对庞培一家人手段过于毒辣，为什么要赶尽杀绝，连根拔除呢？
公元前44年2月，元老院任命恺撒为终身的独裁官，并兼监察官、司法官等要职。依照罗马的传统，贵族是不能充任护民官的，事实上，恺撒早就兼有护民官的实权了。而且，当时人们又给他加上一个至高无上的尊号，称之为“恩彼洛”，意思是至高无上，实际上就等于是罗马的皇帝了。
基于这一点，又有人担心恺撒集大权于一身后，会废除共和政体而实行君主专制。这种顾虑倒也是合乎常情的。
恺撒本人一向是平易近人，喜欢接近民众，他虽出身于贵族，却一直以平民派领袖自居，始终为广大的平民请命，尽力为他们谋求福利。
恺撒自从被任命为终身独裁官后，更是小心翼翼力求表现。他曾致力于调和贵族与平民间的不平等，而且如今又表现出大度宽容的磊落襟怀，凡是过去与他为敌的人，一律明令赦免，不予追究，并恢复其原来的职位。例如，他的好友卡西乌斯就曾一度和恺撒的敌对派结合在一起，但是恺撒则不计前嫌，仍然任命卡西乌斯出任大法官，有制订法律的权力，地位仅次于执政官。
恺撒经常说：“战争是出于万不得已，战争不但不能消除怨恨，反而会造成新的仇恨。人与人之间本该和平相处，如果一味恃强凌弱，那么怨仇越结越深，永无了期。作为一个政治家，应该有这样的认识，才能为民造福，不负国人的期望。”
恺撒宽恕政敌的仁厚作风，赢得不少的彩声，就连西塞罗也称赞不已。
过去恺撒和加图的妹妹塞西莉亚有过一段恋情，盛传布鲁图斯就是她和恺撒所生的孩子。布鲁图斯幼年丧母，加图就把这个外甥收养在自己身边。
加图是一位著名学者，他长时间生活于公众关注之外。很少在公众场合出现，但是当他出现在论坛上时，他的演讲和修辞学技能得到最高的称赞。他视布鲁图斯如己出，亲自教导他，把自己所学全部传授给这个职颖而力求上进的少年。不久，布鲁图斯就精通法律与军事，对希腊文化和拉丁文均有很深的造诣，后来娶了他表妹波蒂亚（加图之女）为妻。
布鲁图斯从小就被寄养在舅舅家里，他的学识也是舅舅一手教导出来的，所以一直对舅舅敬爱有加。当他获悉舅父兵败自杀时，内心的哀恸久久难以平复。
恺撒虽不敢明显地对布鲁图斯表露出父爱，但是言谈举止间却掩饰不住那份出自真诚的情感，布鲁图斯自然也体会得出来。
这种关系真是微妙！布鲁图斯究竟知不知道自己的身世，外人难以臆测。不过，由于舅父之死，他对恺撒始终难以释怀。也许他知道自己的身世，而痛恨恺撒诱奸他的母亲，使他背上私生子的丑名。当恺撒提拔他出任大法官时，他虽勉强答应，但他对恺撒并不曲意逢迎，由此可见他是一位正直的青年。
如今各地战乱都已平定，恺撒想起了埃及的恋人——克里奥佩特拉，很想把她接到罗马来住一段日子。他写了一封文情并茂的长信，派遣专人送到埃及去。
克里奥佩特拉独自深居王宫，身边虽有幼子相随，但每看到这孩子，就想起恺撒。终于有一天，侍臣报告说，罗马派来一位使者，要求亲自觐见。她立刻传旨召见。
使者当面呈上一封书信，果然是恺撒的亲笔信函。信中说已经在罗马为她准备好了一座舒适豪华的宅邸，务必早日起程等等。
女王读完信，心花怒放，立刻传旨下去，要厚赏来使。她连夜写好一封回信，告诉恺撒，“不日即可起程，当你接到回信时，我已在中途，很快就能和你见面了”。