阿里巴巴创立之后，在充足的资金支持下迅速成长，即便是在网络冬天的2002年，阿里巴巴在年底实现了它们的首次盈利。看到阿里巴巴的发展形势，马云准备雄心勃勃地大干一场。
马云认真考虑并与公司高层讨论后，定下一个宏伟的目标：阿里巴巴要在2003年实现一天收入100万元，2004年一天利润100万无，2005年一天纳税100万元！
2003年初，海湾上空阴云密布，马云每天密切关注着伊拉克的局势，“我们发现中东地区的采购量一下子多起来，我们判断战争一定会爆发。”这并非简单的关心时事，马云有着自己的盘算。他预计，战争爆发之后，CNBC电视台的实时新闻一定会有数以亿计的人观看。
由美国媒体巨头国家广播公司创办的CNBC，是全球财经媒体公认的佼佼者，其深入的分析和实时报导赢得了全球企业界的信赖；而当时遍布全球89个国家、设有129个记者站的布局，则为CNBC提供了无以匹敌的新闻触角和覆盖范围。
于是马云就去CNBC做广告，这相当于中国中央电视台的财经频道，广告费很高。但由于阿里巴巴是第一家在CNBC打广告的中国公司，加上马云想包下一个季度或者一年的广告，因此对方给了一个非常低的价格。
不过，如果CNBC让阿里巴巴声名远播海外，马云却顾不上那些了。
阿里巴巴曾答应客户派人员参加2003年春季的广交会，但是非典发生了，当时广州的形势很紧张，人们谈非典色变，去还是不去？马云毫不犹豫地说，去。当时被派往的员工，没有一个畏缩，反而个个争先。
5月4日，从广州回来的一名阿里巴巴员工被诊断为杭州第4例非典疑似病例，由于这名员工从广州回来后的活动范围很大，接触人员也多，为了阻断所有可能的非典病毒传播渠道，从5月4日起，杭州实施了自发生非典疫情以来最大规模的隔离措施：涉及患者家庭所在居民楼、所在单位的500人，还有近百名医务人员和相关病人全部隔离。
在发现非典疑似病例之后，阿里巴巴的办公场所被隔离了。5月6日下午4点，戴着大口罩的马云，向大家宣布了这个消息。
从天而降的危机，使阿里巴巴面临瘫痪。面对危机，马云果断决策：以SOHO（在家办公）抗非典，改集中办公为分散办公。大家戴上口罩，抓紧时间打点家里办公所需的一切。三小时之内，500名员工分散完毕，随即在各自家中装好电脑宽带，照常办公。
在此后的14天里，500名员工虽然各自为战，但秩序井然。阿里巴巴高层通过网上指挥，网上管理。在这期间，阿里巴巴团队的凝聚力空前高涨。在那些非常日子里，无论电话何时打来，无论接电话的是员工还是家人，第一句话总是：“你好，阿里巴巴。”
长达14天的隔离，阿里巴巴不但维持了正常运转，而且使业绩激增5倍，做到了让全世界210万会员浑然不觉，媒体和外界也没有发现异常，这不能不说是个奇迹。
非典的可怕在于它不仅能夺去人的生命，而且可以置企业于死地。试想如果阿里巴巴网站瘫痪10天，那么阿里巴巴4年的苦心经营将付之东流，刚刚起来的销售势头将随风而去，辛苦培养起来的会员也会损失殆尽，阿里巴巴就会一蹶不振，甚至陷入死亡的深渊。
虽然那名员工的疑似最后被排除了，阿里巴巴500员工虚惊了一场，但非典带给阿里巴巴的这场生死考验意义重大。它验证了阿里巴巴文化的强大，验证了阿里巴巴团队的优秀，验证了网上生活的可行，网上交易的可行。
非典期间，阿里巴巴每日供求商机增长5倍，每天新增会员3500名，增幅高达50%。到6月中旬，阿里巴巴已全面完成从追求会员数量到追求成交量的历史性转型，提前实现每天收入100万元，全年收入过亿的目标。从此有关电子商务网站能否盈利和有关阿里巴巴何时盈利的争论已经显得多余。阿里巴巴为全球的电子商务网站带来春天的消息。
有人说阿里巴巴是非典的暴发户。其实不是阿里巴巴利用了非典，而是非典成全了阿里巴巴。正如马云所说：“不是非典让电子商务好，而是非典让人们知道了电子商务的好，电子商务本身就好。阿里巴巴能够战胜非典，能够在全员隔离时不瘫痪，能够在灾难中抓住商机在重压下实现大飞跃，实在是阿里巴巴发展的逻辑结果，阿里巴巴的爆发是迟早的事。没有非典，阿里巴巴也会起飞，非典只不过是充当了催化剂。”
非典期间，卓越、当当等电子商务网站的业务也有大幅攀升。但最具代表性的爆发还是阿里巴巴。阿里巴巴是非典的大赢家。阿里巴巴团队也是真正的“非典英雄”。
多年以后，阿里巴巴B2B业务的CEO卫哲总结说：“我今天说，没有遇到非典，可能阿里巴巴就没了，非典给阿里巴巴作了最大的推广，当时是每个人被迫都必须要用互联网的。”
阿里巴巴战胜非典之后，马云说过这样一段话：“互联网是为战争准备的。美国国防部设计互联网的时候说，万一战争爆发，美国国防部的数据库被炸掉，处于瘫痪状态，该怎么办？所以他们设计的互联网在全国各地全世界各地都可以运营，但是美国没有试过，英国、日本也没有试过，阿里巴巴是天下第一个尝试的公司。但是我们试验证明互联网可行，我们试验证明，一个团队拥有强大的价值观、强大的使命感的话，就可以面对它的挑战。”