凭直感，潘祖荫觉得这桩斗殴案必定是太监失理在先，而慈禧又听信了太监的一面之词，借圣旨来发泄自己的满腔怒火，同时也要借处理此事来树立自己至高无上不可侵犯的权威。为了证实自己的分析，他亲自提讯已被拘捕的玉林、忠和和祥福。提讯的结果使他的分析得到证实。
但内务府大臣恩良则要坚决按旨办事。审讯不审讯都无所谓，玉林等人的陈述他根本就听不进。作为内宫主管，恩良的这种态度是不难理解的。这是因为他不但要维护属于自己管辖的太监们的利益，他更要借此讨好巴结他的顶头主子——两宫皇太后。在这种职务的官员眼中，向来是没有什么原则和国家的概念的。面对着这种棘手的案子和尴尬的局面，才华过人的潘祖荫颇感为难。思索再三，他决定采取投石探路的方式。
第一步先上一折，将提讯玉林等人的情况上报。折子上详细记录玉林等人的口供，试图让两宫太后了解事情的另一面，希望她们在兼听之后能变得明白起来。潘祖荫请恩良会衔，恩良拒绝，他只得单衔上奏。几天后，他奉到朱批：不可偏听一面之词，应从严从速审结此案。太后们接过潘祖荫投过的“偏听”之矛，反过来又投向潘祖荫本人，弄得这位刑部尚书哭笑不得。
无奈，潘尚书只得采取各打五十大板的和稀泥的办法，拟了一个惩处方案：护军这边，其头目玉林责任较大，杖五百，罚去月俸三个月，祥福、忠和各杖五百；太监这边，其头目李三顺责任较大，交内务府慎刑司责打五百，罚去月俸三个月，二愣子、小勾子各责打五百。
疏上，朱批责备刑部偏袒护军，对玉林等人惩罚过轻。
潘祖荫气愤了，他在刑部衙门里发牢骚：“既然刑部处置不当，皇上自己圣心独裁好了，何必要借我们的口来说话！”
满尚书文煜生怕因此得罪太后而丢掉头上的红顶子，他劝潘祖荫：“伯寅兄，何苦为几个护军惹太后生气。太后说轻了，咱们再加重点。”
文煜自作主张重新判决：玉林从重发往吉林充当苦差，祥福从重发往驻防当差，觉罗忠和从重圈禁三年。他也不给潘祖荫过目，便以刑部的名义第三次上奏。
三天后，上谕下达：
午门值班护军殴打太监一案，曾谕令刑部、内务府详细审办，现据讯明定拟具奏。该衙门拟以玉林等发往边地当差，自系照例办理。唯此次李三顺赍送赏件，于该护军等盘查拦阻，业经告知奉有懿旨，仍敢抗违不遵，藐玩已极。若非格外严办，不足以惩儆。玉林、祥福均着革去护军，销除本身旗档，发往黑龙江充当苦差，遇赦不赦。忠和革去护军，圈禁五年。均着枷号加责。护军统领岳林，着再交部严加议处。禁门理宜严肃，嗣后仍着实力稽查，不得因玉林等抗违获罪情形，稍形懈弛。懔之！
对护军处罚之重，对太监偏爱之深，不仅令潘祖荫愤慨，令文煜意外，也令阖朝大臣不满。连日来，六部九卿的官员们纷纷私下议论：明明是太监亏理在先，为何只指摘护军一方？明明是太监、护军相互殴打，为何单说护军殴打太监？护军盘查，乃职守所在，即使出现殴打之事，也不可处以如此重的惩罚。革去护军，已属不轻，消除旗档，听之可骇，还要加上充当苦差，遇赦不赦，这一辈子永无出头之日了。这种处罚，比打劫行凶还要重！尤其是忠和更惨，一个红带子居然被圈禁五年，而所犯之罪仅仅只是打了太监。这叫人如何能服气！至于这背后的原因却是再明白不过了，因为李三顺是奉慈禧太后之命出宫的，打狗得看主人面，玉林等人可惜年少不知此中关系！
奉行职守的遭到严惩，违反宫禁的反倒无事，今后谁来遵制，谁来守责？官员们哀叹：“门禁必将渐成虚文。”
国家法纪不受重视，主子身边的太监可以仗势藐法，于是官员们又哀叹：“如此下去，前朝宦官干政的故事再将重演，大清朝的朝政从此将多事了！”
状元出身时任工部尚书的翁同龢很想为此事上个折子，提醒太后要杜防貂珰（貂珰：貂即貂尾，珰即金银珰。汉代中常侍冠上的两种装饰物。侍中加金珰，以貂尾为饰。中常侍为银珰左貂。东汉专任宦官为中常侍，右貂金珰，“貂珰”后来逐渐成为宦官的代称。）之弊。一天深夜，翁同龢来到好友协办大学士军机大臣沈桂芬的府上，探探他的口风。翁同龢想，如果他和自己的看法一样的话，便和他会衔上奏。
朝中官员的担忧，也是沈桂芬的担忧，但他却不愿上折。
沈桂芬对翁同龢说：“递折子给太后，这不明摆着是披龙鳞、捋虎须吗？我六十多岁了，又多病，还能活得几年。寿终正寝，得个好谥号，便是此生最后的希望了，犯不着为几个护军去触怒太后。老弟，我也劝你多一事不如少一事，国家也不是你我二人的。她皇太后心中都只有自己，不把国家当一回事，我们多操这份心做什么！”
这话说得也有理。翁同龢的折子便也不上了。
满朝文武大臣大多数采取的也正是翁同龢、沈桂芬的态度，只在嘴巴上说说而已，对于这场皇家与部曹（部曹：明、清中央各部分司办事官员的通称。古代官署，分部和曹，汉设尚书五人，一人为仆射，其余四人分为四曹，后又分为六曹。魏晋以后，称“吏曹”为“吏部”。隋朝分吏、礼、兵、刑、户、工六部。隋炀帝时又改礼部为“仪曹”，改“兵部”为“兵曹”。至明、清成为各部司官的通称。）的斗法，谁都不想参与。但翰林院有几个书呆子与众不同，他们却敢于顶风逆浪，要为公理和正义去争斗一番。
这天午后，应陈宝琛之约，张之洞来到陈府。此时正是隆冬季节，天寒地冻，京师犹如置于一个大冰窟之中。陈宝琛夫妇都是福建人，十分畏寒，初冬开始便天天把火炉烧得旺旺的，一到陈家，张之洞仿佛有踏入春天之感。特别是客厅桌子上摆着的那几盆福建特产——水仙，更是为房间装点着浓郁的春意。
张之洞端视着这几盆可爱的植物，只见那密密丛生的蒜条叶，一根根笔挺笔挺地向上奋进，黄绿色的叶片里饱含着蓬勃生机。许多叶片的顶部都结着花蕾，有几个花蕾提前绽开了，淡黄晶亮的花瓣笑融融地面对着窗外的枯枝败叶、寒山瘦水。在眼下百花凋谢的残冬，这几盆南国水仙给冷寂的寰宇带来多少温馨、多少生气啊！
正在张之洞凝思遐想的时候，张佩纶也应约走进陈家的客厅。
“香涛，你先我一步了！”张佩纶对在水仙花面前出神的张之洞大声打着招呼。
“你看这花开得有多好！”张之洞抬起头来对张佩纶说。正在这时，陈宝琛出来了。他又笑着对陈宝琛说，“你们福建怎么有这么好的冬花？”
“这是我们福建地气好的缘故。不只水仙，还有福橘、龙眼，都比别省的要好。”陈宝琛颇为自豪地说，“你这么喜欢水仙，我送你一盆吧！”
“也要送我一盆！”张佩纶直接索求。
“好，一人一盆。”陈宝琛爽快地答应。
三人坐下，一起喝着陈府的福建特产乌龙茶。
急性子张佩纶先开口：“弢庵，你把我和香涛召来，是不是为了午门斗殴事？”
“正是，正是！”陈宝琛说，“前些日子，一个名叫刘振生的疯子冒称太监，从神武门进了内宫，险些造成大祸，神武门护军也只是革职而已。这次太后为了自己的面子，可以不顾家法、不顾国纪，给午门护军这么重的惩处。这样的大事，满朝文武没有一人递个折子主持公道，大清岂不要亡了吗？”
“看来弢庵要上折子了，有意把事情说得这等严重，好像大清就他一个人在支撑似的。”张佩纶打断陈宝琛的话，笑着对张之洞说。
张之洞也笑了起来：“且听他说完，看他是如何砥柱中流，力挽狂澜的。”
“看来这大清是要靠我一人支撑了！”陈宝琛故意这么说，他是想借此刺激一下这两位一向勇于言事的清流好友，希望他们也帮衬帮衬，“我关在家里整整想了三天，拟了一道折子，特为请你们来，帮我参谋参谋。”
张佩纶说：“不瞒你说，我也正想上个折子。这种时刻，岂能没有我张佩纶的声音，想不到让你着了先鞭。快拿出来念念吧，我和香涛帮你润色润色。”
张之洞说：“满朝都是不平之声，我辈岂能不上疏！”
“正是这句话，我还记得香涛兄的诗：‘白日有覆盆，刳肝诉九阍。虎豹当关卧，不能遏我言。’没有什么东西可以阻挡我们的声音。我先递，你们接着上。要让天下人都知道，朝廷里还是有敢于说话的人的。”陈宝琛一面气势豪壮地说着，一面从茶几上拿出一沓纸来，“我就不从头至尾念了，挑几个重要的段落读给你们听听。”
二张一同说：“我们洗耳恭听。”
陈宝琛大声念起来：“臣维护军以稽查门禁为职，关防内使出入，律有专条。此次殴打之衅，起于稽查。神武门兵丁失察擅入疯狂，罪止于斥革。午门兵丁因稽查出入之太监，以致犯宫内忿争之律，冒抗违懿旨之愆，除名戍边，罪且不赦。兵丁势必惩夫前失，此后凡遇太监出入，但据口称奉有中旨，概予放行，再不敢详细盘查以别真伪，是有护军与无护军同，有门禁与无门禁同。”
“好！”张之洞拍手赞道，“有护军与无护军同，有门禁与无门禁同。这两句话说得有力量。”
“本朝宫府肃清，从无如前代太监犯罪而从严者，断无因与太监争执而反得重谴者。”陈宝琛继续中气十足地朗诵着，“臣愚以为此案在皇上之仁孝，不得不格外严办，以尊懿旨，而在皇太后之宽大，必且格外施恩，以抑宦官。若照日前处置，则此后气焰浸长，往来禁闼，莫敢谁何？履霜坚冰，宜防其渐。”
陈府温暖的书房里，主人的福建官话抑扬顿挫、铿锵有力，仿佛是对着那与严冬气候一样的冷漠舆论所作的宣战。
张之洞一手端着茶杯，一只手摸着下巴，两只眼睛凝视桌上那盆散发着清香的水仙花。他一言未发，脑子里却想得很多。自上个月午门事件发生以来，张之洞就以他一贯关心时务的热情，在注视着事态的发展和演变。
他曾当面问过潘祖荫，也问过刑部其他官员，掌握了玉林等人的供词。他还特地找过养心殿几个较为熟悉的太监，打听过李三顺其人，事件的真相已明白无误。至于对护军的惩罚将会带来怎样的后果，他也看得清楚。他几次想上疏说说自己的意见，但又几次作罢。事情真难呀！难就难在规谏的是知遇之恩甚厚而喜怒又捉摸不定的慈禧太后，何况素来仁弱的慈安太后也持同样的态度！
张之洞先是殷切期盼两宫太后能在怒火消除后，自己慢慢省悟过来，不露痕迹地弥补过失。在这种企盼落空之后，他又恳切地盼望有地位崇高的人出来上奏，用忠诚来感化、用事理来点拨两宫太后，使她们能悟以往之不谏，自己出面来做转圜。他本人不卷入这场难堪的纠纷中去，而最后的结局又不至于给国家带来不良影响。这便是张之洞最为希望的。但几天过去了，上这种奏章的人却没有，他心里开始焦虑起来。
他认真地听完陈宝琛的奏稿后，心里很是舒坦：弢庵真不愧一个无私无畏的清流，敢于直陈太后的过失。先前，赵烈文赞扬曾国藩的廉洁，说大清二百年不可无此总督，今天移给陈宝琛最合适了：大清二百年不可无此言官。
但张之洞还是有所顾虑：慈禧太后正在对护军恼火透顶，开头一段便是为护军辩护，会不会给她火上加油！他在心里琢磨着，这样一道针对太监护军斗殴事件的奏章，陈宝琛使用的是标准的布局：护军稽查无大错，太监仗势该训斥，谨防由此而滋生的弊端。但这样的布局对于从谏如流的明君来说或许相宜，而对师心自用的慈禧来说未必合适。
“香涛兄，你发表意见呀，这样写可不可以？”张之洞还在反复斟酌，陈宝琛已经逼将了。
“嗯，行，行。”张之洞尚未考虑成熟，只得敷衍着，“我看可以。”
“我以为尚有所欠缺。”张佩纶背起手在客厅里一边踱步一边说，“弢庵可能还有顾虑，话说得不够明白透彻。依我看，干脆挑明：护军之处罚，罚不当罪。”
张佩纶走到茶几边，端起杯子，喝口水润润喉咙，然后提高声调，义愤填膺似的说：“旗人销档，乃犯奸盗诈伪之事，至于遇赦不赦，必为犯十恶强盗、谋故杀人之罪。就算护军完全无理，打了太监一顿，也不能这样处罚。大清朝还有没有王法呀？刑部还有没有律令呀？眼下播之四方，今后传之万世，众口将会如何议论呀？”
陈宝琛说：“幼樵说得对。我是有点担心，怕话说得过重，两宫太后接受不了。”
“弢庵这个担心，可能不是多余的。”张之洞斟酌良久，已有主意了。
张佩纶坚定地说：“语气重一点，会有些刺眼，但有好处。我最反对用钝刀子割肉，半天出不了血。弢庵你一向痛快，为何这次瞻前顾后不痛不痒的。”
陈宝琛笑着说：“那好吧，就依你的，把这篇折子改一改。”
“这篇可以用，不要再改了。”张之洞急忙制止。
“我看也不要再改了，就把它照原样誊正，做正疏上。”张佩纶果断地做出决定，“再来一道附片，不妨就按刚才所说的，补一剂苦一点的药。”
“行！”