卢性正和黄兴估计汉阳失守，武昌也将陷落，但清军在攻克汉阳后，却并没有再进攻武昌。原来，双方的代表经过沟通，这时达成了临时停战协议。
掌握着这场战争局势走向大权的一个极其重要的人物是袁世凯。本来，这老袁年纪已大，清廷已在数年前就免其职，让他退养回了老家。可是，随着武昌起义的爆发，南方各省都相继宣布光复，清廷控制不了局面，于是又不得不重新起用他。武昌举义后的第3日，袁世凯即被清廷任命为湖广总督。10月19日，朝廷又令长江一带水陆各军都归袁世凯节制调遣。11月1日，清廷进一步授袁世凯为总理大臣，让其组织内阁。至此，袁世凯就执掌了整个朝廷大权。
老袁上台后，那些原本都是他旧部下的北洋军官们，这时都无不听命于他，率第一军占领汉口、汉阳的冯国璋，也是以老袁唯命是从。老袁叫他打就打，叫他停就停。所以，袁世凯的话，对他就是圣旨。当武昌起义初爆发时，老袁就算计这是个大好筹码，可供他好好玩转一下。利用清廷要倚重他的心理，老袁可借此打压民军；利用民军想要求得共和胜利的心理，他又可在国民政府里谋取最高职位。所以，老袁机关算尽，不断派代表与武昌的民国军政府联系，时而议和又时而开战，当清军攻克汉阳的同时，袁世凯又会见英国公使朱尔典，请其出面调停，表示愿与武汉达成停战协定。29日，老袁的儿子袁克定又密遣特使朱芾煌持汪精卫函，到武昌会见黎元洪，提出南北联合，使清帝逊位并举袁世凯为大总统。黎元洪召集军政府会议后表示赞成。这样，武昌至此就形成了停战局面。
4、出任副官长
两日后，从汉口顺利乘船抵达上海的黄兴和卢性正，从报纸报道中知道武昌局势已稍缓和，乃都松了一口气。但纵观全国的局势，这时仍不明朗，南北对峙的局面仍存极大变数。黄兴乃向卢性正吩咐道：“现在南方各省大都宣布光复，唯有南京还在清军控制之中。近日，徐绍桢在江苏组织的江浙联军，正向南京发起会攻，李燮和指挥的光复军水师部队是参战的劲锐军，你可速去协助他作战。”
卢性正立刻道：“好，我马上去。”说罢，即乘车来到吴淞口，在光复军总司令部找到了李燮和。
“燮和兄，老弟向你报到来了！”卢性正招呼道。
穿一身将军服，正埋头书桌看文件的李燮和，欣喜地抬头应道：“哦，性正老弟，你来得正好，我身边正缺人手哩，你是不是来帮我忙的？”
“是啊，这次我是奉黄兴令特来为你们光复军效力的，你欢迎吗！”
“当然欢迎。”李燮和高兴地伸手与卢性正握着道：“我们光复军现在就需要你这样的干将人才。不然，我这总司令就会变成光杆司令了。”
卢性正坐下感叹道：“时局变化真快啊！想不到几月未见，你就从南洋一个教书匠当了光复军的总司令了！”
李燮和哈哈笑道：“这总司令是不假，可你要知道，能坐到这个位置上来，也是历经了几番风雨拼搏的啊！”
“这我相信。听说这次上海起义光复，你就立下了大功嘛！按理，上海都督一职应该选举你来当，却不料让陈其美那小子捡了便宜。”
“就是，这小子想争夺头功，他带人去攻江南制造局，后又独闯制造局，企图说服守兵放下武器，结果身陷虎口，要不是我们派兵围攻将他救出，他的命都难保！”
李燮和似对此事啧有烦言。原来，这次光复上海起义之前，他在吴淞一带运动军警，成效很大。掌握实权的许多湘籍军官都愿意听他指挥。11月2日，李燮和与陈其美等在民声报社相会，商议同盟会与光复会共同行动问题，决定3日下午4点命令各路军警易帜，宣布独立。不料，3日清晨，起义事宜被清廷暗探队长汪景龙侦知。李燮和闻此消息，立即决定提前起义。并及时通知了各营管带和同盟会负责人陈其美。在李燮和指挥下，同光复会早有联系的警备营管带陈汉钦鸣枪为号，发起攻击，宣布闸北独立。下午3时，民军攻占巡警总局。接着，在南市有朱少沂等领导的商团武装起义，上海道台刘燕翼逃入租界。下午5时，陈其美率敢死队和部分商团武装向江南制造局发起攻击，激战一个多小时未能攻克，陈其美就在这时只身闯入制造局，想劝守兵放下武器，结果被扣押。4日凌晨1时，上海商团等义军再次发动进攻，接着，李燮和也派军警投入战斗，到黎明时，制造局终被攻克，制造局总办张士珩逃走，陈其美获救。李燮和遂被推举为临时总司令，驻制造局办事。
三天后，陈其美、李平书等组织上海各界代表50余人开会，筹组上海军政府。会上，各防军初推李燮和为沪军都督，陈汉钦为上海总司令，但绅商各界都推举陈其美为沪军都督，双方意见不洽，陈汉钦怕引起内讧，力劝李燮和退让，李燮和乃让都督于陈其美，自领兵到吴淞另组了吴淞军政分府。始称吴淞都督，继而再改为光复军总司令部。
卢性正知道李燮和与陈其美之间有着隔阂，遂又安慰他道：“你出让都督是明智的，现在的时局太复杂，光复会也好，同盟会也好，都应该以大局为重，要搁置争议，才能共同把反清的大业完成。所以，我觉得你的退让是对的。现在，你组建了光复军，一样可为打击清军立下大功！”
李燮和点头道：“我明白此理，咱们现在首要的就是不断扩大光复军的力量，黄兴既派你来协助我，我就给你委任一个副官长之职，本司令部没有副司令，你这个副官长就等于行使副总司令的职权吧，你看如何？”
“我初来尚未建尺寸之功，你的手下能服吗？”
“他们都会听我的，再说你也是革命党的老资格了，又是黄兴的助手，谁会不服呢？我看就这样定了吧。”
“好，那我就上任了。”
两人说至此，卢性正就在光复军中留下，并与李燮和成了搭档。
5、攻占南京
到光复军没几日，卢性正随李燮和从吴淞口乘坐军舰，指挥水师部队逆江而上，参与了会攻南京的决战。
其时，南京尚在清两江总督张人骏、将军铁良、张勋的控制之下。而新军第九镇统制徐绍桢自11月8日就率部起义，并从秣陵关进攻过雨花台，后因弹药不济而撤退到了镇江、芜湖驻防。11日，陈其美以沪军都督的名义，去电光复后的江苏都督程德全、浙江都督汤寿潜，提议组织江浙联军会攻南京，并推举徐绍桢为联军总司令。程德全、汤寿潜均复电赞同。随即，江浙联军于13日在镇江成立，先后加入联军的有镇军、苏军、浙军、淞军、沪军，总兵力达万余人。李燮和派去的淞军由黎天才领队。16日，联军总司令徐绍桢在镇江主持召开军事会议，商定进攻南京的方案。决定分中路、南路、北路三面进攻，即浙军、镇军任中路，分别攻占紫金山与天堡城炮台；苏军任南路，由句容攻占雨花台炮台；淞军任北路攻占乌龙山、幕府山两炮台。23日，联军各部冒雨分头进军。24日，淞军在原幕府山炮台军官成鲲带领下，顺利进占乌龙山，25日清晨，又分兵占领幕府山。同日，浙军朱瑞率3000人激战清军，攻占了马群、孝陵卫一带。28日，联军总司令部发布会攻南京城命令，接下来3天，联军各部与清兵展开激战。至12月1日中午，江浙联军合力攻下了天堡城。而卢性正伴随李燮和一起，这时乘军舰也到了幕府山炮台督战。两人下了军舰，在随从们的护卫下向幕府山走去。黎天才这时率水师官兵走上前热情迎接道：“李司令，您怎么亲自上阵来了？”
李燮和道：“现在两军交战激烈，我哪能坐得住？我到你们炮台来，顺便给你送了弹药来，你不是正缺吗？”
“多谢司令，你这是雪中送炭啊，有了弹药，一切就好办了。你就等着看我们炮击城内的清兵吧！”
“好，我就是想看看这炮击的效果！我听说你所带的兵力虽少，只有600人马，却打得最狠，是江浙联军中最英勇善战的部队，这真是我们淞军的骄傲啊。”
“谢总司令夸奖！”黎天才道：“这场战斗还算顺利，这幕府山炮台被我拿下后，清军曾分兵三路前来争夺，都被我军击退。现在战斗还未结束，我们还要继续进攻城内，只有把南京城攻占了，才算取得真正胜利。”
“对，你们现在还不能掉以轻心，一定要守住炮台，同时要炮击城内的清军目标，协助联军攻占全城。等战斗结束，我会向你请功的。”
“谢谢总司令！”
“走吧，我们同去阵地看看。”
李燮和说罢，一行人即在黎天才的带领下，来到了山上炮兵阵地前。几十个炮兵见到总司令到来，都觉得格外兴奋。其时，两江总督张人骏及将军铁良也在城中北极阁观战，这北极阁地势较高，能观江宁全城各地，而这一景象又恰被在幕府山的淞军参军官曹锡奎在望远镜中发觉了。“好，那几个观战的人必定是清军的大官儿，叫你们尝尝我的铁西瓜啊！”曹锡奎这样估摸着，随即校准标尺，一炮燃放，只听一声巨响，那炮弹就落在北极阁近旁爆炸了。张人骏与铁良顿时被震得大惊失色，“快，快走！”随从们护住两人，即仓皇逃入了日本领事馆躲避。卢性正目睹了这一炮的威力，高兴地道：“好哇，这一炮打得好，瞧那几个龟孙子，跑得好狼狈啊！”曹锡奎道：“可惜炸弹偏了一点，要不就送他们上西天了！”
李燮和也高兴道：“不错，你们再找定目标，多打几炮看看。”
于是，炮兵们又校准目标，对准城内清军营盘，连续轰击了几十炮，城中的清军营内，只见团团青烟冒起，清兵四处逃窜，一片鬼哭狼嚎。李燮和与卢性正看到这场景，连声都夸赞道：“好，打得好！”
当日下午，日本领事见清军败退，遂代张人骏向江浙联军求和，江浙联军即开出和谈条件，张人骏、铁良等又难以接受。联军遂于第二天又发起进攻，淞军的大炮开始猛击城北狮子山炮台，张人骏、铁良、张勋等听到炮声即分头逃窜。清军遂被迫挂出了白旗投诚。苏军乘胜攻占了雨花台。2日上午10时，江浙联军即自各城门入城，南京终于宣告光复。
淞军进城后，将总司令部设在了韬园。江浙联军也都集中到了南京城内。这时，黄兴因汉阳失守，武昌势孤，乃急电联军派兵西援。徐绍桢遂主持军事会议道：“现在武昌局势危急，黄兴来电要我们派兵去西援武昌。你们看，派哪支队伍去增援为好？”
浙军将领朱瑞提议道：“我看派黎天才去最合适。黎部水师战斗力最强，由他率部去增援武昌，定能担当此任。”
“对，派他去最好！”联军众将领随即纷纷赞成。
“李司令，你的意见呢？”徐绍桢问。
李燮和道：“派黎天才去是合适，不过，他现在的职位只是协统，我想为他请功，给其晋级当统制。然后由联军抽调各军人员，组成西援部队，由黎天才统领先行出发。”
徐绍桢道：“这好办。黎天才在这次攻克南京的战斗中，战绩显赫，理应提拔。这样吧，我看就以联军的名义，任李燮和担任援鄂总司令，升任黎天才为镇军统制，张联升、由犹龙为协统，你们看怎么样？”
“很好！”参会者都赞成。
会议既定后，江浙联军即抽调各军营之有枪械者，重新组成步兵四标、炮兵一营、机关炮兵一队的西援军，统由黎天才率队，即向武昌开拔而去。
而黎天才所率这支部队，到武昌后即改隶湖北军政府统辖，不再复统于燮和军节制，此为后话。