在生物学上，物种之所以不同，是因為他們之間有生殖隔离。生殖隔离是指自然界中生物不能交配或交配后不能产生可育后代的现象。一般的说，这就是不同的物种不会发生交配，即发生交配，但无生殖能力，即使出出下一代，后代无生存能力或无生殖能力，这些都是生殖隔离。生殖隔离是物种之之所以不同的原因。生殖隔离可分為兩大类：受精前和受精后生殖隔离。
“若隔离发生在受精以前，就称为受精前的生殖隔离，其中包括地理隔离、生态隔离、季节隔离、生理隔离、形态隔离和行为隔离等；若隔离发生在受精以后，就称为受精后的生殖隔离，其中包括杂种不活、杂种不育和杂种衰败等。”
常見的受精前的生殖隔离有：
生态隔离：生态隔离由于食性、生活习性和栖栖地点的不同，使几个亲缘关系接近的类群之间交配不易成功的隔离机制。例如有人报道5种近缘雀在树冠的不同层次捕食不同的昆虫，以及营巢的位置和交配产卵的繁殖季节不同，所以它们虽然生活在同一片森林，甚至同一棵树上，也都因各有自己的生态位置而形成生殖隔离。
季节隔离又称时间隔离：生物一般都有一定的生育季节和时间，如动物的发情期、交配期；植物的开花期和授粉期等，如果同种群体间的生育季节和时间不同，就会造成季节隔离或时间隔离，阻止了基因的交流，从而导致生殖隔离的形成。例如，北美有3种蛙，同生在一个池塘里，但由于繁殖季节不同而构成了生殖隔离。
生理隔离植物传粉后或动物交配后，由于生理上的不协调而不能完成受精作用的现象。例如，异种花粉落在柱头上通常不能形成花粉管；有的即使形成花粉管也不能成功地通过花柱、到达胚珠。又如绿果蝇的精子在美洲果蝇的受精囊内很快就丧失游动能力，而同种精子则可较长时间保持活动能力。
形态隔离主要指由于植物花的结构与传粉者形态结构不协调而造成的交配受精障碍。例如，大红吊钟柳，花红色，有细长的管状花冠；山吊钟柳，花蓝色，有较大的钟状花冠。二者在人工授粉时能形成杂种，但在自然条件下，前者以其红色光和红外光招引蜂鸟，管状的花冠对蜂鸟细长的喙也相适应；后者以蓝紫光与紫外光招引蜂类，钟状花冠也适于蜂类采蜜，但二者之间不能相互授粉。
行为隔离由于交配行为不同，而使两个或几个亲缘关系相近的类群之间交配不易成功的隔离机制。例如，红蟋蟀、宾洲蟋蟀和富尔顿蟋蟀在形态上无区别，但鸣声的强弱和频率不同。试验证明，交配仅在发生同一鸣声的种内进行，不同鸣声的蟋蟀不进行交配。
配子或配子体隔离，是指一个物种的精子或花粉管不能够被吸引到卵或胚珠内，或者它在另一个物种的输卵管中不易生活的隔离。常見的受精后的生殖隔离有：
1.杂交不亲和，是指能够发生交配，但是不能够完成受精过程。
2.杂种不活，是指能够完成受精过程，但是受精后合子不能够正常发育，或不能发育到性成熟阶段就死亡。如绵羊与山羊的杂种，在胚胎早期发育正常，但在出生前会死去。
3.杂种不育，是指杂种不能产生具有正常功能的配子。例如，马和驴杂交的后代骡就是不育的。
4.杂种衰退，是指杂种后代（子二代简称为F2）的生存力或育性减退。例如，树棉与草棉之间的F1（子一代简称为F1）杂种是健壮而可育的，但是，F2个体则很衰弱，以至不能够生存。
受精后的生殖隔离爭异並不大，不同物种交配后不能生下健康在子代，就是因為這些原因。受精前的生殖隔离則不同，它定义的很模糊。
这些所谓的受精前生殖隔离不仅在不同的物种間存在，也在同一物种間，但不同的個体間存在。比如大的金黄猎犬有70磅，小的奇瓦瓦狗只有2磅左右，他們因性狀差异悬殊，而无法自然交配，就是說它們之間有机械隔离。而育种专家把丹麦狗的精子通過人工授精的方法放到奇瓦瓦狗子宮中，當狗胎儿发育到一定階段，它就流產了，因為奇瓦瓦狗的子宮太少。但奇瓦瓦狗的精子通過人工授精放到金黄猎犬的子宮中，那么他們就能产生健康，有生殖能力的下一代，所以它們是一個物种。所有的狗不论大小都是一個生物种。
一個人們普遍具有的常识是不能逆向推理。什么是逆向推理呢？那就是不能跟据一個現象就去推理其原因。比如說得了艾滋病的病人会发烧，但不能看到有人发烧就說他得了艾滋病，青蛙有四条腿，但不能看到四条腿就說它是青蛙。
人们能看到的往往是一些現象或結果，造成这种結果的原因可能有多种，不是一种。我們只有在确定只有一种原因產生一种結果，才能用逆向推理。而人們已知同一种生物之间也有很多类似生殖隔离的現象，所以就不能看到所谓的生殖隔离就认为是新物种在形成。当人们对一个现象作出解释时，应谨记这一基本逻辑。