1998年3月，美国古生物学家宣称，他们发现了鸟类源于恐龙的证据——1995年在马达加斯加岛发现的鸟类化石具有恐龙特征。
对鸟类是否起源于恐龙，中国科学家近年来也进行了大量研究，提出了不同的看法。中科院古脊椎动物与古人类研究所董枝明研究员说，近年来，中国科学家在辽宁省西部地区发现了大量早期鸟类化石，包括孔子鸟、中华龙鸟、原始祖鸟、辽宁鸟等，为解决这一争论带来了“曙光”，但并没有彻底解决问题，而是使鸟类的起源和进化变得更加复杂模糊起来。鸟类的真正祖先，应该到更为古老的地层中去寻找。
1999年6月，中科院古脊椎动物与古人类研究所的侯连海教授和周忠和博士，同国际著名鸟类学家一起发表，通过对新发现的一个孔子鸟类群——杜氏孔子鸟的研究证明：鸟类并非起源于恐龙。
与此观点相反，中国青年学者徐星、汪筱林和吴肖春在近日公布了他们的最新研究成果。他们认为，有证据表明鸟类很可能起源于一种形态上非常接近于驰龙的小型兽脚类恐龙。