1969年3月珍宝岛事件之后，中苏关系十分紧张。为了缓和局势，根据中国总理******和苏联部长会议主席柯西金在北京首都机场会谈达成的协议，双方将于1969年10月20日在北京举行关于边界问题的外交部副部长级谈判。根据当时的战略动向及国际上把谈判作为战争借口的先例，****中央怀疑苏联把谈判作为向中国发动突然袭击的一个烟幕。10月中旬，中央政治局召开会议决定，为了防范苏联利用谈判之机进行军事袭击，立即开始加强战备，防患于未然。14日，****中央发出紧急通知，要求在京的党和国家领导人在20日以前全部战备疏散。在此前后，******前往武汉，****在苏州，朱德、董必武、叶剑英前往广东，****、王震前往江西，聂荣臻、陈毅前往河北，徐向前前往河南。已被“打倒”的刘少奇、******、陶铸、张闻天也被分别疏散。
10月16日，****乘飞机离开北京到达苏州。17日下午，他通知秘书“打个电话给黄永胜”，由秘书张云生作记录。****站着一边想，一边逐字逐句口述。****一共讲了6条，差不多一句就是一条。大意是：苏联代表团将于10月20日来北京，对此应提高警惕。为了防止苏联利用谈判作烟幕对中国进行突然袭击，全军各部队要立即疏散；各种重要装备、设备及目标要进行伪装和隐蔽；通讯联络要经常畅通；国防工业要抓紧武器弹药的生产；二炮部队要做好发射准备等。这显然是****以国防部长身份向全军下达的一份进入紧急状态的口述命令。
当晚7时左右，秘书张云生用电话把****口述的6条命令传给了在北京的总参谋长黄永胜。
18日晚21时30分，黄永胜以“林副主席第一个号令”为名，通过总参作战部正式下达了这个指示，要求全军进入紧急战备状态。“第一个号令”的部分内容是：“第四，迅速抓紧部署反坦克兵器的生产，如四零火箭筒、反坦克炮等（包括无后坐力炮和八五反坦克炮）。第五，立即组织精干的指挥班子，进入战时指挥位置。第六，各级要加强首长值班，及时掌握情况。执行情况，迅速报告。”上述指示中的最后一项只传达到11个大军区和海军、空军、卫戍区。
同时，黄永胜还下达了****给第二炮兵的指示“第二号令”，给总参二部、三部的指示“第三号令”和给各总部、各兵种、国防工办、国防科委的指示“第四号令”。“紧急指示”发出后，全军各部队进人了一级战备状态。空军、海军和各军区，特别是东北、华北、西北地区的部队和重型装备、物资，都进行了紧急疏散。全军共疏散95个师，94万人，4100架飞机和6600余艘舰艇。
发布这样一个关系全军总动员准备打仗的“紧急指示”而不经党中央研究，不向党中央、中央军委主席请示而擅自下令，这是绝对不允许的。****对此很清楚。在获知他的紧急指示已发布到全军后，****遂指使黄永胜于19日以电话形式向正在武汉的******进行报告，企图以先斩后奏的方式迫使******同意。没想到，******看完电话记录稿后做了冷处理，批示烧掉。黄永胜接到回电后，顿时慌了手脚。经过与****密谋后，黄对外宣称：“毛主席阅后，批示：很好，烧掉。”实际上，******对****擅自调动全军进入紧急状态是很生气的。随同******在武汉急指示”。次日，这个指示被黄永胜冠以“林副主席第一个号令”向全军传达。
****为什么敢于擅自发布“紧急指示”呢？一个原因是******等中央主要领导人对国际形势估计过于紧张，对爆发世界大战的估计过于严重，给****发布“紧急指示”以可乘之机。美国增兵越南，中苏关系恶化，中苏冲突日益严重，以致发生边境武装冲突，这些加重了中国领导人对形势的判断，使中国更加广泛、持久、深入地加强战备。当中苏两国政府确定于10月20日在北京举行边界谈判之时，中国领导人紧绷的神经尚未松弛下来。会谈前夕，******作出了国际形势有可能突然恶化的估计，中央政治局会议也同时决定为防止苏联军事袭击、立即开始加强战备。这些都为****发布“紧急指示”提供了条件。******等中央领导人不在北京，也为****发布“紧急指示”提供了机会。但更重要的原因则是在****九大后，****被确定为党的唯一副主席，成为******的法定接班人，同时又是军委副主席、国防部长，主持军委日常工作。****集团的其他成员如黄永胜、吴法宪、李作鹏、******、。叶群等都成为中央政治局委员，黄、吴、李、邱还担任着军队的重要职务。这些并未满足****的权力欲，他还想夺取更高权力。“紧急指示”的发布就是****检验自己命令的效力、图谋政变的又一次预演。这是****发布“紧急指示”的实质。其实在****发布“紧急指示”半个月前，他已进行过一次预演。9月30日夜，****突然视察北京西郊机场，命令该机场的飞机当晚全部转场，用砖头把跑道堵起来并配备足够的武器，搞一个小规模的演习。吴法宪根据****的指示，当夜命令“所有空军部队进入一等战备；所有指挥所进入一等战备；所有指挥员坚守指挥岗位，不准离开”。结果从9月30日至10月3日，空军所有部队、学校、机关和民航进入一等战备，共有1683架飞机在机场担任战斗值班，3900多架飞机进人洞库或野外疏散，东北、西北、华北地区的机场都用机械和车辆设置了防敌机降落的障碍。事后，吴法宪以空军党委的名义向****报告说：“这一战备行动是空军建立以来规模最大的一次演习。”
10月20日，中苏双方外交部副部长级谈判如期在京举行。中苏边界没有发生任何情况。这表明“紧急指示”的判断是完全错误的。但是在后果上，它却对国内外形势造成了一定的影响。
“紧急指示”的发布促使全国备战升级，形成高潮。除部队进入一级战备状态外，许多大中城市立即疏散人口、挖防空洞、防空壕，组建消防、救护、运输、抢修、治安等队伍，加强通讯警报网建设，工业向边远地区转移，军工生产规模扩大。这严重影响了中国国内社会的稳定和经济的正常发展。
“紧急指示”发布后，部队和装备物资进行了大规模的疏散。据统计，1970年，紧急疏散的部队和物资经铁路部门运输的有60万车，比抗美援朝时期运输量最大的1951年还多17万车。运输团以上部队有8个整军、48个整师另179个团，新老兵157万余人。经水路运输的有20万人、物资55万吨。经全军后勤汽车部队运输的物资约3000万吨。如此大规模的部队和物资疏散不能不引起国外各方面的关注和震动。苏军在中苏、中蒙边境一带频繁调动，全部休假取消。驻太平洋地区的美军也奉命全面戒备。台湾、澎湖、金门、马祖的国民党军队也进入了战备状态。中国周边形势形成剑拔弩张之势。
“清理阶级队伍”的进行
“清理阶级队伍”是所谓“发动群众开展对敌斗争”的一项政治运动，提出于1967年底，自1968年夏始在全国范围内展开，****九大前后，成为“斗、批、改”运动的主要内容之一。