大量元素肥料的施用，对微量元素的吸收利用有影响，有的有助于吸收，有的则有妨害。
氮肥、钾肥施用量过大，会使植物吸硼量减少；磷肥用量过大，会因磷锌交互作用而使植物吸锌量减少。
一些生理酸性肥料如氯化铵、******、硫酸铵等的施入，在缺锌、铁的土壤上常会因降低了土壤pH值而提高了锌、铁等的活性，同时，在缺钼的酸性土上，则加重了缺钼症状。
石灰的过量施用常会过高提高土壤pH值，而使土壤缺锌、硼，同时，石灰的施用可改善缺钼酸性土中钼的有效性。
此外，大量元素的施用提高了产量，可促进微量元素的吸收。大量氮、磷、钾的施用，不配合微肥，改变了土壤环境条件等，均会导致土壤中微量元素的缺乏，需施用微肥。