清光绪二十四年（1898年），夏天，天气异常闷热。
一条小木船行驶在漳州九龙江，往西溪方向逆流而上，船上除了船夫之外，还有三男一女，其中有一个大男人，躺在船舱里，大热天身上盖着一件花棉被，浑身还在发抖的样子，他脸色发黑，尤其是印堂和太阳穴之处，不但毫无光泽，而且看起来好像中了巨毒。站在旁边的那两男一女，尤其是那个女的，神色忧郁而且沉重，此时，正拿药要给那个病人吃，病人一连咳了几声，喷出血来，那个女的紧张得差点儿晕倒。旁边的小男孩叫了一声“爸——”，没有再说些什么，看得出也被眼前的情景吓住了，但小男孩并没有哭，强忍着。
躺在船舱里的那个人，就是那个妇女的丈夫，那个10岁左右的小男孩就是他们的孩子，而另外那个男的，是女人的表哥。
一年前，她的丈夫和她的表哥一起到漳州经商，生意做得还算可以，没想到，几天前，漳州地区发生鼠疫，她的丈夫不小心被感染，初时并没有发觉，等到发现后已经太晚了，医生告诉她，可以运回家去准备后事了。
医生没有告诉她丈夫到底得了什么病，只说已无药可医。这一消息，对女人来说如五雷轰顶，她百般恳求医生治疗，得到的答案都是满脸无奈。眼看病情日重，再不回家，可能就来不及了，为了让自己的男人落叶归根，只好雇船逆流西上。
当船只抵达平和码头时，已经有亲戚拉来一辆独轮车在那里等候，她和表哥一起把丈夫抬上独轮车，就这样，表哥在前拉，自己在后推。山路崎岖，坎坷不平，又折腾了近一整天，她终于把丈夫运回家中，果然，没过几天丈夫就死了。
几天后，霞寨乡乡民发现有大量老鼠自杀，不久，鼠疫终于发生并迅速流行，首先在漳州、诏安、漳浦、南靖等地纷纷扩散，平和县境内，如霞寨、山格、大溪、文峰、南胜等地，也迅速扩散传染，从而引起百姓极度恐慌。
据《平和县志》记载，从清光绪二十七年至民国五年，鼠疫在全县蔓延至441村，疫势颇为凶猛，有19500人患病，17200人死亡，死亡率高达百分之八十八点三三。光绪二十八年，大溪乡鼠疫流行时，有两座各住有数十户人家的大院，三年内全体居民皆患此病死亡。当地流传一句“三年死二院”的民谚，甚至出现未死先葬的现象。光绪三十四年，九峰黄田村鼠疫流行，一座二十余户居民的土楼里，一个月内40多人死亡。正当哀鸿遍野、人心惶惶之际，有人想到了祖师公，经这一提醒，民众仿佛如遇救星一般，自发组织起来，一路上锣鼓铿锵，鞭炮齐响，成群结队来到三平寺，准备请祖师公圣驾光临各自村庄，果然灵验。
村民恭请祖师公圣驾光临的经过是这样——
村庄里的人，采用“圣杯”的方式选出12名精壮汉子，领头去迎请祖师公圣驾，还有祖师公座下蛇侍者。祖师公座下有青、红面二位蛇侍者。据传，青面侍者承继祖师公的医术，善于治病，红面侍者善于念佛。于是，他们12人就带着一队人马，锣鼓喧天来到三平寺，恭迎祖师公和青、红面二位蛇侍者到他们的村庄去。他们12人轮流抬着三顶轿子，轿子上分别坐着祖师公和青、红面二位蛇侍者，沿途经过的村庄都有许多人在村口烧香、放鞭炮，祭拜祖师公。
队伍浩浩荡荡、大摇大摆地走过了一个又一个村庄，然后才回到了自己的村庄。村庄里的人早已等得心急难耐，见祖师公的圣驾降临，鞭炮声更是鼎沸，烟雾满天，空气中到处充满鞭炮的硫磺味，但村庄里的人早已顾不得这些，只知道拼命烧香、叩头、祷告、许愿等等。村中的长老们更是用隆重的仪式，集体给祖师公和两尊蛇侍者烧香、叩头，祈求祖师公和蛇侍者保佑村民幸福安康，免受鼠疫祸害。忽然，村庄里有个人烧香、叩头、祷告、许愿后，从香炉里取出一包香灰，要拿回去冲开水喝，这一举动立刻提醒了全村的人，于是，一时之间，每家每户都争着从香炉里取香灰回去冲开水喝。
事后，令人奇怪的是，这个村庄果然再没有人因鼠疫而亡。消息传开，全县轰动，各村都争着去请祖师公和蛇侍者保佑以渡过灾难。不久，平和县鼠疫果然得到平息，祖师公在人们心目中的地位和影响力更大了。
这件事情发生在当时确实是一桩奇事，也确实是不解之谜，即使是现在，也同样富有极其神秘的色彩。但现代人对神秘和信仰的理解更客观更理智了，不再像过去那样，只知道用“唯心论”去解析。譬如对于祖师公治瘟疫这件事情，现代人就有了多方面的理解。首先，“心理治疗法”起了很大的作用，当瘟疫大面积流行时，人们的心理防疫和抵抗能力是十分脆弱的，也就是处在恐慌和失序的状态之中，而当祖师公的圣驾到达时，锣鼓喧天、炮声不断、人声鼎沸，这就在无意中增强了人们的心理防疫和抵抗能力；其次，空气中弥漫着鞭炮炸出来的硫磺的味道，这正好达到良好的杀菌和防疫作用；第三，适量喝香灰水其实也能起到杀菌和防疫作用，因为香火中含有硫磺和檀香，当香火烧成灰后，不仅无毒，而且杀菌，又能理气，所以，喝香灰水其实也有一定的医理。
当然，祖师公治瘟疫这件事情当中的神秘部分或许还有待于进一步探讨，但无论如何，信仰也能产生医理作用，应该也是现代医学值得探讨的一部分，甚至是重要组成部分。何况祖师公在世时对医学方面的研究也是富有成果，这一点，可以从其留下的75首药签中得到证明，这75首药签目前已经得到许多医学专家的肯定与赞赏。