中华联邦·西部地区沙漠。
GEASS教团总部是由一圈地下城市组成，就建立在这一片沙漠之下。以V.V为首的教团高层们，还不知道自己已经大祸临头，现正在地下城市的主殿进行着会议。
V.V，外表是一个披着银色长发的小正太，但其实际年龄没有人知道。
“教主，关于柯内莉亚殿下和她的部下该如何处置？属下认为有必要联络一下皇帝陛下吧。”
“嚯，查尔斯知道柯内莉亚的行动吗，还是不知道呢。”
前段日子柯内莉亚和部下达尔顿跟踪昔日克洛维斯的辅佐官来到了地下城市，被V.V的下属发现并抓住，目前关押在地下城市的监牢中。
“我记得查尔斯不是已经对外宣布柯内莉亚死于黑色叛乱了嘛。”V.V略有些无趣地道。
“教主的意思是……”
“报告教主，杰雷米亚发来定时联络。”
“啊，接到这里来吧。”
柯内莉亚的问题暂时中断，V.V命人将通讯画面接到主殿屏幕上。
不一会儿画面接上了，但是屏幕中出现的并不是杰雷米亚的影像，而是鲁路修。
“幸会幸会，你就是V.V教主。”
“鲁路修？”
“事到如今我也不用自我介绍了吧，我只想问几个问题。”
“嚯？”
“第一，黑色叛乱的时候把娜娜莉带走，并将我引到式根岛的人是你吗？”
“啊，没错。”
“第二，那么在式根岛出现的朱雀也是你的杰作？”
“嗯。”
“最后，柯内莉亚是不是在你这里？”
“完全正确。”V.V十分爽快地承认了，“不过你能这么问，那就证明你的记忆恢复了？”
“是的，我就是ZERO。”
“既然如此，那C.C也在你那里咯？把C.C交给我，我给你自由。”
“你不会蠢到认为我会把自己的女人拱手相送吧？已经晚了，这已经是你与我的战争了。”
“嘿，不过当你来到这里的时候，我们早已转移到下一个地点……”
还没等V.V说完，地下城市发生了巨大的轰鸣以及震动。
“教主，有KnightmareFrame出现在城市，是属于黑色骑士团的！”
“什么！”
一丝惊慌神色出现在了V.V的脸上。联想到可能发生的事情，V.V回头看向屏幕上的鲁路修。
“鲁路修，难道是你？！不可能这么快的。”
“一个小小的障眼法你都识破不了吗，真不知道你怎么当上教主的。”鲁路修用嘲讽地语气道。
接着只见屏幕上鲁路修身后的背景一变，一片广阔的沙漠出现。神虎，蜃气楼，文森特三架机体在鲁路修背后一字排开。
“全军听令，此地乃是中华联邦大宦官集团遗留的产物，目的是对人体进行研究。里面的所有人无论是成人还是小孩，都已经失去理智，所以为了解放他们的苦楚，我们必须全部抹杀掉。以鲁路修·Vi·布里塔尼亚之名命令全军，摧毁此地，抹去此地一切痕迹！”
超范围GEASS再度施展。上一次鲁路修施加如此广范围的GEASS还是在行政特区日本建立的时候。
“Yes,YourMajesty。”
鲁路修这次围歼教团所带来的部队，全部是黑色骑士团的新军，没有受到过鲁路修施加的GEASS，所以GEASS十分顺利地下达成功。至于神虎则是鲁路修向黎星刻借来给杰雷米亚用的。此次行动除了鲁路修、杰雷米亚、缇娜以及C.C之外，将没有黑色骑士团的人会记得。
伴随着四周的枪弹爆炸声，原本与世隔绝的地下城市已经走向毁灭。
“鲁路修，被你摆了一道啊，但是我可不是那么容易被打败的。”V.V咬牙切齿，随即对身边的部下道，“Siegfried还没准备好吗？”
回答V.V的是一记枪响，身旁的那名教团成员瞬间倒在了血泊中。
“柯内莉亚！你怎么跑出来的！”V.V见到开枪之人不由惊呼道。
柯内莉亚没有回答V.V的话，而是对着V.V周围连续开枪，将其周围的部下清理干净，“这些日子来承蒙伯父的照顾，现在该轮到晚辈‘报答’了。达尔顿，与鲁路修联系上了吗？”
“皇姐，我来了。”没等达尔顿回答，蜃气楼就出现在了主殿。
就在刚才鲁路修下达全军出击的指令后，鲁路修就让缇娜驾驶文森特以最快的速度进入地下城市寻找关押柯内莉亚的牢房。
因为缇娜对地下城市的布置很熟悉，所以很快找到了柯内莉亚和达尔顿的牢房。面对皇女气场全开的柯内莉亚，缇娜顿时化作小白兔，楚楚可怜的模样获得了柯内莉亚的喜爱。本来缇娜是收到的是一旦找到柯内莉亚就把她接回地面的命令，但是柯内莉亚想起了V.V的秘密武器，名为Siegfried的机体，便主张先将停放Siegfried的仓库镇压下来。弱气的缇娜怎么敢提出反对意见，只能随着柯内莉亚和达尔顿前去。此时地下城市已经被黑色骑士团围剿，停放Siegfried的仓库早已人去楼空，因而柯内莉亚顺利地断绝了V.V最后的一丝希望。
鲁路修从蜃气楼下来，先是与柯内莉亚满怀深情地对视了一下，视线中交错了说也说不完的情意，然后面对已经披头散发的V.V。
“呐，别来无恙，V.V伯父。”
“你已经知道了啊，鲁路修。”V.V早已没有教主的风范，呆呆地看着鲁路修。
“对于你，我现在只有恨意。你是杀死母亲，毁掉我和娜娜莉未来的主谋，对吧？”
鲁路修所指的便是闪光的玛莉安娜在白羊宫被刺杀的事件。这件事也是柯内莉亚、杰雷米亚等人心中的伤痕。因为柯内莉亚和杰雷米亚都是当时白羊宫的护卫队成员，柯内莉亚还是队长。没能保护好玛莉安娜皇妃，令他们都十分自责。
“还在纠结那件事吗？”V.V平静地道，“鲁路修哟，你所追寻的真相都在那扇门之后。不过我想知道的是，你做好迎接真相的准备了吗？”
“什么意思？”鲁路修不禁眉头一紧，V.V的话里面似乎指自己母亲被刺杀之事另有内情。
“没什么意思。作为大伯，我没什么可说的了。”V.V干脆坐在了台阶上。
V.V越是如此，鲁路修越是怀疑，那扇门之后究竟是什么。如同式根岛上的那扇石门，这扇门上同样印有一个GEASS的标志。
很快鲁路修做出了决断，进去！但在这之前，鲁路修将蜃气楼的钥匙交给了柯内莉亚。
“皇姐，等这里清理完毕后，你就带着他们上去等我。母亲被刺杀的真相我必须要去弄明白。”
“我也要去，鲁路修。玛莉安娜母妃的事我也有责任，我……”
“亲爱的皇姐，请相信弟弟，我一定会把了解到的真相全盘告诉你的，但不是现在。”鲁路修来到柯内莉亚身前，双手搭在了她的肩上，十分认真地说道，“请听我的话，在上面等我，好吗。”
“鲁路修，唔。”还想说什么的柯内莉亚，被鲁路修封住了嘴，也就是被他强吻了。
“太狡猾了，弟弟。”唇分后，柯内莉亚面若桃花，十分娇艳。
“虽然有很多很多的话想和皇姐说，但是现在不是时候。相信我好吗，皇姐。”
“嗯。”自觉羞人的柯内莉亚不禁低下了头。
“这就是血浓于水的情感吗。”V.V难得有一丝触动。
“杰雷米亚，达尔顿，缇娜，你们率军撤离此地，上去等候我的消息。在我不在的期间，全军都必须遵从柯内莉亚的号令。”
虽然缇娜不愿意与鲁路修分开，但是在鲁路修故技重施的情况下，只好乖乖跟着柯内莉亚等人离开。
“走吧，大伯，要不要我扶你？”目送柯内莉亚等人离开后，鲁路修转身对V.V道。
“哼，不用。”V.V谢绝了鲁路修好意，兀自带头进入了石门。
真相就要大白了吗？
怀着复杂的心情，鲁路修跟随V.V的脚步穿过了石门，来到了一个全新的世界。