“怎么样？暴鲤龙。”小林在暴鲤龙的身上问道。暴鲤龙点了点头，在波涛汹涌的海水中向着火之岛飞快的前进。
来到了火之岛，小林朝着祭坛的方向跑去。来到了祭坛旁边，看到了上面石像嘴里的宝物。“这个东西还真是难拔啊。”小林用力把宝物从石像嘴里拔了出来后想到。
小林拿着石像嘴里的宝藏准备去下一个岛时，一个声音传了过来。“是闪电鸟啊，这么快就来了。”小林转过头看到了天上的闪电后想到。这个时候，在楼梯那里突然又传来了一个声音。
“小林，你没事把。”那是一个上了帆的小艇，小艇停下来后，芙卢拉从上面跳了下来，跑到了小林的身边问道。
“还好了，这个是火之岛的宝藏。”小林说完后把那个透明的里面带有火焰的圆球拿了出来。
“小林，你没有事吧。”这个时候，船上又传来了一个声音。“小智，怎么是你们啊？”小林看到来人后说道。
“我看到你出海后暴风雨就来了，所以很担心。在准备开船去找你的时候，就碰到了他们。我听他们说，那个叫小智的也是神奇宝贝训练家，所以就拜托他们和我一起来救你，只是没想到你们会认识。”芙卢拉说道。
“嗯，这个先别管了。快点走把。”小林说道。就在小林他们刚打算走的时候，闪电鸟和原著一样飞了过来，然后就是皮卡丘和闪电鸟之间的互相交流。这个时候，天空突然把闪电鸟的电流吸了过去，只见一个巨大的飞船从云层出缓慢的降落下来。闪电鸟朝着巨大的飞船攻击过去。然后和原著一样倍飞船放出的捕捉器给捉住了，而小林他们也一样。本来小林是能逃跑的，但是他还是觉得现在不要在别人眼前使用特殊能力好，所以也被捉住了。
后来的发展和原著一样，那个收藏家和小林他们说了一些废话后，急冻鸟的信号就传来了，然后收藏家就回到了操控室，把小林他们留在了大厅。
然后，小智用了喷火龙和皮卡丘，妙蛙种子还有杰尼龟，对着火焰鸟的捕捉器使用了绝招，想把火焰鸟放出来。后来还是用电解水后的氢气碰火发生的爆炸，把火焰鸟从捕捉器里救了出来。出来的火焰鸟朝着闪电鸟的捕捉器放出了火焰喷射，把困住闪电鸟的捕捉器也打碎了。之后两只鸟就完全的愤怒了，什么理智都没有的在飞船四处胡乱攻击。
飞船落到了雷之岛，小林和小智他们一起从飞船处跑了出来。飞船坠毁后，连带着雷之岛的祭坛也没砸坏了。宝物从祭坛处掉落到刚刚没站稳而摔倒的小智身边。
“是宝藏，雷之岛的。”小智拿起了宝藏后说道。“呐，小智！还有一个是冰之岛的，你就代替我去把那最后一个宝藏拿到把。”小林把火之岛拿到的宝藏交给了小智后说道。
“那你呢？”小智问道。旁边的一群人也是一样用疑惑的眼神看着小林。“我嘛！你看看那里。”小林伸手指着天空上混战的三神鸟说道。
“那是三神鸟啊，它们都愤怒了啊，如果让他们一直保持这样的话，这个世界很可能会因此而毁灭的。所以，宝藏的事情就交给你了，至于掩护，那就交给我把。”小林笑着说道。
“就算小林你是石英联盟的冠军，而且还是能够打败天王的人，但是对手是三神鸟，你也不可能会胜利的把。”小智说道。
“没关系啦，我可没说要打败它们，我说的是掩护你。况且，这里能够阻止三神鸟掩护你的人，只有我了把。”小林无所谓的说道。
之后，小智和小林就向着冰之岛的方向前进了。途中，三神鸟发起了攻击，本来想用出神奇宝贝的小林，却发现冰层下的水面发生了变化，然后，海之神洛奇亚出现了，并且把三神鸟的攻击挡了下来。
“小智，你就这么向着冰之岛前进，这里交给我了。”小林说道。听到小林话的小智，便向着冰之岛的方向前进了。
“洛奇亚，你还是攻击把，现在最好的办法就是把它们打败，现在不阻止的话，世界的平衡会受到影响的”小林说道。
洛奇亚点了点头开始攻击了。“你也出来把，火焰鸟，闪电鸟，急冻鸟。”小林果断的放出了自己的三神鸟。“洛奇亚，火焰鸟交给你了，至于另外两个，就交给我把。”小林对洛奇亚说道。
洛奇亚看到了小林放出了三只神鸟后惊讶了一下，然后什么都没说，笑着对小林点了点头后，便向着火焰鸟的方向飞去。
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之后，小智拿到了冰之岛的宝藏后，就朝着亚西亚岛跑去，途中碰到了火箭队，然后和火箭队一起，坐上了火箭队之前利用游艇做出来的自动救生艇，向着亚西亚岛的方向快速的前进着。
来到了亚西亚岛，小智和皮卡丘在河马王的带领下，来到了亚西亚岛的祭坛，把火之岛，雷之岛和冰之岛所获得的宝藏，按着顺序放在了祭坛上三个对应着火之岛，雷之岛和冰之岛的洞前，放置宝物的地方后，就是芙卢拉吹奏笛子的时候了。
芙卢拉来到了祭坛前，睡起了手中的笛子。三神鸟和洛奇亚听到了笛子的声音，攻击便停止了下来。小林也听到声音后，便让自己的三神鸟停下了攻击，并把它们收进了零度球，绝缘球和耐热球了。
所有的事情结束之后，小林看到小智他们庆祝的样子，独自一人向着岛外走去。来到岛外，小林放出了暴鲤龙，打算在谁都不知道的情况下离开亚西亚岛，可是小林却是失算了。“你打算一个人独自离开吗？”一个声音传了过来。小林头都没转过来就知道这个声音是谁。
“是啊，看他们很高兴的样子，就够了，我并不喜欢这么热闹的，你也一样把，要不然也不会来到这里，因为这里是最安静的地方了。是吧，洛奇亚。”小林对着那个声音说道。没错，喊住小林的人就是洛奇亚。
“你是一个与众不同的训练家啊，我从你身上感到了一股很强大的力量，这个力量不弱于我，我希望你能够好好的运用这股力量，不要让这个世界再次陷入了危难。”洛奇亚说道。
“力量什么的都无所谓，但是我可以打赢你，这个世界我很喜欢，我不会让这个世界被破坏的。”小林说道。
“呵呵，那我今后就跟着你把，为了监视你是不是真的会拯救这个世界。”洛奇亚说道。
“你的意思是，让我收服你吗？可是这样好吗？这里不是你守护的地方吗。”小林说道。
“没关系，语言说过这个地方会出现一次灾难，灾难过后就不会再有问题了。我也可以放心的离开这里了。”洛奇亚说道。
“那理由真的是要来监视我吗？”小林问道。“这么简单的敷衍，我可不会相信。”小林说道。
“呵呵，监视你根本就不需要，其实我想跟着你一起有三点，第一，你身上的力量能够让我的实力增加，第二，因为你也有神兽，所有收服我并不算是特别，第三，也是最重要的一点，你很对我口味。”洛奇亚说道。
“嗯，我知道了。那么，这是大师球，进不进随便你了。”小林拿出了大师球对洛奇亚说道。然后洛奇亚毫不犹豫的碰了小林手中的大师球后，就被收了进去。
然后小林放出了暴鲤龙，离开了亚西亚岛。