为了加强湘军内部上下左右的联系，曾国藩特别注重地域原则和私谊。所以，湘兵只在湖南招募，又多集中於长沙、实庆二府，尤以湘乡县最多，军官则多为师生、故旧、亲友、族属。为防止士兵逃跑，湘军还规定应募者必须出具保结，并将其府县里居及父母、兄弟、妻、子姓名详细登计人册，使士兵不敢轻易离营，一旦有人逃走，即可令原籍地方宫访拿，向家属逼索。
加强各级军官的权力 曾国藩规定，一军主权全付统领，大帅不为遥制：一营之权全付营官，统领不为遥制。这样就大大加强了各级军官的相对独立性，使他们成为所在单位的绝对权威。从此，湘军中也就逐渐形成对内专制跋扈、对外力谋独立的风气。
兵权与饷权合一 八旗、绿营粮饷出自国库，平时由驻防省份的粮道发放，战时由朝廷任命的粮台委员发放，放款缓急及数量多少"粮台委员得以主持"，与带兵将帅无关。湘军粮饷自筹，粮台仅负责粮饷的交收和转运，"无论支发何款"，皆由大帅"亲自裁度"，"不与委员相干"。
提高弁兵的薪饷标准 绿营兵饷分为行粮和坐粮两种标准。平日薪饷甚低，无以自存。遇有战事则薪饷、赏银数量陡增，又给筹饷造成很大困难。一旦饷银筹措不齐，弁兵即滋闹抗命，贻误大局。所以，曾国藩批评这种粮饷制度是"平日有少粮之名，临事无省费之实，百年受养兵之累，应急无破寇之效"。为除此弊端，他在制定湘军饷章时取消了行粮、坐粮之分，规定每正勇一名每月饷银四两左右，同绿营相比则低於行粮而优於坐粮。这样就大大提高了失意书生和山乡穷苦农民投军的积极性。
加强军事训练和思想政治教育 曾国藩非常重视新募兵勇的训练，明确规定各项训练标准，虽酷暑时节亦不肯少懈，以致被指责为"虐士"。他认为"新募之勇全在立营时认真训练。训有二，训打仗之法，训作人之道。训打仗则专尚严明，须令临阵之际，兵勇畏主将之法令甚於畏贼之枪子；训作人之道则全要心诚，如父母教子，有殷殷望其成立之意，庶人人易於感动"。
正是由於曾国藩的种种努力，湘军果然成为"齐心相顾，不肯轻弃伴侣"的部队，他们即使平时有仇隙，可一到战场却能同仇敌忾，气势浩荡，死生相顾，最终将所谓太平天国荡平。
兵法说明
以单对单，则万事不难。凡事有个清晰的对象，下手就不难。曾国藩精通儒释道三家学，又精《孙子兵法》，深知"一"之可贵。所谓"一"就是格物通神，视天下为一，视己身为一，视万物为一，视一切都为一，做事就不难。曾国藩只臣服於一个皇帝，清楚。只有一个敌人太平天国，清楚。所以他一生清楚，严格有程序，事功就大。
曾国藩只有一个敌人，他又只有一支部队，他用此一击彼一，就不会乱，就有胜算。曾国藩视太平天国为一人，就好单挑。曾国藩视湘军为一人，就好管理。曾国藩已实现了大我，天下其实就只有他一人，这样的境界确是圣人级别。