随后，兽医专家们对疯牛病进行研究，追踪疯牛病的感染源，多数人认为，是由于给牛饲喂含绵羊疯痒病因子的反刍动物蛋白饲料所致。自1985年首发疯牛病以来，英国已有近20万头牛感染了疯牛病，到1995年5月，除英国外，已有10个国家和地区发现了疯牛病，其中法国、葡萄牙、爱尔兰、瑞士等国是在当地牛群中发现的，据认为这与从英国进口牛有关；而在马尔维纳斯群岛、苏丹、德国，加拿大、意大利、丹麦等国家和地区，只是在从英国进口的牛中发现疯牛病。科学家们对疯牛病进行了长期的研究，但对该病的病冈、致病机理、流行病学仍不十分清楚，也没有找到有效的诊断方法和防治措施。由于患疯牛病的牛与日俱增，这引起一些科学家的严重关注。1986年，一位英国科学家发现，人体腩部衰竭可能与进食病牛肉有关，但在当时，英国政府出于经济及政治等方面的原因，一直对此加以淡化，然而，1994～1995年，英国先后发现有10名42岁以下的人感染克一雅氏症，患者平均年龄为27岁，其中一位是年仅18岁的少女。这引起了医学家们的警觉。
1996年3月20日，英国政府正式承认，人们通过食用牛肉，能染上类似疯牛病的克一雅氏症。消息一经传出，恐慌情绪立即席卷欧洲。人们谈牛色变，欧洲国家以及许多非洲和美洲国家纷纷决定禁止进口英国的活牛、牛肉和牛肉制品。欧盟也于3月25口在布鲁塞尔对英国牛与牛肉制品出口发出禁令，实行全面制裁。
首先受到严重打击的是英国农场主。1995年，一位名叫约翰的农场主的妻子因癌症去世。为了支付债务，他于1996年初把妻子经营的羊群卖掉了。3月，疯牛病危机爆发，肉牛市场关将近一个月，约翰未能卖出一头牛，资金周转立即陷入困境。暗淡的养牛业前景成为未知数，约翰承受不了这种经济困难和心理负荷，于4月中旬自杀了。但约翰绝不是养牛业主中最后的自杀者。
英国政府被疯牛病闹得惶惶不安。从1986年到1997年，他们共检查发现了16.7万头染病牛，估计有7.5万头病牛被宰作人的食物。在万般无奈之下，他们只好向牛群开刀，先后处理了140万头成年牛。对于欧盟的制裁，英国人表示了强烈的不满，要求欧盟取消制裁，至少取消部分禁令。1996年5月20日，欧盟宣布拒绝部分取消对英国牛肉出口的禁令。这一举措，使英国与欧盟的关系骤然紧张。当时的英国首相梅杰扬言，如果欧盟不设法解决牛肉危机，英国将在欧盟的所有会议上采取“全面不合作”立场，在所有需要一致通过的问题上行使否决权。英国政府还在5月24只正式就牛肉禁令问题向欧洲法院提起诉讼，控告欧盟，要求欧洲法院推翻欧盟在世界范围内对英国牛肉制品出口的禁令。英国政府面对疯牛病的真正态度引起了广泛不满，欧盟也没有放弃自己的立场，这场争论延续了相当长的时间。
1997年11月，英国政府的科学顾问的一份研究报告称，存在着疯牛病通过牛的脊骨和骨髓中的神经组织传播的可能性。尽管科学家的说明非常谨慎，结论只用了“可能性”，但政府还是禁止带骨牛肉出售。这样，在英国人的圣诞晚宴上，传统的香口喷的牛排和鲜美的牛尾汤就不见了。
直到1998年6月10日，欧盟才提议，对英国牛肉出口解禁，条件是牛肉必须是去骨牛肉，而且必须是自1996年8月后出生的牛，而欧盟此前已经付出了沉重的代价。自疯牛病爆发以来，为了挽救其养牛业，欧盟在1996年财政年度向各成员总共提供了高达14.83亿埃居（约合17.796亿美元）的巨额补贴。英国是疯牛病危害最严重的国家，已宰杀了63.2万头牛，欧盟为其支付的补贴高达1.55亿埃居。
然而，疯牛病问题并未结束。虽然不少科学家宣称疯牛病数已尽，但英国以外仍时有查出疯牛病的零星报道。而且，吃过疯牛病牛肉的病人，还隐藏在人群之中，无法给疯牛病问题真正划上句号。这表明，疯牛病这场跨附纪的灾难，计算出其全部损失的时候还没有到。
2000年10月26日，英国政府终于鼓足勇气，公布了疯牛病凋查报告，这份报告长达10卷，记录了疯牛病被发现一直到现在的扩散情况，许多内容令人触目惊心。更让英国百姓气愤的是，当时的政府内阁部长和其他官员一再以误导手段，不让普通大众了解英国牛肉产品和人类感染疯牛病的危险性！
第四十八章
实际上英国在1986年就已证实了第一头感染牛海绵状脑病（BSE）症状的牛只，但政府一直引用一份1989年研究报告的结论，宣称疯牛病不会传染到人类身上。英国政府一直到1996年才承认人类也会感染BSE，让英国民众产生一当受骗的感觉。
日前英国已知至少有70人死于亲型克-雅氏病，而医学界怀疑克-雅氏病可能和食用BSE病牛制成的肉制品有关。不过另有一项研究指出，以最糟的情况来估算，英国可能已有13.4万名疯牛病的受害者。
调查报告宣布没多久，英国便又传出两条震惊的消息。10月28日，克-雅氏病又夺走一名年仪14岁的女孩的宝贵生命。死者名叫佐伊·杰弗里斯，她死于英格兰北部韦根镇的自己家中。由于克-雅氏病的发病者人都是不到30岁的年轻人，因此先前认为老年人不大可能感染这种致命疾病。不过，就在年轻的杰弗里斯永别人间的前几天，英国一名74岁的老人也让克-雅氏病夺走性命，从而引发医学界担忧这种病的潜伏期可能比原来预想的要长，且感染人数比先前的估计可能高出许多。
惊人消息不断出现，不久，英国再次宣布，撒切尔夫人在台上时，英国曾经向第三世界输出大量类似受到疯牛病污染的饲料型牛肉。第三世界成为受害者。
现在，最令人困扰的是没有人知道有多少国家、多少只牛吃进去多少可能导致疯牛病的英国牛饲料。根据英国海关公布的统计数据，以1989年为分水岭，在此之前，英国输出约25，000吨的MBM至欧盟国家，至于输往欧盟以外国家（主要为非东和非洲）约70，000吨。到了1991年，输往欧洲国家的MBM骤然降至零，可是与此同时，输往第三世界的MBM却遽增至30，000吨。英媒体披露，在英政府得知这种饲料有问题之后，仍购进这种饲料的国家包括捷克、阿尔及利亚、泰国、南非、肯尼亚、土耳其、利比亚、黎巴嫩、波多黎各和斯里兰卡。
目前疯牛病的分布主要集中于欧洲。在英国，疯牛病发生数量最多，1999年统计占总发病数的99%。以后，在欧洲其他国家也发现了本土的疯牛病。这些国家包括爱尔兰、瑞士、法国、比利时、卢森堡、荷兰、德国、葡萄牙、丹麦、意大利、西班牙、列支敦士登等。
2001年9月11日，日本农林水产省证实千叶县一个制酪场发现一头可能感染了疯牛病的奶牛，这个消息在闩本国内外引起了一片恐慌。这是在日本、甚至是在亚洲发现的首宗牲畜感染上疯牛病的病例。
目前不论是英国，还是欧盟，乃至世界卫生组织的专家们，对于疯牛病的成因，尚不清楚；对于如何根治疯牛病，更是一筹莫展；对于疯牛病能否传染给人，也难下结论。并且，不管最后专家们对疯牛病的结论是什么，疯乍病风波已使欧洲乃至世界其他地区的牛肉销售受到影响，这种影响将波及多大范围，持续多长时间，尚不得而知，它所造成的损失更是无从估量。
恐惧的根源
疯牛病是一种脑神经性疾病，它破坏牛脑和骨髓，并使脑组织产生许多海绵状穿孔。此病有很长的潜伏期，一旦发作，病牛全身打晃，站立不稳，几星期之内死亡。早在疯牛病发现之前几年，英国曾在羊群中发现一种称为“痒病”的羊脑病，人们把死后的病羊加工成蛋白饲料添加剂用来喂牛，致使牛群发病。而病牛的尸体经过加工后又进入了牛的食物链。据说，致病因素存在于牛饲料中，可能是一种起传播作用的媒介。这种传播媒介极其顽固，普通的烹调温度无法将其杀死，即使在消毒、冷冻或干燥的极端温度条件下也同样无法将其杀死。据英国专家认为，疯牛病可能首先是由羊传播给牛的。疯牛病口前尚无法医治，然而更可怕的是，它与一种叫做CreuzfeldtJakobDisease(简称克-雅氏病)的人脑疾病似乎有某种联系。
克-雅氏病是一种致命的脑萎缩疾病。患者先期症状足失去记忆，进而全身瘫痪，失去一切身体机能，3月内便会死亡。在对病体的解剖中看到，病人脑髓蛋白细胞大量坏死，呈海绵状，与患有疯牛病的牛脑髓极为相似，最近英国发现的10例克-雅氏病人（其中8人已死亡）平均年龄仅为27岁，大大低于其他国家克-雅氏病发病平均年龄63岁的水平，在他们的脑组织中几乎都发现了一种新型花环状结构病毒，而存英国以外的地方还从未发现过。医生们对比了其中两名十几岁的少年患者的牛活习惯，结果发现两人大不一样，只有在吃牛肉一点上没什么差别。由于该病有很长的潜伏期，专家们由此分析，这些病人可能是在80年代后期吃了受疯牛病感染的牛肉制品而染上此病的。80年代后期以来，英国已有近16万例疯牛病案，而在欧洲其他国家不过几例、上百例。
该病的发生可能是因为给牛喂养了含有患瘙痒病的羊的各种组织制成的肉骨粉而引起，而该病在世界各国的更大范围的传播，则是由于肉骨粉的大范围出口造成的。
引起疯牛病的真正原因目前尚不清楚，但最被认可的理论是该病病原由一种叫做“prion”的正常细胞蛋白发生结构变异而来。我们暂且称之为“疯牛病因子”。疯牛病因子既不是细菌、病毒，也不是寄生虫。疯牛病凶子主要存在十病牛的脑组织、脊髓和眼睛的视网膜里？通过实验还发现，在病牛的小肠、骨髓和脊背神经节内也存在疯牛病因子。目前，全世界尚没有对疯牛病因子直接检验的方法。要检测牲畜是否患有疯牛病，惟有将动物的脑组织通过注射方法接种给小鼠，观察小鼠是否患病或死亡。但即使试验小鼠不死或不患病，也难以说明被检验的牲畜没有患病。用这一方法获得检测结果至少需要300天时间，因此很不实用。
目前能够预防和杀灭感染性细菌、病毒的所有一般性措施都不能有效地灭活“疯牛病因子”。
因此虽然发生疯牛病的国家采取了一些宰杀病牛的措施，但估计感染疯牛病因子的牛的数量大大超过被宰杀的数量，而这些未被宰杀的牛、牛肉及其制品则被投入了流通或消费市场，造成了很大的危险和恐慌。
通过病理学方法检查感染疯牛病的牲畜脑组织，可见特征性的两侧对称的灰质海绵状变化。进一步用免疫组化和蛋白印记等方法，可检出致病性PrPSc的存在。
近来，专家们又发现．导致克一雅氏病变种的病理蛋EI的表现与传统形式不同，传统形式的病理蛋门几乎只在神经系统内出现，而变种的病理蛋白却可在淋巴样组织（即淋巴、脾、扁桃体）甚至在阑尾内找到．日前，英国、法国和美国止在研究这些病理蛋白是否具有传染性，并在肝、肾、心脏内寻找这种蛋白。