叶三经过一番思考，最终还是让穆家政来负责情报工作，虽然这个工作在孤岛上还不是很重要。
叶三这次到辽东视察，成功地把一小部分西大营的官兵驻扎在了孤岛，建立了一块根据地和秘密的兵工厂。从京师出来不久，叶三就给京师的人写了三封信，一封给唐甜，让她管理好后宫，不要出现差池。一封给了杨秋迟，让他密切关注朝廷的动向，有官员稍有风吹草动，就就地拿下。还有一封给了内阁的王翱，让他协助黄启忠治理好军队，随时听候他的调遣，他要在辽东掀起滔天风浪。
西大营在孤岛上绝对不能再用西大营的番号，为了不引起女真人的注意，叶三给西大营另起了一个名称海盗。为了陪衬海盗出没，叶三还做了一面海盗旗，那是一面黑旗，上面两根白色交叉的大腿骨，托起一颗瘆人的骷髅头。够俗的吧，简直俗不可耐。
西大营的官兵满怀欣喜地仰望着他们的海盗旗，人人都知道他们从此就要在这面海盗军旗下奋战了。叶三站在远处观赏着自己的得意之作，海盗旗就如同他的士兵一样，他的胸中也被莫名的斗志充满：“这就是我的旗帜，一定要让女真人在这面海盗旗下闻风丧胆。”不过只有两千西大营精锐的叶三暂时也就是想想而已。
成化六年六月初，孤岛上的海盗第一次出动，就收割完了辽东半岛周边成熟的麦子。收割完了粮食，随着叶三一声令下，孤岛海盗军团终于要释放积聚了几个月的攻击能量，开始在辽东女真腹地，展开新一轮的战略反攻。
穆家政和谷有穗还真被叶三任命为把总，叶三在任命他二人时发火，主要还是因为嫡系部下企图质疑他的决定。如果就事论事，叶三也认为这两人的资历太浅，还有待考验，毕竟他们跟随自己的时间太短，部下还没有对他二人消化吸收。
此时在辽海千里海岸上，明军各督司都在竭力生产物资，扩充兵员。辽东经略经韩雍经过一番斟酌思量，认为经过这段时间的休养生息，辽东明军已经重新具有了进攻的能力，几次出击就迫使女真人放弃了很多堡垒。
“大人，韩军门又大举出兵了。”马文升意气风发地道。这一个多月来明军在一些小的战役上，连战连胜，让孤岛上的海盗士气大振：“大人，我们也应该出岛杀敌，夺取战功！”马文升极力主张海盗军团全体出动进攻复州，但是叶三对这种冒险的军事行动并不看好。辽东明军塘报上形势确实一片大好，估计歼敌数有一两万。不过叶三可没有这个信心，他知道塘报上有多少是虚假内容，不可足信。对辽东战况，虽然具体情况他不是很清楚，但他觉得这个数字用在给关内振奋人心还是不错的，可绝对不能作为军事情报依据。
叶三为此事召开了海盗军团紧急军事会议，把孤岛上当官的都找来商议，如果请战的呼声太过强烈，那么叶三也打算把海盗带上陆路，偷袭一下复州的女真小股部队来练练兵。
“韩军门大约有三万战兵，一个月就杀敌一两万，这似乎有点多。”军议上叶三表示了怀疑，一个月杀敌近两万的总战绩也忒牛B了：“平均每个士兵要杀三个女真骑兵，多了点吧？”
“大人，一天杀三人，这不算什么，属下一人一天就能杀七八个。”徐虎满不在乎地道。其他几个当官的都不说话，而是在各自揣摩叶三话中要表达的意思。
“军中杀敌举报十倍，外摄不臣，内按人心。”叶三并不希望被部下看做是很悲观的人，所以他说话非常小心：“也许韩经略也有这方面的考虑吧。”虽然叶三说得很委婉，但徐虎已经有些不满了：“女真蛮夷这次也损失惨重啊！大人，我们新建的海盗军团再不抓紧时间抢功，属下就没得抢了。”马文升终于也出来帮忙了，他觉得已经读懂了叶三的上意：“女真骑兵的兵力大约有三万，还有汉军旗和无甲兵，还是较我明军实力雄厚。”
叶三的本意想采取游击战，游击战一般是劣势方使用的战术，力量强大以后自然更倾向会战，所以经过几个月的整顿后，辽东明军纷纷开始转入反攻。但叶三担心辽东明军上下头脑发热，他太了解女真人的真正实力，历史告诉他女真人绝对不是什么好捏的软柿子。各部将官都有可能往自己的战绩里兑水，然后相互影响制造出攀比之风，造成整体军情和战功判断失误。
“岛上的新兵训练的如何了？”叶三不等徐虎再说话，就问起了马文升。马文升抱歉地看了一眼叶三：“回大人话，属下无能，我海盗军团可用新兵不足五百。”
“这不关你的事，是人力资源太少的缘故。”叶三大度地挥了一下手，这个答案他心里事先也有数：“兵器不足，这也是没有办法的事。”
“下官无能。”这次轮到李云亮谢罪了。虽然孤岛名义上让几个人分管，但是孤岛初建，岛上就两千多人，叶三有时也要事必躬亲。开垦土地，造船捕鱼，修建港口，搭建营房，等这些工作做完，能剩下用来制造军械和组织训练的时间就很少了。
这几个月以来，叶三总算开垦出六千亩耕地，并依照谷有穗的建议，全部种上芝麻，彻底压制住杂草。同时还制造出几百支枣木长矛，本来还想制造出一些弓箭的，可时间有限，而且工艺复杂，威力也小，最后还是放弃了。
“就目前的情况，我海盗军团无力出征。”叶三看着一脸失望的徐虎，毫不留情地否决了手下的议案：“进攻复州的提议，我不许可。”
不去复州送死不等于海盗们不进行任何军事行动。经过仔细侦查，叶三觉得出动几百名海盗还是没有问题的，现在关键的是作战必须要能保存自己，消灭敌人。
“我先说说作战目标。”叶三在海盗军团最新立下一项规矩就是做作战任务简报，务求使在坐的每一位将领都理解作战目的和粗略计划。所有将领都静静地期待着。叶三清了清嗓子：“本次出击，目标是一个村落，共有四十多户人家，海盗军团必须要把这个村落的村民一个不留，全部搬迁到孤岛上来，并掠走全部粮草、牲口、农具和家具。”好嘛，叶三堂堂大明太师，一人之下万人之上，竟要下令海盗打劫村落，还要施行三光政策，这也忒现眼了：“另外，出击的海盗，不准装备精良的武器，人手一支长矛，每两个新兵由西大营一个老兵带着。”
这次行动虽然海盗没有倾巢出动，但叶三非常重视：“我们要去的村落离海岸线二十里，距离复州五十里。先锋是徐千总，到达时间是晚上十点，其余海盗随后到达。”叶三没打算用模糊的傍晚、黄昏这种字眼来下达时间，而是用了近代的计时法，这样更准确。
“今夜完成行动，天明必须返回海岸，乘船回孤岛。现在海盗军团还没有侦查能力，所以一切都要严格按照计划行动。”叶三这次来辽东视察是坐船来的，连他自己的坐骑算上也只有十匹战马，所以陆地侦查能力十分低下。
“本次行动，虽然你们是海盗，但绝不允许伤害平民百姓，他们将是我们海盗军团的一部分，将来也是你们的部下。”说到这里，叶三狡猾地一笑：“这个当然不必事先和村民说明，如果有人害怕，你们要学会安抚，但不能说是命令，要让每个海盗都会说一句：我们不会伤害你们的。总之，要用海盗的名义进行安抚，但也不能让他们肆无忌惮，听明白了吗？”
“属下明白。”