1989年底，计算机病毒刚刚在国内出现，这引起了雷军极大的兴趣。为了解决学校机房染毒的问题，他和同学冯志宏合作开发出了《免疫90》，这是他写的第二款商业软件。当时的条件并不好，他们还没有自己的电脑，只好在外面的一家公司找了一台电脑轮流上机，分工合作开发程序。因为寒假自由时间比较充裕，就选择了在寒假进行开发。武汉的冬天特别冷，每天他们都从武大骑车到那个公司去上机，风雪无阻，脚也生了冻疮。放假时食堂吃饭不方便，他们就经常自己动手煮波纹面，直到几年后雷军还在提"冯志宏煮的波纹面很好吃"。
《免疫90》售价260元一套，上市后在武汉和很快就卖出了几十套，雷军和冯志宏每人赚了好几千元。此后，在老师的推荐下，《免疫90》还获得了湖北省大学生科技成果一等奖。在这期间，他在《计算机世界》等刊物上发了很多篇关于病毒的文章，成了当时小有名气的"反病毒专家"；同时，还在学术刊物《计算机研究与发展》上发表一篇学术论文，入选第一届青年计算机大会论文集。当时，湖北省公安厅还专门请雷军讲课，讲反病毒技术。
此后，雷军还先后与人合作开发过共享软件RI（RAMinit，清内存的小工具）、自然码、电脑加密等软件，靠着这些极具技术含量的软件，大三时，雷军就成了同学中的百万富翁。在电脑程序的意气飞扬中，他也曾梦想成为中国最高级的电脑程序员。
如同比尔·盖茨当年会选择辍学创业一样，雷军也曾经历过这样的彷徨。他在图书馆看了一本《硅谷之火》，深深被乔布斯的故事吸引。八十年代是乔布斯的年代，他是全世界的IT英雄，当年的影响力绝不亚于今天的比尔·盖茨。九十年代初，连盖茨都说，他只不过是乔布斯第二而已。在电子一条街打拼一段时间后，雷军梦想写一套软件运行在全世界每台电脑上，梦想办一家全世界最牛的软件公司。
那是大三那年的暑假，王全国有个同事和他的一个朋友想办家公司，想拉雷军和王全国入伙。雷军和王全国主要负责技术和服务，股份四个人平分。自信满满中，四个年轻人几乎是一拍即合，租下了武大附近珞瑜饭店103房间作为办公室，什么赚钱就做什么，没什么套路。每天忙得热火朝天，白天跑市场销售，晚上回来做开发。
公司取名为"三色Sunsir"，希望红黄蓝三原色创造七彩的新世界，放飞创业的梦想。四个人都没有什么钱，也没有找人投资，最后还是雷军帮公司拿了第一张单子赚了几千元，才开始正式启动了。
很快，他们找了一个方向--做仿制汉卡。结果没过多久，他们仿制汉卡的技术就被人盗用了，对方一次做的量比他们大，价格比他们便宜，这一技术只好流产。
此后，他们先后接过组装电脑、打字印刷的活。但实际上，账上基本没什么钱，连吃饭都成了问题。四个股份相同的年轻人，在为谁做董事长的问题上一直争论不休，为此，雷军多次被他们从武大的教室里喊出来开会。高涨的热情一天天被残酷的现实消磨，他开始思考一个问题：作为一个大四的学生，我是否具备创业所需要的能力？琢磨了好几个晚上后，他提出散伙。
分得一台286、一台打印机和一堆芯片，结束了最初的创业，虽然前后只有半年多，但雷军却感觉有一个世纪那么漫长。经过创业的艰难，回到学校，他心里轻松极了，一个人走在武大的樱花路上，觉得阳光灿烂。