新生儿出生后1～2天内排出的大便为褐绿色的黏稠糊状物，内含有胎毛，主要由衰老的红细胞、浓缩的消化液、脱落的上皮细胞、吞咽的羊水和脂肪等组成，称为“胎便”。开始哺乳后，大便即渐渐变成黄色或黄绿色，若出现黑便或柏油样便，则说明有消化道出血。原因是新生儿体内缺乏维生素K及其他凝血因子所引起。消化道出血除了便血外，还可出现呕血。若失血过多，孩子出现精神不振、面色苍白、全身出冷汗，严重者威胁孩子生命。
治疗新生儿消化道出血，可暂停喂奶，保持孩子安静，并立即送医院治疗。为了预防新生儿自然出血，可在产前由孕妇口服维生素K，难产、早产或有消化道畸形的新生儿，产后要注射维生素K。
新生儿大便异常的另一种情况是便秘。原因是肠肌松弛，肠肌弹力发育不佳及结肠的反应性不足，肠蠕动减少。
处理方法是：将肥皂削成铅笔头一样粗，长1寸左右，蘸水后轻轻塞入孩子肛门，1～2分钟后，肥皂头与大便一同排出。
此外，大便异常还可见到腹泻。原因是喂奶不当，如吃奶不定时，护理不好，孩子受凉，或受热，或人工喂养的奶粉成分太浓，皆可引起腹泻。发生腹泻时，应根据原因给予及时处理。