与此同时，冈崎特别行动小分队迂回占领了南京对岸的浦口，第十六师团攻占了紫金山和中央门，第一一四师团攻占了通济门和光华门，南京的防卫崩溃了，守卫南京的十余万中国军队陷入一片混乱之中。
12月12日晚，南京守备司令唐生智在第三十六师的护卫下突围渡江而去，第六十六军和第八十三军两部分别从紫金山和栖霞山突围成功，其余的部队群龙无首，一起涌向挹江门，企图夺船逃跑，挹江门内挤满了部队，相互争夺，秩序一片混乱。
负责守卫挹江门的第三十六师一个团因阻止败兵通过，双方发生冲突，一时枪炮齐鸣，血肉横飞，被打死和落入长江溺死的不计其数，伤员无人照顾，丢弃路边任其哀号，惨不忍睹……
12月13日，日军大部队进城，南京陷落。
最先攻入南京的（日寇）第六师团将总部设在夫子庙的贡院街，原南京宪兵司令部。13日下午，谷寿夫师团长在总部召开联队长一级军官会议，便布置下一步任务。
这时南京虽然已被占领，但困在城内来不及逃走的中国军队还有数万之众，他们中的大多数人尚未放下武器，仍是一支具有威胁性的力量，尽快将他们肃清，是日军的当务之急。于是谷寿夫下令，各联队除抽出一部分兵力作区域防卫之外，其余的以小队为单位出动搜索。对于中国败兵，投降的暂且送到莫愁湖公园，不投降的格杀勿论！现在各师团正展开竞赛，看谁抓的俘虏多。第六师团自从在杭州湾登陆以来，冲锋陷阵战功显赫，在这次竞赛中也决不能落后（多年以后得知，日寇便以此拉开了南京大屠杀的序幕)！
参加会议的高田联队长回到队部是，传达了师团长的命令后，各搜索小队立即出动。隆冬季节，夜来得早，还不到六点钟，天色就暗了下来。岛田渡边带领他的小队从队部所在地朝天宫出发，沿评事街朝新街口方向搜索前进。
走不多远，就看见一群中国士兵从一条小巷里窜了出来，双方迎面相遇，由于师团长已经下达了格杀勿论的命令，所以日军士兵不等岛田渡边下令，就各自抢占有利地形，向对方猛烈开火。
从人数上讲，中国士兵要多得多，假如他们奋起反击的话，岛田渡边他们的处境很危险。但中国士兵已经丧失了斗志，略加抵抗后就竖起了白旗。他们是八十八师的一部，据他们说，八十八师滞留在南京城里的散兵至少还有好几千。
岛田渡边吩咐捆住他们的双手，然后派出六名士兵把他们押送到莫愁湖公园去，他自己则带着其余的士兵继续搜索。
这天夜里，岛田渡边的小队先后共抓住了二三百名中国散兵，大部分是八十八师的，也有一些是五十一师和教导总队的。这些人全都被押送到了莫愁湖公园。加上其他搜索队抓到的俘虏，莫愁湖公园里总共关押着六七千余名中国士兵。
12月14日凌晨，谷寿夫师团长来到了莫愁湖公园。他召集部份联队长开了一个短会，随即命令这些俘虏排成四路纵队，每二十五排编成一个长方队形，说要将他们转移到紫金山下的战俘营去。为了防止暴动，用浸过水的麻绳将他们绑在一起。殊不知，他们将走向死亡之路……
负责押送的高田联队长驱赶着他们离开莫愁湖公园，过了秦淮河上的石城桥，沿着汉中门外的城墙朝北走。岛田渡边觉得奇怪，加快脚步追上。
高田血红的眼睛里隐隐露出一丝杀机，说：“没错，就是这儿。”
岛田渡边给弄糊涂了，争辩道：“紫金山在东面，可我们是在朝北走呀！”
高田朝身后的队伍冷冷地扫了一眼，便阴沉着刀疤脸说：“别多嘴，看管好俘虏，明白了吗？”
岛田渡边不敢再讲下去了，心里充满着一种不祥的预感。队伍又向前走了一段路，在西芦柴厂附近停了下来。岛田渡边发现，这儿已经排好几十挺重机枪，枪口正对着俘虏的队伍。他恍然大悟，所谓把俘虏送到战俘营去只是一个幌子，实际上是要把他们骗到这里，全部就地解决掉！
此刻俘虏们也已明白，这儿就是他们的葬身之地，顺从的队伍开始骚动起来，俘虏们狂喊大叫，拚命挣扎，可他们的双手已经紧紧捆住，再挣扎也是徒劳的了。黑暗中，他们绝望的叫声令人心悸。
忽然，几十挺机关枪“咯咯”地吼叫起来，子弹拖着长长的火舌无情地扑向俘虏的队伍，俘虏们成堆成堆地栽倒下去，喊叫声越来越微弱。
机枪不停地扫射了二十多分钟，直到俘虏全部倒下去为止。六七千人的尸体横躺在地上，黑压压的一片，景象异常凄惨……
岛田渡边呆住了，他简直不敢相信自己的眼睛，刚才还是那样一支庞大的队伍，转眼间就全部变成了死尸，太可怕了！
冈野鹤吉一路小跑走到高田联队长身边，便自告奋勇地说：“那些俘虏中肯定还有没有死的，我带人去检查一下吧。”
高田联队长冷酷地摆了摆手，道：“用不着，早就安排好了。”
这时，有人滚过来几只汽油桶，把汽油浇在尸体上，然后划着了火柴。“轰隆”一声，汽油燃烧起来，很快变成了一场熊熊大火，烧得尸体“噼啪”作响。从尸体中还传出凄厉的叫声，那是没被子弹打死的俘虏发出最后的哀号。
这场火葬进行了一个多小时，烧焦的尸体横七竖八地堆在城墙边，散发出令人作呕的气味，尸体的灰烬随着大风漫天飞扬……