组织的事情已经过去了很久，在这段时间里兰已经成功升格进入高三生活了。可是灰原仍旧没有研制出可以让他们长时间恢复身体的解药，柯南和灰原继续着他们小学生的日子。虽然他的身份已经被许多人掌握，但还是没有公之于众。要不然，柯南一定成为标本一般的存在。由于BOSS毕竟还没有被发现，所以FBI还是有向柯南提出证人保护计划，被柯南拒绝。柯南也并没有在侦探事务所生活了，他回到了自己的家中。昴先生也没有回FBI，由于组织的事情，他的任务还没有解决。
土曜日 AM10:05
兰早早来到新一家门口，按了好几次铃最后还是昴先生回复了他。“请问哪位？”
“昴先生，是我，小兰。”
“啊，小兰，你是来找柯南的吧，他现在在阿笠博士家。”
“好的，我知道了，谢谢你。”
兰径直向博士家走去。
阿笠博士宅：
兰刚刚走进博士家，却没有在客厅发现任何人。这个时候她听到了地下室传来柯南和小哀的声音，兰走近地下室门口，正打算开门却······
“工藤，可能你永远无法恢复原来的身体。”
“灰原，没事的，你尽力就好。”
“我只是不希望兰这样一直等下去。”
柯南沉默了。“我想虽然现在还是很难以这样的身体和她一起，但是只要给我们一些时间。”
“你是说，等到你18岁，可是兰···”
“或许这样吧，而且我相信兰会等我。不过，我也没有想过会等待多久，因为你一定可以做得出来。”
“将你的终身大事交给我，这样我的压力不小哦。”
“嘿嘿，你少来了。”
“对了，你还记得上次我们和组织在酒店的那次对决吗？”
“你是说恢复身体的那次？”（参见名侦探柯南真人版2《复活的名侦探》）
“那家饭店的蛋糕当时由于加了过多的糖分导致我们的身体在短时间恢复了原状，我想还是要找一找那家饭店的蛋糕的成分才行。”
“这样啊，那咱们今天就去吧。”
“话说回来，那个叫昴的人到底是谁？”
“他是FBI的人，你不要担心。”
“可是，我对他仍旧有熟悉的感觉。而且，自从组织的残余被消灭后，他给我带来的压力还是不小。”
“没事的，没事的，我掌握着百分百可信的情报他绝对和组织是敌对的。”
“那么，那个叫安室的呢？虽然知道他是公安的人，但是为什么还在波阿罗打工没有回去？”
“可能他们认为任务还没有结束吧，我也好久没和安室联系了。”
兰没有继续再听下去，她静静关上了门，离开了博士家。
从这次事情之后，小兰没有主动找过柯南，而这个情商为零的木头自然没有察觉到兰的心情发生了什么变化。
金曜日阿笠博士宅：
“工藤，按照上次找到的成分我已经有了初步的方案，只要再过不久的时间就可以有突破了。”
“真的，太好了。”
灰原看到柯南开心的表情，很是动情。‘这样，你就可以和她在一起了吧’
“灰原，你刚才说什么？”
“啊，没什么。”灰原立刻恢复状态。“对了，你是不是应该和小兰说说，分享一下这个消息，给她些你们感情的动力。”
“对哦，经你这么一说我已经好久没和兰联系了。”
灰原没有多想，仍旧看着电脑屏幕。“这没什么吧，毕竟她现在在高三，有点忙碌。”
“嗯，所以半个多月而已。”
灰原缓缓转过身，“你刚才说多久没有联系？”
柯南感觉到阵阵阴风：“半···半个多月啊。”
灰原的眼神立刻凶狠起来：“你这个白痴！！！！！”
话音未落，柯南就被扔出了地下室。刚刚走到门口倒了一杯咖啡的博士，就这样被突然打开的门推到了门后。柯南还在客厅的地上躺着，灰原惺惺地走了过来。
“我说你啊，是不是白痴啊。半个月没有和她联系，她的性格你还不了解吗？她一直是很粘你的，经常过来找你，这么久没有联系就说明她对你的事情有了些许疑虑和担心。你居然也没有主动联系她！现在，放下你的所有事情，给她打电话！”
“是···是~~~~”柯南立刻妥协。
灰原回到了地下室，关上了门，门后的博士眼镜都被打碎了。人还紧紧贴在墙壁上。“我说新一啊，你到底是···”
柯南没有回复博士，他挣扎着站了起来，摸了摸流血的鼻子。“白色的。”
刚刚说完，地下室里一阵动荡，立刻一把椅子又飞了出来，刚刚恢复过来的博士再次被门打到。椅子也正中柯南。在柯南倒下的不久，只听到地下室传来淡淡的抱怨声：“色狼！！！”
当晚，柯南就给兰打了电话，可是兰一直没有接听。柯南这才将灰原的话好好想了一下，意识到一定发生了什么。
第二天就是双休日了，柯南没有和侦探团一起出去玩，而是去了毛利侦探事务所。
毛利侦探事务所：
刚刚走进去，柯南就看到盯着电视目不转睛的毛利。
“你这臭小子，来侦探事务所干嘛？”
“啊，大叔。”虽然柯南了解大叔知道自己的身份，但是以柯南的姿态新一的口吻和小五郎说话还是很奇怪的感觉。
“想要找小兰的话，她现在在楼上哦。”
“哦。”柯南停了一会儿。毛利注意到柯南的迟疑。
“怎么了臭小子？”
“叔叔，最近兰的心情是不是不好？”
“好像是有点儿吧，我最近喝啤酒她都不怎么唠叨了。”
‘我不是想问这些···’
“怎么？你欺负小兰了是不是？！”虽然这个大叔很烦小兰的唠叨，但一旦有人伤害他的宝贝女儿，他就立刻严肃起来。
“没有啦，没有啦。”
“嗯，那就好，赶快去吧，别打扰我看洋子的演出。”
“······”
柯南走进了三楼的房间。虽然生活的时间不是很久，但柯南看到了这些还是有点怀念，但他很清楚现在不是做这些的时候。他在小兰的房间停下，顿了顿，敲了敲门。但却没有回复。柯南也没有叫出声来，静静打开门。小兰正面对着窗户坐在床边。
“兰。”
小兰还是没有回复他。
不知怎么回事，柯南也没有继续说下去，两个人就这样安静的保持着。
“新一。”
“你是新一吧，我认识的新一？”
“当然了。”
“可是，我似乎不认识你了。”